More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_11340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_11340  histidine kinase with GAF domain  100 
 
 		 391 aa  766    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00610406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1658  GAF sensor signal transduction histidine kinase  78.06 
 
 		 409 aa  608  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0274237 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  63.05 
 
 		 590 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0109809  hitchhiker  0.000893685 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1613  GAF sensor signal transduction histidine kinase  46.94 
 
 		 550 aa  257  3e-67  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3326  GAF sensor signal transduction histidine kinase  44.05 
 
 		 571 aa  244  3e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.742829 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0501  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 571 aa  187  3e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1578  ATPase domain-containing protein  36.25 
 
 		 573 aa  179  5.999999999999999e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.593562 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0157  putative phytochrome sensor protein  37.59 
 
 		 401 aa  178  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1969  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 568 aa  176  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.197678  normal  0.851655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1654  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 567 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.309377  normal  0.649993 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3523  Histidine kinase  36.15 
 
 		 591 aa  173  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0630905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1529  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.99 
 
 		 573 aa  172  9e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.916601  hitchhiker  0.000293469 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4838  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.55 
 
 		 566 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3046  GAF:ATP-binding region, ATPase-like  35.04 
 
 		 572 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 595 aa  159  5e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0401989  hitchhiker  0.00207123 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22860  histidine kinase with GAF domain protein  34.61 
 
 		 543 aa  159  1e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.854581  normal  0.459297 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 		 544 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.303575  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0994  GAF domain-containing protein  32.74 
 
 		 577 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4819  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 		 543 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.563449  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6099  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.9 
 
 		 525 aa  146  6e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18330  histidine kinase  36.87 
 
 		 382 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01090  histidine kinase with GAF domain protein  32.99 
 
 		 385 aa  142  9e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1077  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 566 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1093  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 566 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1104  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 566 aa  142  9e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 631 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.877049 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1907  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 		 566 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1560  putative signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 588 aa  137  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.298915  normal  0.578819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 578 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3251  putative signal transduction histidine kinase  29.72 
 
 		 592 aa  131  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1413  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 568 aa  129  6e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4125  putative signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4200  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.112122  normal  0.730315 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0096  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.642474  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13153  two component system sensor histidine kinase devS  33.5 
 
 		 578 aa  126  6e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3460  putative signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 556 aa  126  6e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.26 
 
 		 580 aa  126  7e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4356  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.83 
 
 		 568 aa  125  1e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.641048  normal  0.232825 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1486  putative signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 579 aa  120  3e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0200919  normal  0.602457 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1395  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.45 
 
 		 559 aa  119  7.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.735957  normal  0.354354 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23240  histidine kinase with GAF domain protein  31.27 
 
 		 635 aa  119  9e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.677284 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2135  putative signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 		 565 aa  116  7.999999999999999e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0347228  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4737  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 		 535 aa  115  8.999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1700  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.36 
 
 		 535 aa  115  1.0000000000000001e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0180519 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3844  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 575 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00743108  normal  0.0464921 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0516  putative signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 392 aa  108  1e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.587002  normal  0.721825 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4147  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 		 381 aa  105  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12064  histidine kinase response regulator  31.77 
 
 		 573 aa  105  2e-21  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0946  GAF domain-containing protein  31.63 
 
 		 536 aa  101  3e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0197994  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2137  GAF domain protein  34.27 
 
 		 549 aa  97.8  3e-19  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.565017  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 		 456 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1421  ATPase domain-containing protein  30.04 
 
 		 484 aa  88.2  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.595659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0507  Histidine kinase  28.46 
 
 		 373 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0508  putative PAS/PAC sensor protein  28.33 
 
 		 673 aa  83.2  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3651  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.87 
 
 		 345 aa  80.9  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.375417  normal  0.773266 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33000  PAS domain S-box  31.23 
 
 		 547 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.569309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4209  putative PAS/PAC sensor protein  31.41 
 
 		 795 aa  76.6  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.16 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3088  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 		 618 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2729  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.37 
 
 		 665 aa  75.5  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4655  putative PAS/PAC sensor protein  31.12 
 
 		 535 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0444  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  31.2 
 
 		 603 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00168683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2899  nitrate/nitrite sensor protein NarX  28.68 
 
 		 594 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4896  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 		 517 aa  68.2  0.0000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0133704  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3924  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278559  hitchhiker  0.00726573 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1005  signal transduction histidine kinase, nitrate/nitrite-specific, NarQ  30.71 
 
 		 644 aa  67.8  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2820  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.78 
 
 		 545 aa  67  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.771324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13740  two-component sensor NarX  27.31 
 
 		 622 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.869934  normal  0.455278 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5201  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 		 393 aa  66.6  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.849708 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1849  nitrate/nitrite sensor protein NarX  24.71 
 
 		 603 aa  66.6  0.0000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0159  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 508 aa  66.6  0.0000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.09 
 
 		 544 aa  66.6  0.0000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38430  PAS domain S-box  30.58 
 
 		 552 aa  66.2  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  26.48 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.693223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.33 
 
 		 425 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.944202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  27.12 
 
 		 545 aa  65.9  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1204  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.73 
 
 		 779 aa  65.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5809  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 		 366 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.325789  normal  0.250191 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4502  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 		 391 aa  65.1  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00405521  normal  0.0184903 
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  28.57 
 
 		 223 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0602  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.91 
 
 		 584 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.416305  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1285  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 		 742 aa  63.9  0.000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 591 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3956  histidine kinase, dimerization and phosphoacceptor region  27.56 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5549  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.5 
 
 		 370 aa  63.5  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.441753  normal  0.532681 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1201  histidine kinase  25 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2713  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.5 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.774679 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2673  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.5 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2739  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.5 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2846  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.5 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2624  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  27.5 
 
 		 566 aa  63.2  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.1 
 
 		 591 aa  62.8  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1230  two-component sensor NarX  27.83 
 
 		 622 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 		 574 aa  62.4  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1842  histidine kinase  28.24 
 
 		 529 aa  62.4  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4486  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.55 
 
 		 582 aa  62.4  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 		 605 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.142305 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41030  Periplasmic sensory histidine protein kinase, two-component  27.73 
 
 		 458 aa  62.8  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0649951  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2748  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  25 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.560652  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2615  nitrate/nitrite sensor protein NarQ  25 
 
 		 566 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.538567  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>