More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13210  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 
276 aa  525  1e-148  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3278  ABC-3 protein  65.31 
 
 
291 aa  344  8e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3166  ABC-3 protein  66.67 
 
 
314 aa  332  3e-90  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.163025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1390  ABC-3 protein  66.06 
 
 
295 aa  313  2.9999999999999996e-84  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  decreased coverage  0.0078855  normal  0.217794 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2143  ABC-3 protein  66.16 
 
 
304 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1661  putative ABC transporter membrane protein  62.26 
 
 
303 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.726587  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3369  ABC-3 protein  66.79 
 
 
289 aa  300  2e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.182815 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3260  ABC-3 protein  55.64 
 
 
294 aa  281  9e-75  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00406808  normal  0.279428 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4437  ABC-3 protein  66.04 
 
 
294 aa  276  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346734  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31310  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  64.91 
 
 
291 aa  268  5e-71  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0280  ABC-3 protein  51.36 
 
 
278 aa  266  4e-70  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0347715  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18711  ABC transporter  55 
 
 
289 aa  265  8e-70  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.24081 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1013  ABC transporter  53.82 
 
 
291 aa  262  4e-69  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.134252  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06291  ABC transporter  49.81 
 
 
290 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06591  ABC transporter  49.42 
 
 
290 aa  257  1e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.591644  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1485  ABC transporter  53.05 
 
 
274 aa  256  3e-67  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.122101  normal  0.297655 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0039  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system permease components  50.19 
 
 
290 aa  254  1.0000000000000001e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10471  ABC transporter  50.96 
 
 
289 aa  252  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.246572  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06591  ABC transporter  50.19 
 
 
290 aa  251  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  46.74 
 
 
285 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  46.01 
 
 
285 aa  246  2e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  46.91 
 
 
286 aa  246  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0603  ABC transporter  50 
 
 
291 aa  241  7e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1113  ABC-3 protein  44.4 
 
 
285 aa  241  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06681  ABC transporter  48.64 
 
 
290 aa  240  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.715303  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  44.53 
 
 
297 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3405  hypothetical protein  48.51 
 
 
285 aa  236  2e-61  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.555758 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  44.53 
 
 
297 aa  237  2e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  44.53 
 
 
297 aa  237  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1610  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  44.27 
 
 
285 aa  236  3e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000189097  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2131  ABC-3 protein  45.95 
 
 
286 aa  236  4e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.241388 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3172  iron/manganese transport system inner membrane protein SitC  44.66 
 
 
285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.768792 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2209  ABC-3 protein  45.95 
 
 
287 aa  235  6e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0138791  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0082  iron/manganese transport system membrane protein SitC  44.79 
 
 
285 aa  235  6e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000869047 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1657  ABC-3 metal transporter  45.82 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.917643  hitchhiker  0.00082794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1703  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeC  44.33 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1813  ABC-3 protein  44.33 
 
 
294 aa  234  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00569074  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0326  chelated iron ABC transporter, permease  45.49 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0155604  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1917  ABC-3 protein  44.79 
 
 
287 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0159377  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3454  ABC-3 protein  44.4 
 
 
286 aa  232  5e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2985  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.6 
 
 
286 aa  231  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2603  ABC-3 protein  45.82 
 
 
275 aa  231  1e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3068  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.6 
 
 
286 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0291612  normal  0.062215 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3016  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.6 
 
 
286 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.110863 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3173  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.6 
 
 
286 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.304498  normal  0.876834 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3052  chelated iron transport system membrane protein YfeC  41.6 
 
 
286 aa  230  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0185666 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2632  chelated iron transport system membrane protein  43.97 
 
 
294 aa  231  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.23136  normal  0.707377 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3701  ABC-3 protein  44.89 
 
 
282 aa  230  1e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2602  ABC-3 protein  43.75 
 
 
285 aa  229  3e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3455  ABC-3 protein  46.72 
 
 
281 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2916  ABC-3 protein  42.86 
 
 
285 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3404  hypothetical protein  44.44 
 
 
291 aa  224  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0299  ABC-3 protein  58.89 
 
 
299 aa  222  4e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0103187  normal  0.0511168 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3700  ABC-3 protein  41.86 
 
 
286 aa  221  9e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0325  chelated iron ABC transporter, permease  42.31 
 
 
280 aa  220  1.9999999999999999e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.057736  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2986  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45.42 
 
 
282 aa  219  3e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.767865  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3017  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45.05 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0681936 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3069  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45.05 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0739346  normal  0.0445637 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3174  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45.05 
 
 
282 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.559168 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3053  chelated iron transport system membrane protein YfeD  45.05 
 
 
282 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0343678 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2917  ABC-3 protein  46.21 
 
 
285 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1205  ABC-3 protein  42.47 
 
 
294 aa  217  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.601071  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  40.78 
 
 
286 aa  216  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1656  ABC-3 metal transporter  43.28 
 
 
283 aa  214  9.999999999999999e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.764054  hitchhiker  0.000770166 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1204  ABC-3 protein  50.81 
 
 
279 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604109  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1114  ABC-3 protein  41.03 
 
 
279 aa  212  5.999999999999999e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0247  ABC-3 protein  42.47 
 
 
286 aa  211  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2892  ABC-3 transporter component  45.49 
 
 
285 aa  209  6e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1043  ABC-3 protein  47.1 
 
 
312 aa  207  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.151088 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1257  ABC-3 protein  41.94 
 
 
286 aa  207  2e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227548  normal 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  39.65 
 
 
288 aa  205  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0906  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitC  41.7 
 
 
286 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2565  ABC-3 protein  41.7 
 
 
286 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.601761  normal  0.950378 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2174  ABC-3 protein  45.38 
 
 
306 aa  204  1e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  39.65 
 
 
288 aa  204  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1256  ABC-3 protein  46.35 
 
 
276 aa  203  2e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.829859  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1309  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeC  40.3 
 
 
285 aa  203  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0081  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41.09 
 
 
285 aa  203  3e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000241548 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1609  chelated iron transport system membrane protein yfeD  41.2 
 
 
285 aa  201  8e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000716854  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3173  iron/manganese transport system membrane protein SitD  41.95 
 
 
292 aa  201  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.568533  normal  0.636939 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0726  AfeD  41.73 
 
 
271 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  40.78 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  40.78 
 
 
288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  36.13 
 
 
278 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  36.13 
 
 
278 aa  195  7e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1308  iron chelate ABC transporter, permease protein AfeD  41.16 
 
 
301 aa  194  1e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0952  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport systems, permease component  40.32 
 
 
280 aa  193  2e-48  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.139683  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1439  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  36.16 
 
 
279 aa  193  3e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.315206  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3635  ABC-3 protein  39.3 
 
 
288 aa  192  6e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  38.43 
 
 
280 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2804  ABC-3 protein  40.38 
 
 
289 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2066  ABC-3 protein  43.88 
 
 
304 aa  190  2e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  38.43 
 
 
281 aa  186  4e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0246  ABC-3 protein  46.18 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0908  ABC Mn+2/Fe+2 transporter, inner membrane subunit SitD  45.78 
 
 
282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.457468  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  37.97 
 
 
300 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2566  ABC-3 protein  45.78 
 
 
282 aa  183  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.774032  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1531  manganese ABC transporter, permease protein  37.31 
 
 
277 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0231944  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2382  ABC-3 protein  41.83 
 
 
280 aa  181  1e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.376168  normal  0.01145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0918  ABC-3 protein  39.23 
 
 
278 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0960733  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>