215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  100 
 
 
78 aa  145  1e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  92.11 
 
 
77 aa  134  5e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  82.89 
 
 
76 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  74.36 
 
 
81 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  80 
 
 
74 aa  110  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  67.12 
 
 
75 aa  102  2e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  67.61 
 
 
73 aa  100  5e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  64.29 
 
 
75 aa  93.2  1e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.78 
 
 
74 aa  77.8  4e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  56.34 
 
 
76 aa  76.6  9e-14  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  52.86 
 
 
75 aa  75.5  2e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  47.22 
 
 
77 aa  75.1  3e-13  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  61.02 
 
 
81 aa  74.3  5e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  69.3  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  3.62288e-05  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.47 
 
 
82 aa  67.8  4e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
72 aa  67.8  4e-11  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
70 aa  63.9  7e-10  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  49.23 
 
 
74 aa  63.9  7e-10  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
70 aa  63.9  7e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 
70 aa  63.9  7e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 
70 aa  62.4  2e-09  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.29 
 
 
77 aa  62.4  2e-09  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  4.06172e-05 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 
68 aa  62  3e-09  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
122 aa  60.5  7e-09  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  53.12 
 
 
75 aa  59.3  2e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  1.61135e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  59.57 
 
 
85 aa  58.5  3e-08  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
79 aa  58.2  4e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
82 aa  57.4  7e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
82 aa  57.4  7e-08  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  39.39 
 
 
69 aa  57  8e-08  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 
111 aa  56.6  1e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 
77 aa  55.8  2e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 
75 aa  55.5  2e-07  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  47.3 
 
 
79 aa  55.5  2e-07  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  52.17 
 
 
72 aa  55.8  2e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44 
 
 
72 aa  55.1  3e-07  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 
70 aa  55.1  3e-07  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  8.66069e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
81 aa  55.5  3e-07  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.68 
 
 
80 aa  54.7  4e-07  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  41.43 
 
 
71 aa  55.1  4e-07  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  45.45 
 
 
70 aa  54.7  4e-07  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
91 aa  53.9  8e-07  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  38.81 
 
 
67 aa  53.9  8e-07  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  50.7 
 
 
73 aa  52.8  1e-06  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 
74 aa  53.1  1e-06  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 
91 aa  53.1  1e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.50029e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40.98 
 
 
77 aa  53.1  1e-06  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  33.33 
 
 
103 aa  52.4  2e-06  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
76 aa  52.8  2e-06  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.4416e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  52.4  2e-06  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
76 aa  52.8  2e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
91 aa  52.4  2e-06  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  46.77 
 
 
78 aa  52  3e-06  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 
76 aa  52  3e-06  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  52  3e-06  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  38.98 
 
 
92 aa  51.6  4e-06  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
65 aa  51.6  4e-06  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  3.03287e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 
77 aa  51.6  4e-06  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  51.2  4e-06  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  51.6  4e-06  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
73 aa  51.2  5e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.3986e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
73 aa  50.8  6e-06  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  3.18758e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
78 aa  50.8  6e-06  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  45.1 
 
 
66 aa  50.8  6e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
76 aa  50.4  7e-06  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  50.8  7e-06  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  48.28 
 
 
85 aa  50.4  7e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
82 aa  50.4  7e-06  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.33 
 
 
77 aa  50.4  8e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  50.98 
 
 
82 aa  50.4  9e-06  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  9.4823e-07  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 
78 aa  50.1  9e-06  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  50.98 
 
 
82 aa  50.4  9e-06  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  5.0881e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  49.02 
 
 
81 aa  48.9  2e-05  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  49.02 
 
 
73 aa  49.3  2e-05  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  46.55 
 
 
84 aa  49.3  2e-05  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  46.55 
 
 
84 aa  49.3  2e-05  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  2.13686e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 
75 aa  48.5  3e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 
75 aa  48.5  3e-05  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3289  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 
82 aa  48.5  3e-05  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.524691  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  46.94 
 
 
77 aa  48.5  3e-05  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  47.92 
 
 
81 aa  48.1  4e-05  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 
77 aa  47.8  5e-05  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  50 
 
 
81 aa  47.8  5e-05  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 
85 aa  47.8  5e-05  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  4.05757e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
82 aa  47.8  5e-05  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>