255 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10300  thioredoxin domain-containing protein  100 
 
 		 313 aa  602  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1730  putative thioredoxin domain-containing protein  52.53 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2422  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  59.32 
 
 		 319 aa  277  2e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2594  thioredoxin domain-containing protein  46.55 
 
 		 339 aa  242  6e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.238157  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2327  thioredoxin domain protein  45.65 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000128937 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1092  Thioredoxin domain protein  54.72 
 
 		 310 aa  223  4e-57  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.509026  normal  0.582988 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1333  Thioredoxin domain protein  49.06 
 
 		 311 aa  221  9e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1282  Thioredoxin domain  45.54 
 
 		 319 aa  186  6e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00790933  normal  0.585558 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1276  thioredoxin domain protein  41.09 
 
 		 337 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0139  hypothetical protein  34.95 
 
 		 340 aa  176  6e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19060  thioredoxin domain-containing protein  41.12 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.595284  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09500  thioredoxin domain-containing protein  39.42 
 
 		 346 aa  173  2.9999999999999996e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.460116  normal  0.88242 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08240  thioredoxin domain-containing protein  44.63 
 
 		 324 aa  167  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0675  thioredoxin domain-containing protein  38.69 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.357396  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3886  Thioredoxin domain protein  37.22 
 
 		 312 aa  162  7e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.54182  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1804  thioredoxin domain-containing protein  41.45 
 
 		 314 aa  160  3e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1117  thioredoxin-related protein  42.95 
 
 		 324 aa  158  1e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2392  putative thioredoxin  41.01 
 
 		 309 aa  151  1e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28500  thioredoxin  37.99 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.173246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1704  thioredoxin domain protein  39.24 
 
 		 310 aa  149  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143587 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1954  Thioredoxin domain protein  37.96 
 
 		 313 aa  142  7e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0686118  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6079  thioredoxin domain protein  40.88 
 
 		 326 aa  140  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1925  Thioredoxin domain-containing protein  37.7 
 
 		 299 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1048  thioredoxin domain-containing protein  39.46 
 
 		 331 aa  129  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.157412  normal  0.991017 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2342  thioredoxin domain-containing protein  36.16 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.299917  normal  0.377352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4105  Thioredoxin domain protein  38.69 
 
 		 321 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3607  thioredoxin domain-containing protein  36.45 
 
 		 300 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.150797 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0364  putative thioredoxin  33.8 
 
 		 320 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.163537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3988  thioredoxin domain-containing protein  36.66 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000709703 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3862  thioredoxin domain-containing protein  35.58 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3936  thioredoxin domain-containing protein  35.58 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.201216 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3848  thioredoxin domain-containing protein  35.58 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00807359 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4303  thioredoxin domain-containing protein  35.13 
 
 		 297 aa  110  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.408854  normal  0.611787 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1268  Thioredoxin domain protein  35.97 
 
 		 323 aa  110  3e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11356  thioredoxin  31.66 
 
 		 304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000675127  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3683  thioredoxin-related  35.42 
 
 		 329 aa  107  3e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418332  normal  0.641891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0921  thioredoxin domain-containing protein  32.85 
 
 		 301 aa  106  6e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.460441 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0266  thioredoxin  29.08 
 
 		 301 aa  91.3  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0796  thioredoxin  28.57 
 
 		 281 aa  88.6  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0505807  normal  0.147714 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2527  thioredoxin  29.7 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0179199 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0519  thioredoxin  30.04 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0726  thioredoxin  29.54 
 
 		 281 aa  81.3  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0681266  normal  0.772091 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4245  thioredoxin  24.44 
 
 		 334 aa  80.9  0.00000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902531  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1818  thioredoxin  28.72 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314014 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  29.55 
 
 		 289 aa  79.3  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0886  putative thioredoxin protein  30.14 
 
 		 287 aa  79.3  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3775  thioredoxin  24.36 
 
 		 324 aa  79  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.467472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3098  thioredoxin  35.58 
 
 		 333 aa  79  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000000032408  hitchhiker  0.0000022841 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2376  thioredoxin-related  28.66 
 
 		 286 aa  77.8  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.036483  normal  0.757224 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0779  putative thioredoxin protein  29.13 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.297357  decreased coverage  0.00262303 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1547  thioredoxin  28.52 
 
 		 302 aa  76.6  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.874099  hitchhiker  0.00479598 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3161  thioredoxin domain-containing protein  28.28 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.324735  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1269  putative thioredoxin  28.28 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3023  putative thioredoxin  28.28 
 
 		 289 aa  76.6  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4099  thioredoxin  24.36 
 
 		 324 aa  75.9  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.809641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4464  thioredoxin  27.67 
 
 		 302 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.980457  hitchhiker  0.00575685 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3232  thioredoxin domain-containing protein  24.4 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.941804  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5188  thioredoxin  26.25 
 
 		 302 aa  74.3  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.357314  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0845  hypothetical protein  23.55 
 
 		 282 aa  73.9  0.000000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0318  thioredoxin  30.17 
 
 		 287 aa  74.3  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3931  thioredoxin  39.42 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3279  thioredoxin  39.42 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2636  thioredoxin  29.41 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3045  thioredoxin  25.84 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00581  Thioredoxin domain-containing protein  27.59 
 
 		 289 aa  72.8  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3035  thioredoxin-related  31.85 
 
 		 274 aa  72.4  0.000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1982  thioredoxin  26.83 
 
 		 317 aa  71.6  0.00000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00653306  normal  0.106397 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  29.55 
 
 		 289 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1312  thioredoxin  27.76 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.968155  hitchhiker  0.00158392 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0081  thioredoxin-related  25.82 
 
 		 310 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1539  thioredoxin domain-containing protein  27.49 
 
 		 287 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0176064  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4561  thioredoxin  37.5 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.712523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0294  putative thioredoxin protein  38.89 
 
 		 314 aa  71.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.918989  normal  0.0369237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3861  thioredoxin  29.96 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.339067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3667  thioredoxin domain-containing protein  26.17 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1865  thioredoxin  27.81 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.938725 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1155  thioredoxin domain-containing protein  29.49 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155818  hitchhiker  0.00000315771 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0661  thioredoxin domain-containing protein  31.39 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211943  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4466  thioredoxin  27.24 
 
 		 290 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4590  thioredoxin  25.31 
 
 		 304 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.315091 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0035  thioredoxin domain protein  27 
 
 		 303 aa  70.5  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000613737 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3272  thioredoxin  24.74 
 
 		 326 aa  69.7  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.315754  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0903  thioredoxin  31.39 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0906  thioredoxin  31.39 
 
 		 282 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2231  thioredoxin domain-containing protein  27.42 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00861922  hitchhiker  0.000221991 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00443  predicted thioredoxin domain-containing protein  27.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3118  Thioredoxin domain protein  27.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00448  hypothetical protein  27.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3124  thioredoxin domain-containing protein  27.55 
 
 		 284 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000112242 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0893  thioredoxin  25.98 
 
 		 324 aa  68.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  26.6 
 
 		 290 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0306  putative thioredoxin  24.21 
 
 		 305 aa  68.6  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351153 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0571  protein YbbN  27.55 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0531  protein YbbN  27.55 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.735174  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0835  thioredoxin  26.88 
 
 		 304 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0466449 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0427  protein YbbN  27.55 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0596  protein YbbN  27.55 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0541  protein YbbN  27.55 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  26.83 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0837  thioredoxin  25.65 
 
 		 329 aa  67.8  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.24068  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>