More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  77.59 
 
 		 591 aa  954    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  67.5 
 
 		 598 aa  825    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  58.96 
 
 		 582 aa  691    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  61.23 
 
 		 567 aa  720    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5501  trehalose synthase  62.06 
 
 		 596 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0931844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2968  trehalose synthase  56.15 
 
 		 553 aa  640    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1778  trehalose synthase  56.99 
 
 		 558 aa  643    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  61.51 
 
 		 606 aa  714    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09530  trehalose synthase  67.44 
 
 		 616 aa  810    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0126858  normal  0.324704 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  61.29 
 
 		 604 aa  729    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2940  trehalose synthase  54.33 
 
 		 1088 aa  638    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00795057 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  56.54 
 
 		 551 aa  655    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2713  trehalose synthase  54.33 
 
 		 1088 aa  638    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.352676 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3002  trehalose synthase-like  55.6 
 
 		 572 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.205935  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  59.34 
 
 		 574 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  55.84 
 
 		 548 aa  640    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10330  trehalose synthase  100 
 
 		 588 aa  1218    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  53.73 
 
 		 551 aa  645    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4101  trehalose synthase  59.73 
 
 		 610 aa  742    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  73.71 
 
 		 585 aa  918    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1598  trehalose synthase  54.23 
 
 		 1092 aa  635    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0248685 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1630  trehalose synthase  58.76 
 
 		 562 aa  696    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1096  trehalose synthase  76.17 
 
 		 587 aa  914    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  56.67 
 
 		 556 aa  649    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2835  trehalose synthase  53.96 
 
 		 1088 aa  637    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0758325  normal  0.0859996 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  61.4 
 
 		 577 aa  721    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5121  trehalose synthase-like protein  62.06 
 
 		 596 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3101  trehalose synthase  55.78 
 
 		 553 aa  640    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.729849  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  62.43 
 
 		 601 aa  729    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0874  trehalose synthase  60.55 
 
 		 591 aa  714    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.847656  normal  0.214789 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  60.31 
 
 		 572 aa  722    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10127  trehalose synthase treS  62.48 
 
 		 601 aa  720    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000502471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1296  trehalose synthase  68.75 
 
 		 583 aa  845    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13842  normal  0.98704 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1336  trehalose synthase  73.06 
 
 		 567 aa  865    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  65.22 
 
 		 598 aa  820    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3202  trehalose synthase  55.78 
 
 		 572 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169478  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  62.29 
 
 		 556 aa  730    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  59.52 
 
 		 682 aa  725    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1808  trehalose synthase  61.54 
 
 		 571 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0813826  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5210  trehalose synthase  62.06 
 
 		 596 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6807  trehalose synthase  53.87 
 
 		 1088 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.267695  normal  0.5618 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2090  trehalose synthase  55.49 
 
 		 1119 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0315  trehalose synthase-like protein  54.41 
 
 		 1121 aa  629  1e-179  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  57.34 
 
 		 1115 aa  631  1e-179  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7546  trehalose synthase  53.51 
 
 		 1088 aa  629  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.455626  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2446  putative trehalose synthase  53.79 
 
 		 1102 aa  625  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.500894  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1110  trehalose synthase  53.79 
 
 		 1102 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.531245 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1106  trehalose synthase  54.3 
 
 		 1123 aa  627  1e-178  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2490  Alpha amylase, catalytic region  52.97 
 
 		 1108 aa  622  1e-177  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2353  alpha amylase domain-containing protein  53.9 
 
 		 1110 aa  622  1e-177  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.544253  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1784  trehalose synthase  53.23 
 
 		 1102 aa  620  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2761  alpha-amylase family protein  53.1 
 
 		 1108 aa  621  1e-176  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.142181  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1816  trehalose synthase  54 
 
 		 1105 aa  619  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.482452 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4791  trehalose synthase  52.67 
 
