More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09790 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_09790  transcriptional regulator  100 
 
 		 241 aa  476  1e-133  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0176841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1794  GntR domain protein  64.81 
 
 		 224 aa  269  2.9999999999999997e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.126744  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1051  GntR domain protein  64.32 
 
 		 217 aa  241  7e-63  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.802892 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1163  GntR domain protein  50 
 
 		 230 aa  187  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.613431 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4529  GntR domain-containing protein  51.94 
 
 		 224 aa  172  2.9999999999999996e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00172628 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0328  GntR family transcriptional regulator  47.85 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.661086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3543  GntR domain-containing protein  50.57 
 
 		 235 aa  168  6e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.909399 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0952  GntR domain-containing protein  46.53 
 
 		 225 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0016  GntR domain-containing protein  42.67 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.504347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5880  GntR domain protein  42.27 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1374  GntR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 231 aa  158  7e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0659803  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9327  putative transcriptional regulator  48.84 
 
 		 229 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.572046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4846  GntR domain protein  43.75 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0339  GntR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0349  GntR family transcriptional regulator  46.89 
 
 		 221 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.495612 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10060  transcriptional regulator, GntR family  39.45 
 
 		 226 aa  149  5e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0815539  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2216  GntR domain protein  44.71 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.981571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0923  GntR domain protein  40.28 
 
 		 230 aa  145  5e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0612567  normal  0.0530485 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4108  GntR domain-containing protein  47.57 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.555011  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43480  GntR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 215 aa  141  9e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3646  putative transcriptional regulator  41.38 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.305132  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1422  regulatory protein GntR HTH  44.71 
 
 		 233 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3104  GntR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.804027  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0711  GntR domain protein  43.84 
 
 		 234 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.103859  normal  0.118228 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2805  GntR domain protein  38.89 
 
 		 226 aa  138  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0232435 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0977  GntR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 219 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1084  regulatory protein GntR HTH  41.67 
 
 		 226 aa  135  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00753008  hitchhiker  0.00000253482 
 
 
-
 
NC_004310  BR0560  GntR family transcriptional regulator  38.84 
 
 		 337 aa  131  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.925079  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6865  GntR family transcriptional regulator  41.75 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0976  GntR domain-containing protein  39.11 
 
 		 216 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.664678  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3919  transcriptional regulator GntR family  40.95 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1707  GntR domain protein  41.21 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0561  GntR family transcriptional regulator  40.09 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0903  GntR domain protein  43.4 
 
 		 224 aa  129  5.0000000000000004e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4247  GntR domain-containing protein  39.9 
 
 		 216 aa  129  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0969  GntR family transcriptional regulator  38.61 
 
 		 216 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1578  GntR domain protein  33.18 
 
 		 230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00244066  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1342  GntR domain protein  38.5 
 
 		 229 aa  125  7e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00721185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4621  GntR domain protein  38.21 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.471492  normal  0.10805 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4353  GntR domain protein  37.26 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.217237 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4257  transcriptional regulator, GntR family  35.15 
 
 		 226 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00030759 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1008  GntR domain-containing protein  37.62 
 
 		 216 aa  123  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.19227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0915  GntR domain-containing protein  34.65 
 
 		 226 aa  122  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1162  GntR domain protein  37.75 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.10075  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2703  GntR domain-containing protein  37.09 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.121781  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1180  GntR domain protein  36.79 
 
 		 231 aa  118  9.999999999999999e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3311  GntR domain protein  33.64 
 
 		 218 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.439915  hitchhiker  0.000169806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0366  GntR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 222 aa  108  7.000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.479858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1117  regulatory protein GntR HTH  31.71 
 
 		 222 aa  106  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.377836 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1365  GntR domain-containing protein  37.13 
 
 		 224 aa  106  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2815  GntR domain-containing protein  38.86 
 
 		 264 aa  105  5e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.336695  normal  0.311573 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2341  GntR domain protein  40.86 
 
 		 226 aa  105  6e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1602  GntR domain protein  33.98 
 
 		 222 aa  104  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5489  putative transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  101  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1834  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0450394  normal  0.0643045 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63070  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5356  transcriptional regulator GntR family  36.41 
 
 		 238 aa  99.4  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.780742  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3177  GntR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3633  GntR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 257 aa  98.2  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.744351 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0697  GntR domain-containing protein  34.8 
 
 		 255 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.601248  hitchhiker  0.0000378938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  35.71 
 
 		 243 aa  97.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  35.68 
 
 		 242 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  37.25 
 
 		 231 aa  95.5  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4734  GntR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 255 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.315584  hitchhiker  0.00963759 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1428  GntR family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 245 aa  95.1  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138717  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3004  GntR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0317071  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2802  GntR domain-containing protein  35.55 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2669  GntR domain-containing protein  35.55 
 
 		 237 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5742  GntR domain protein  32.72 
 
 		 233 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.343946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4600  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 255 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.487729  normal  0.0576497 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0023  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0399  GntR domain protein  36.65 
 
 		 224 aa  93.2  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  35.4 
 
 		 258 aa  93.2  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5703  transcriptional regulator GntR family  32.87 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  33.66 
 
 		 233 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0020  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 246 aa  93.6  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4735  GntR domain-containing protein  34.5 
 
 		 255 aa  93.6  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0362  GntR domain-containing protein  35.81 
 
 		 261 aa  92.4  6e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  37.68 
 
 		 226 aa  92  7e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5064  regulatory protein GntR HTH  34.8 
 
 		 242 aa  91.3  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26860  GntR family regulatory protein  34.47 
 
 		 241 aa  90.9  2e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3372  GntR domain-containing protein  32.58 
 
 		 299 aa  90.5  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0763  GntR domain protein  35.8 
 
 		 239 aa  90.1  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 236 aa  90.1  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  33.18 
 
 		 234 aa  90.1  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4745  GntR domain-containing protein  31.9 
 
 		 249 aa  89.7  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00100625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0754  GntR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.393325  normal  0.323423 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1624  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 238 aa  89.4  5e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1948  GntR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0263216  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5449  GntR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 247 aa  88.6  9e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.179216  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7351  transcriptional regulator GntR family  34.12 
 
 		 284 aa  88.2  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3543  GntR family transcriptional regulator  31 
 
 		 242 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5344  GntR domain protein  33.64 
 
 		 242 aa  87.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509013 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3756  GntR domain protein  31.68 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5932  GntR domain protein  35.98 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  33.82 
 
 		 229 aa  86.7  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3305  GntR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 251 aa  86.3  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1991  transcriptional regulator PdhR  35.11 
 
 		 256 aa  86.3  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0403  GntR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 261 aa  86.3  4e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3321  GntR domain-containing protein  35.16 
 
 		 240 aa  86.3  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>