266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12620 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12620  adenosine deaminase  100 
 
 
342 aa  691    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.341302 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1580  adenosine deaminase  68.04 
 
 
344 aa  486  1e-136  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0809  adenosine deaminase  57.53 
 
 
338 aa  419  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2140  Adenosine deaminase  59.15 
 
 
333 aa  409  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.291028 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03345  Adenosine deaminase  50.9 
 
 
337 aa  372  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2390  adenosine deaminase  47.59 
 
 
346 aa  362  6e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2009  adenosine deaminase  51.06 
 
 
341 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0350723  normal  0.0124667 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3021  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.850327  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2976  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  319  5e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0648  adenosine deaminase  52.71 
 
 
343 aa  318  9e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0461  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.411498  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2607  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.580496  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0979  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0168  adenosine deaminase  49.7 
 
 
341 aa  318  1e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2916  adenosine deaminase  49.41 
 
 
341 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1040  adenosine deaminase  49.54 
 
 
346 aa  316  4e-85  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1001  adenosine deaminase  47.97 
 
 
349 aa  315  5e-85  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1612  adenosine deaminase  50 
 
 
341 aa  315  8e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2399  adenosine deaminase  47.52 
 
 
355 aa  313  1.9999999999999998e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0816  adenosine deaminase  50.76 
 
 
339 aa  313  2.9999999999999996e-84  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.819671  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0895  adenosine deaminase  49.41 
 
 
341 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326355  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0282  adenosine deaminase  47.38 
 
 
328 aa  311  9e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0883  adenosine deaminase  49.41 
 
 
341 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0978  adenosine deaminase  49.12 
 
 
341 aa  311  1e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0964411 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1925  adenosine deaminase  49.41 
 
 
345 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.10145  normal  0.0739212 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0947  adenosine deaminase  49.24 
 
 
350 aa  310  2e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.387168 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0541  adenosine deaminase  49.12 
 
 
682 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.54598  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1020  adenosine deaminase  49.12 
 
 
682 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.916957  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3044  adenosine deaminase  49.24 
 
 
350 aa  310  2e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00967861  normal  0.0350825 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06421  adenosine deaminase  46.67 
 
 
335 aa  310  2e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2249  adenosine deaminase  50.31 
 
 
345 aa  309  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4131  adenosine deaminase  48.82 
 
 
341 aa  308  8e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1487  adenosine deaminase  47.25 
 
 
360 aa  308  8e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.51175 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2144  adenosine deaminase  47.52 
 
 
349 aa  308  9e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.455932  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3887  adenosine deaminase  48.63 
 
 
365 aa  307  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.27836  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1370  adenosine deaminase  48.78 
 
 
335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.948473  normal  0.588673 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2098  adenosine deaminase  48.54 
 
 
345 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.432045 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0710  adenosine deaminase  48.62 
 
 
346 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.256846  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000592  adenosine deaminase  46.85 
 
 
337 aa  306  3e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0024296  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1236  adenosine deaminase  49.4 
 
 
338 aa  306  3e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0317068  normal  0.0334679 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0809  adenosine deaminase  48.97 
 
 
357 aa  306  3e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.429813  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1083  adenosine deaminase  46.78 
 
 
350 aa  304  2.0000000000000002e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.906329  normal  0.364654 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2715  adenosine deaminase  46.08 
 
 
339 aa  303  3.0000000000000004e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2376  adenosine deaminase  48.52 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.534573  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0890  adenosine deaminase  48.94 
 
 
354 aa  302  5.000000000000001e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00447351  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1916  adenosine deaminase  46.55 
 
 
361 aa  301  8.000000000000001e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2442  adenosine deaminase  47.37 
 
 
350 aa  301  1e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1138  adenosine deaminase  48.96 
 
 
375 aa  301  1e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0503551  normal  0.110025 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0692  adenosine deaminase  47.78 
 
 
335 aa  299  4e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0456  adenosine deaminase  43.2 
 
 
332 aa  298  8e-80  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1359  adenosine deaminase  48.04 
 
 
336 aa  296  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2485  adenosine deaminase  47.88 
 
