81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_12180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_12180  acetyltransferase (GNAT) family protein  100 
 
 
170 aa  340  5e-93  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3522  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
191 aa  86.7  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.77056  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2097  hypothetical protein  34.73 
 
 
200 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.126268  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1052  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
194 aa  85.1  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.650543  normal  0.143209 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4522  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 
229 aa  73.2  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3133  acetyltransferase  28.38 
 
 
170 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3135  acetyltransferase, GNAT family  27.04 
 
 
171 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.307685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2864  acetyltransferase  27.52 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3115  acetyltransferase, GNAT family  27.03 
 
 
170 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2136  acetyltransferase, GNAT family  27.34 
 
 
171 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3112  acetyltransferase  27.03 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2895  acetyltransferase  27.03 
 
 
170 aa  68.9  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.425529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2822  acetyltransferase  27.11 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5784  GCN5-related N-acetyltransferase  30.28 
 
 
175 aa  68.6  0.00000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3101  acetyltransferase, GNAT family  25.33 
 
 
171 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2666  GCN5-related N-acetyltransferase  35 
 
 
164 aa  62.4  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0928  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 
162 aa  57.8  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.477111  normal  0.744575 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1619  acetyltransferase  22.9 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.20588  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1363  acetyltransferase  22.9 
 
 
167 aa  56.2  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.014486  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1285  GCN5-related N-acetyltransferase  25.83 
 
 
168 aa  55.5  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0013  acetyltransferase  22.92 
 
 
176 aa  55.5  0.0000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0152  hypothetical protein  31.94 
 
 
166 aa  55.1  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1885  acetyltransferase  22.92 
 
 
176 aa  55.1  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2093  acetyltransferase  21.71 
 
 
176 aa  55.1  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4723  GCN5-related N-acetyltransferase  27.5 
 
 
210 aa  53.5  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0938  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
174 aa  51.6  0.000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000016136  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1901  GCN5-related N-acetyltransferase  18.29 
 
 
170 aa  51.6  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2092  GCN5-related N-acetyltransferase  27.33 
 
 
175 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000858823  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1115  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
165 aa  49.7  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.134171 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1014  acetyltransferase  19.42 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000248844  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30490  acetyltransferase (GNAT) family protein  29.86 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.312957 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0985  acetyltransferase  23.61 
 
 
172 aa  48.5  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.188436  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6188  GCN5-related N-acetyltransferase  38.57 
 
 
188 aa  46.6  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1080  GCN5-related N-acetyltransferase  20.26 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9259  GCN5-related N-acetyltransferase  29.68 
 
 
170 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.866618 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1183  acetyltransferase  19.57 
 
 
170 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000821591  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3026  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.634781 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000875  acetyltransferase GNAT family  22.88 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1474  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
209 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2715  GCN5-related N-acetyltransferase  40.32 
 
 
364 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.471331  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3010  GCN5-related N-acetyltransferase  43.28 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2743  acetyltransferase  43.28 
 
 
197 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.14778  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6099  putative acetyltransferase family protein  34.88 
 
 
161 aa  45.1  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29421  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1775  GCN5-related N-acetyltransferase  37.29 
 
 
197 aa  44.7  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3325  GCN5-related N-acetyltransferase  36.92 
 
 
202 aa  44.3  0.0008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  31.53 
 
 
187 aa  44.3  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1109  putative acetyltransferase  38.46 
 
 
105 aa  44.3  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0143191  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4041  GCN5-related N-acetyltransferase  37.33 
 
 
168 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  27.41 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1641  hypothetical protein  24.22 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.769737  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2855  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
173 aa  43.9  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2933  GCN5-related N-acetyltransferase  45.61 
 
 
169 aa  43.9  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0253991  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0612  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
183 aa  43.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.56302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  26.95 
 
 
381 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2485  acetyltransferase  24.83 
 
 
170 aa  43.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2957  acetyltransferase  38.71 
 
 
364 aa  42.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0211422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  22.86 
 
 
194 aa  42  0.004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7217  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
169 aa  42  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.370692  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02910  Acetyltransferase  28.05 
 
 
170 aa  42  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0625  GCN5-related N-acetyltransferase  37.7 
 
 
195 aa  41.6  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1376  acetyltransferase  24.83 
 
 
175 aa  42  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.151381  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1459  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
162 aa  41.2  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0638451  normal  0.0207477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1784  GCN5-related N-acetyltransferase  33.82 
 
 
153 aa  41.6  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0196  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3222  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1810  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 
251 aa  41.2  0.007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.000508978  normal  0.534907 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1397  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0464  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.585456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0483  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2824  acetyltransferase  34.15 
 
 
154 aa  41.2  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2454  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
196 aa  41.2  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.250394  normal  0.240064 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3439  GCN5-related N-acetyltransferase  29.63 
 
 
149 aa  40.8  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0646  acetyltransferase  34.15 
 
 
164 aa  40.8  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
382 aa  41.2  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.085946  normal  0.936747 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1400  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
161 aa  41.2  0.008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.508844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2948  GCN5-related N-acetyltransferase  34.21 
 
 
180 aa  40.8  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4157  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
396 aa  40.8  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2914  pectic acid lyase  27.41 
 
 
373 aa  40.8  0.009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2677  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
161 aa  40.8  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.245575  normal  0.057406 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35760  hypothetical protein  24.24 
 
 
154 aa  40.8  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  9.28006e-16  decreased coverage  1.5308899999999998e-20 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2098  GCN5-related N-acetyltransferase  38.18 
 
 
166 aa  40.8  0.01  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.907585 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>