More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10170 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_0188  beta-galactosidase  70.21 
 
 
472 aa  674  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2440  beta-galactosidase  68.84 
 
 
491 aa  645  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10170  broad-specificity cellobiase  100 
 
 
479 aa  965  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1754  beta-galactosidase  72.94 
 
 
485 aa  705  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0528393 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1084  beta-galactosidase  69.94 
 
 
482 aa  618  1e-176  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.106414  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3961  Beta-glucosidase  60.38 
 
 
487 aa  564  1e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000589535  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2184  beta-galactosidase  62.86 
 
 
471 aa  526  1e-148  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000108551  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0133  beta-galactosidase  55.6 
 
 
478 aa  514  1e-144  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5333  beta-galactosidase  58.7 
 
 
470 aa  499  1e-140  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.622206 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7167  Beta-glucosidase  56.49 
 
 
459 aa  473  1e-132  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0225404 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1788  beta-galactosidase  55.25 
 
 
472 aa  459  1e-128  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.586379  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1894  beta-galactosidase  50.97 
 
 
476 aa  461  1e-128  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.301665 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3305  Beta-glucosidase  52.49 
 
 
474 aa  459  1e-128  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.40854 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1509  Beta-glucosidase  53.76 
 
 
478 aa  458  1e-127  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000143364 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0937  beta-galactosidase  54.19 
 
 
484 aa  457  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0483408  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1560  glycoside hydrolase family protein  54.42 
 
 
478 aa  449  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.677245 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7170  Beta-glucosidase  55.77 
 
 
474 aa  442  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0420556 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0390  Beta-glucosidase  52.53 
 
 
467 aa  440  1e-122  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0163066 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0839  beta-galactosidase  53.36 
 
 
488 aa  437  1e-121  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.411706  normal  0.263792 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1481  beta-galactosidase  52.25 
 
 
467 aa  438  1e-121  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1683  beta-galactosidase  53.03 
 
 
467 aa  437  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.13987  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1939  beta-galactosidase  51.17 
 
 
458 aa  432  1e-120  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.80548e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2840  beta-galactosidase  53.29 
 
 
500 aa  434  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.574509  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2517  beta-galactosidase  50.11 
 
 
462 aa  428  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.447454  normal  0.232688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1733  beta-galactosidase  52.32 
 
 
482 aa  427  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.174879  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0326  Beta-glucosidase  51.39 
 
 
466 aa  423  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15280  glycoside hydrolase family 1  45.86 
 
 
451 aa  420  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.25524e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1629  beta-glucosidase  55 
 
 
463 aa  417  1e-115  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.011647  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08390  broad-specificity cellobiase  50.31 
 
 
494 aa  416  1e-115  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.817528  normal  0.180996 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0402  beta-galactosidase  51.67 
 
 
494 aa  414  1e-114  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0288  beta-galactosidase  48.68 
 
 
444 aa  410  1e-113  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  5.31793e-05  normal  0.536803 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0808  beta-galactosidase  54 
 
 
466 aa  410  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.201383 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1895  beta-galactosidase  48.61 
 
 
453 aa  407  1e-112  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.785457  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2534  beta-galactosidase  50.87 
 
 
468 aa  403  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.574019 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6279  beta-galactosidase  49.36 
 
 
463 aa  400  1e-110  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1799  beta-galactosidase  45.39 
 
 
446 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  1.88458e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5462  Beta-glucosidase  50 
 
 
489 aa  395  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0521  Beta-glucosidase  50.32 
 
 
453 aa  397  1e-109  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1879  beta-galactosidase  48.85 
 
 
488 aa  393  1e-108  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.251034  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4282  beta-galactosidase  50.98 
 
 
455 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189474  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3614  Beta-glucosidase  49.02 
 
 
448 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2046  beta-galactosidase  49.35 
 
 
457 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0969  beta-galactosidase  45.16 
 
 
446 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00738034  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2422  Beta-glucosidase  45.57 
 
 
474 aa  392  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  2.77167e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0952  Beta-glucosidase  45.16 
 
 
446 aa  390  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  3.26763e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1102  Beta-glucosidase  48.06 
 
 
448 aa  388  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2614  beta-galactosidase  49.38 
 
 
517 aa  384  1e-105  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2862  Beta-glucosidase  51.31 
 
 
443 aa  384  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.753347  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0212  Beta-glucosidase  42.83 
 
 
471 aa  379  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.292852  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1896  beta-galactosidase  47.22 
 