 
339 aa  295  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1922  adenosine deaminase  45.68 
 
 
335 aa  293  2e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0127981  normal  0.868909 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3297  adenosine deaminase  47.54 
 
 
345 aa  292  4e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.184449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2428  adenosine deaminase  47.43 
 
 
351 aa  291  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253507  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4572  adenosine deaminase  47.3 
 
 
315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000497344  hitchhiker  0.0072134 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22300  adenosine deaminase  49.2 
 
 
315 aa  289  6e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0661  adenosine deaminase  48.73 
 
 
317 aa  288  8e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3706  adenosine deaminase  48.4 
 
 
315 aa  287  1e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2420  adenosine deaminase  45.88 
 
 
338 aa  286  2.9999999999999996e-76  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.285507  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1969  adenosine deaminase  48.36 
 
 
329 aa  286  4e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000161701  unclonable  0.0000000410528 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0766  adenosine deaminase  47.87 
 
 
334 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3742  adenosine deaminase  46.36 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01830  adenosine deaminase  48.42 
 
 
316 aa  285  7e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.40459  normal  0.775613 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1524  adenosine deaminase  44.61 
 
 
341 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0004  putative adenosine deaminase  41.69 
 
 
330 aa  283  2.0000000000000002e-75  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0636  adenosine deaminase  47.62 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.839693  hitchhiker  0.0000731257 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0591  adenosine deaminase  47.62 
 
 
315 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.904203  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0671  adenosine deaminase  47.47 
 
 
317 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0631  adenosine deaminase  47.62 
 
 
318 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000218139  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0226  adenosine deaminase  48.1 
 
 
316 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0757  adenosine deaminase  47.78 
 
 
317 aa  280  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1745  adenosine deaminase  42.73 
 
 
335 aa  281  2e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0569532  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4345  adenosine deaminase  45.32 
 
 
341 aa  274  2.0000000000000002e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0281  adenosine deaminase  41.44 
 
 
338 aa  271  1e-71  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1983  adenosine deaminase  45.97 
 
 
341 aa  269  4e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0868  adenosine deaminase  43.77 
 
 
343 aa  269  5e-71  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02509  adenosine deaminase  42.94 
 
 
336 aa  267  2e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0990384  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1432  adenosine deaminase  49.07 
 
 
328 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.406795 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0907  adenosine deaminase  47.24 
 
 
378 aa  262  4.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4351  Adenosine deaminase  48.93 
 
 
318 aa  255  1.0000000000000001e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0101707  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4230  adenosine deaminase  40.12 
 
 
343 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0844649  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3185  adenosine deaminase  41.19 
 
 
341 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.175868  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1623  adenosine deaminase  39.52 
 
 
348 aa  249  5e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000946947  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0916  adenosine deaminase  41.32 
 
 
347 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0773  adenosine deaminase  41.32 
 
 
347 aa  248  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0997  adenosine deaminase  43.83 
 
 
353 aa  247  2e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0123518 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06078  Adenosine deaminase (EC 3.5.4.4)(Adenosine aminohydrolase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q8X1T6]  37.13 
 
 
364 aa  219  6e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.140027  normal 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59156  adenine aminohydrolase (adenine deaminase)  38.14 
 
 
355 aa  218  2e-55  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0307453 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3173  adenosine deaminase  35.06 
 
 
337 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.523168  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl215  adenosine deaminase  32.13 
 
 
334 aa  186  5e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6098  adenosine deaminase  37.19 
 
 
368 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0272536 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0631  adenosine deaminase  28.53 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0615  adenosine deaminase  28.22 
 
 
326 aa  162  1e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0633  adenosine deaminase  32.75 
 
 
343 aa  157  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.410378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1779  adenosine deaminase  32.84 
 
 
340 aa  157  3e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.569092  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1597  adenosine deaminase  34.48 
 
 
327 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.750282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7773  adenosine deaminase  33.23 
 
 
337 aa  152  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0250  adenosine deaminase  34.48 
 
 
327 aa  151  1e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0830  adenosine deaminase  34.69 
 
 
331 aa  152  1e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0945663  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>