148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10710 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  100 
 
 		 360 aa  714    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  67.83 
 
 		 147 aa  209  7e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  65.97 
 
 		 145 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  64.38 
 
 		 146 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  64.83 
 
 		 145 aa  196  5.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  60.14 
 
 		 145 aa  194  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  60 
 
 		 145 aa  188  1e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  60.14 
 
 		 148 aa  187  2e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  59.31 
 
 		 145 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  56.58 
 
 		 324 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  63.5 
 
 		 144 aa  179  9e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1166  protein of unknown function DUF437  56.63 
 
 		 180 aa  169  7e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.320751  normal  0.0636281 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  50.34 
 
 		 147 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  52.03 
 
 		 153 aa  147  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  51.11 
 
 		 140 aa  142  9e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  50.37 
 
 		 143 aa  142  9.999999999999999e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  46.15 
 
 		 146 aa  135  7.000000000000001e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  48.15 
 
 		 140 aa  135  9e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  48.46 
 
 		 134 aa  116  5e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0260  hypothetical protein  47.2 
 
 		 152 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0233  hypothetical protein  47.11 
 
 		 133 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5003  asch domain superfamily  46.83 
 
 		 152 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0311  asch domain superfamily  47.2 
 
 		 152 aa  107  4e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  42.31 
 
 		 138 aa  103  6e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1005  hypothetical protein  45.86 
 
 		 148 aa  103  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000462083  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  41.22 
 
 		 135 aa  101  2e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  40.46 
 
 		 135 aa  98.6  1e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1415  protein of unknown function DUF437  38.64 
 
 		 178 aa  99  1e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.849897 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1659  hypothetical protein  43.8 
 
 		 129 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1771  hypothetical protein  43.8 
 
 		 129 aa  98.6  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.622011  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4712  hypothetical protein  42.98 
 
 		 134 aa  97.4  3e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06553  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  95.5  1e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.01 
 
 		 274 aa  92.4  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  38.57 
 
 		 151 aa  92  1e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4523  putative cytoplasmic protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4520  hypothetical protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.114394  normal  0.196028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4398  putative cytoplasmic protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.430337  normal  0.506874 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4433  putative cytoplasmic protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4596  hypothetical protein  43.7 
 
 		 144 aa  92.4  1e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  39.53 
 
 		 311 aa  92  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2695  hypothetical protein  43.56 
 
 		 136 aa  91.7  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.432251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2538  hypothetical protein  40.62 
 
 		 150 aa  91.3  3e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  37.12 
 
 		 142 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  37.12 
 
 		 142 aa  90.1  5e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2104  hypothetical protein  47.96 
 
 		 130 aa  90.1  6e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223798 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  38.46 
 
 		 140 aa  89.4  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1042  hypothetical protein  35.77 
 
 		 149 aa  89  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  36.36 
 
 		 142 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  36.36 
 
 		 150 aa  89.4  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  41.09 
 
 		 133 aa  88.6  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0928  hypothetical protein  39.68 
 
 		 148 aa  87.4  3e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.349962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1735  hypothetical protein  40.98 
 
 		 159 aa  87  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  37.23 
 
 		 140 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  36.15 
 
 		 144 aa  85.9  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35920  hypothetical protein  39.02 
 
 		 191 aa  85.9  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.437483 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  37.31 
 
 		 144 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  39.39 
 
 		 177 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  34.29 
 
 		 151 aa  84.7  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0492  hypothetical protein  40.5 
 
 		 152 aa  84.7  0.000000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.727699  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.92 
 
 		 177 aa  84.3  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  35.82 
 
 		 161 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  40.37 
 
 		 164 aa  82.4  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  38.24 
 
 		 157 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000672  hypothetical protein  38.98 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.11314  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  36.17 
 
 		 169 aa  80.9  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  36.15 
 
 		 149 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  34.62 
 
 		 146 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1395  hypothetical protein  38.14 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.46 
 
 		 306 aa  79.7  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  41.18 
 
 		 145 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  37.1 
 
 		 163 aa  78.2  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1615  protein of unknown function DUF437  33.33 
 
 		 154 aa  77  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  37.3 
 
 		 143 aa  76.6  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  35 
 
 		 164 aa  76.3  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1901  hypothetical protein  37.4 
 
 		 162 aa  76.3  0.0000000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.623364  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  38.66 
 
 		 153 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  38.66 
 
 		 153 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  38.66 
 
 		 153 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1146  hypothetical protein  37.82 
 
 		 151 aa  74.7  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.855253  normal  0.159732 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  74.7  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0088  protein of unknown function DUF437  34.96 
 
 		 171 aa  74.7  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  34.81 
 
 		 159 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  32.14 
 
 		 150 aa  73.2  0.000000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0172  hypothetical protein  34.29 
 
 		 155 aa  73.2  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  34.58 
 
 		 168 aa  73.2  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0390  hypothetical protein  38.38 
 
 		 146 aa  73.2  0.000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.706483 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0385  hypothetical protein  38.38 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0343  hypothetical protein  38.38 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  34.07 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  34.07 
 
 		 159 aa  72.4  0.00000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  40.94 
 
 		 157 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  41.22 
 
 		 145 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  33.64 
 
 		 166 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  34.86 
 
 		 158 aa  70.1  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1114  hypothetical protein  40.68 
 
 		 138 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.883166  normal  0.860211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  38.84 
 
 		 125 aa  68.9  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>