 		 1114 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0872883  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2361  alpha amylase family protein  53.87 
 
 		 1111 aa  615  1e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.124946  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4059  trehalose synthase  53.64 
 
 		 1106 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3658  trehalose synthase  53.27 
 
 		 1106 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100309  hitchhiker  0.000190821 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0830  Alpha amylase, catalytic region  53.39 
 
 		 1104 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3469  trehalose synthase/ maltokinase-like  53.36 
 
 		 1112 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1605  Alpha amylase, catalytic region  53.59 
 
 		 1100 aa  615  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3263  trehalose synthase  53.01 
 
 		 1121 aa  615  1e-175  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1784  trehalose synthase  53.64 
 
 		 1106 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0687531  normal  0.178352 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0851  trehalose synthase  53.39 
 
 		 1108 aa  613  9.999999999999999e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2535  Alpha amylase, catalytic region  52.96 
 
 		 1113 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.592261 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0035  trehalose synthase  54.15 
 
 		 1109 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2917  trehalose synthase  53.58 
 
 		 1130 aa  612  9.999999999999999e-175  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0117  trehalose synthase  54.17 
 
 		 1116 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0236355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0136  trehalose synthase  53.99 
 
 		 1116 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2160  trehalose synthase-like  52.84 
 
 		 1112 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  57.06 
 
 		 1137 aa  611  9.999999999999999e-175  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3154  putative trehalose synthase  53.44 
 
 		 1100 aa  608  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2294  trehalose synthase  53.11 
 
 		 1100 aa  609  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00139705  decreased coverage  0.000000883241 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6321  trehalose synthase  57.06 
 
 		 1137 aa  611  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0765728  normal  0.0985799 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4096  trehalose synthase  52.73 
 
 		 1139 aa  608  1e-173  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.981031  normal  0.0225037 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2022  trehalose synthase  52.3 
 
 		 1142 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  56.47 
 
 		 1137 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4051  trehalose synthase  52.98 
 
 		 1164 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3938  trehalose synthase  52.98 
 
 		 1164 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.278548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1485  trehalose synthase-like  54.01 
 
 		 1108 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  56.47 
 
 		 1137 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36730  putative trehalose synthase  53.26 
 
 		 1100 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.631838 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03668  alpha-amylase family protein  55.11 
 
 		 1101 aa  605  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  56.47 
 
 		 1137 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1980  trehalose synthase  51.74 
 
 		 1109 aa  604  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0525025  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  56.08 
 
 		 1136 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3014  trehalose synthase  50.55 
 
 		 1094 aa  602  1.0000000000000001e-171  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.602191 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0211  trehalose synthase  52.09 
 
 		 1105 aa  602  1.0000000000000001e-171  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05183  hypothetical protein  52.36 
 
 		 1160 aa  598  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0584538  normal  0.396388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0152  trehalose synthase  51.8 
 
 		 1113 aa  599  1e-170  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.38856 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5098  trehalose synthase  51 
 
 		 1093 aa  599  1e-170  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436768  decreased coverage  0.00978496 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3679  trehalose synthase-like  52.53 
 
 		 1099 aa  601  1e-170  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1418  trehalose synthase-like protein  52.4 
 
 		 1134 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28000  trehalose synthase, maltokinase fusion protein  53.22 
 
 		 1108 aa  600  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2782  trehalose synthase  52.85 
 
 		 1098 aa  599  1e-170  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2378  trehalose synthase  52.67 
 
 		 1099 aa  601  1e-170  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2935  trehalose synthase  53.1 
 
 		 1110 aa  599  1e-170  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3921  trehalose synthase  50.56 
 
 		 1085 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  55.49 
 
 		 1138 aa  598  1e-169  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2029  alpha amylase domain-containing protein  52.3 
 
 		 1100 aa  597  1e-169  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.269645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1465  trehalose synthase-like  51.38 
 
 		 1088 aa  598  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>