 
439 aa  382  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.42466 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0458  beta-galactosidase  43.07 
 
 
452 aa  381  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  7.53308e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1530  Beta-glucosidase  45.18 
 
 
438 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.11423e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4773  beta-galactosidase  48.25 
 
 
447 aa  375  1e-103  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0493  beta-galactosidase  44.49 
 
 
446 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4295  Beta-glucosidase  43.82 
 
 
447 aa  372  1e-102  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000161333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6572  Beta-glucosidase  47.8 
 
 
458 aa  369  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0265684  normal  0.0290842 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2401  Beta-glucosidase  45.03 
 
 
452 aa  369  1e-101  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00110187  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06938  beta-glucosidase  45.15 
 
 
449 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1578  beta-glucosidase  45.38 
 
 
450 aa  364  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.302978  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3917  Beta-glucosidase  48.02 
 
 
455 aa  363  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2781  beta-galactosidase  45.45 
 
 
456 aa  363  4e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2763  beta-galactosidase  47.7 
 
 
436 aa  361  2e-98  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5888  beta-galactosidase  48.65 
 
 
470 aa  359  5e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1349  beta-galactosidase  45.87 
 
 
453 aa  358  8e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.135254  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4587  Beta-glucosidase  45.16 
 
 
465 aa  355  1e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.349984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7951  Beta-glucosidase  46.99 
 
 
437 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2084  Beta-glucosidase  47.65 
 
 
440 aa  353  5e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.483435  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3706  beta-glucosidase  43.92 
 
 
443 aa  351  1e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5434  beta-galactosidase  47.43 
 
 
463 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.139102  normal  0.287143 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1316  Beta-glucosidase  44.35 
 
 
443 aa  350  5e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2958  Beta-glucosidase  44.4 
 
 
463 aa  349  7e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3403  beta-galactosidase  43.92 
 
 
457 aa  349  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.968269  normal  0.135443 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5087  beta-glucosidase  40.99 
 
 
453 aa  346  5e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.167744  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2605  beta-galactosidase  48.03 
 
 
472 aa  345  8e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.620464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1638  Beta-glucosidase  42.64 
 
 
439 aa  345  8e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3701  beta-galactosidase  43.35 
 
 
457 aa  343  3e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2689  beta-galactosidase  44.23 
 
 
479 aa  343  3e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.651295 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1111  Beta-glucosidase  43.54 
 
 
456 aa  342  7e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1402  Beta-glucosidase  45.25 
 
 
452 aa  342  9e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00588198  normal  0.0441628 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3397  beta-galactosidase  43.61 
 
 
482 aa  341  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0879388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3827  beta-glucosidase  43.13 
 
 
457 aa  340  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.100149  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2786  Beta-glucosidase  43.8 
 
 
468 aa  340  3e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1394  Beta-glucosidase  43.17 
 
 
444 aa  339  7e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534606  normal  0.0533857 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2607  Beta-glucosidase  43.21 
 
 
443 aa  338  1e-91  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.776876  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4221  Beta-glucosidase  40.38 
 
 
467 aa  337  2e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0294315  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1520  Beta-glucosidase  43.96 
 
 
440 aa  337  3e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0705421 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4320  beta-galactosidase  47.3 
 
 
460 aa  337  3e-91  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.952407 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2765  Beta-glucosidase  42.17 
 
 
470 aa  337  3e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2874  putative Beta-glucosidase A  43.93 
 
 
440 aa  336  6e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.355603  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3225  beta-galactosidase  46 
 
 
444 aa  336  7e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1147  beta-galactosidase  42.33 
 
 
446 aa  335  2e-90  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.94123 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3445  beta-galactosidase  41.98 
 
 
499 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1019  Beta-glucosidase  44.01 
 
 
448 aa  332  7e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.477065  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1183  Beta-glucosidase  42.7 
 
 
451 aa  332  1e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.0012185  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4280  beta-galactosidase  44.66 
 
 
445 aa  331  2e-89  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0714025  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1131  Beta-glucosidase  43.14 
 
 
451 aa  330  3e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.563632  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3174  beta-galactosidase  42.48 
 
 
451 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00114145  normal  0.862939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4868  beta-galactosidase  41.87 
 
 
467 aa  329  7e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2977  glycoside hydrolase family protein  41.44 
 
 
473 aa  327  2e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1082  beta-galactosidase  40.35 
 
 
447 aa  327  3e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.655373  normal  0.120438 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>