More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  100 
 
 
346 aa  682    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  70.91 
 
 
365 aa  498  1e-140  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  73.23 
 
 
347 aa  444  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  63.41 
 
 
346 aa  389  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  57.49 
 
 
356 aa  366  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  56.08 
 
 
347 aa  359  4e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  55.56 
 
 
356 aa  356  2.9999999999999997e-97  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  56.97 
 
 
348 aa  349  4e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  56.2 
 
 
355 aa  347  2e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  53.47 
 
 
346 aa  336  5e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  51.81 
 
 
346 aa  326  4.0000000000000003e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  54.05 
 
 
352 aa  325  5e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  49.86 
 
 
357 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  51.01 
 
 
355 aa  320  1.9999999999999998e-86  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  50.58 
 
 
349 aa  312  5.999999999999999e-84  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  49.55 
 
 
366 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  51.23 
 
 
346 aa  298  1e-79  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  47.99 
 
 
376 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  49.69 
 
 
365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  45.89 
 
 
358 aa  280  3e-74  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  45.38 
 
 
357 aa  276  4e-73  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  45.8 
 
 
348 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  45.09 
 
 
351 aa  263  2e-69  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  44.35 
 
 
351 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  44.35 
 
 
351 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  44.35 
 
 
351 aa  258  1e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  41.14 
 
 
335 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  43.27 
 
 
353 aa  251  1e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  42.57 
 
 
353 aa  249  4e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  43.32 
 
 
345 aa  232  8.000000000000001e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  38.19 
 
 
354 aa  205  7e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  38.19 
 
 
354 aa  204  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  38 
 
 
353 aa  203  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  33.71 
 
 
445 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  33.05 
 
 
449 aa  190  4e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  33.13 
 
 
449 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  33.13 
 
 
449 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  37.74 
 
 
431 aa  186  4e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1910  hypothetical protein  31.71 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
437 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0455  conserved hypothetical protein, putative efflux protein (DUF21 domain protein)  33.23 
 
 
456 aa  183  4.0000000000000006e-45  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.844865  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  31.53 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  31.53 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  31.53 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  31.53 
 
 
435 aa  182  6e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  31.53 
 
 
435 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  34.83 
 
 
446 aa  182  8.000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  36.39 
 
 
358 aa  182  9.000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  31.71 
 
 
435 aa  181  1e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  31.53 
 
 
435 aa  181  1e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0176  transporter, putative  30.95 
 
 
428 aa  181  2e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  31.23 
 
 
435 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  31.23 
 
 
435 aa  181  2e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  34.29 
 
 
440 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  33.91 
 
 
432 aa  179  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1954  hypothetical protein  36.17 
 
 
574 aa  178  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0113455  normal  0.562335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 
486 aa  177  3e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  33.91 
 
 
432 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.62 
 
 
432 aa  176  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.98 
 
 
446 aa  176  5e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2502  hypothetical protein  31.93 
 
 
437 aa  176  5e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.75 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.75 
 
 
432 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  33.04 
 
 
361 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.92 
 
 
425 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  34.51 
 
 
433 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.46 
 
 
432 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31520  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  33.04 
 
 
432 aa  173  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  33.52 
 
 
446 aa  173  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  31.76 
 
 
442 aa  173  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.24 
 
 
443 aa  173  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  31.76 
 
 
442 aa  173  5e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.47 
 
 
440 aa  173  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.14 
 
 
446 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  31.47 
 
 
442 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.83 
 
 
435 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  33.63 
 
 
490 aa  171  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0047  hypothetical protein  35.92 
 
 
520 aa  171  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 
444 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  35.05 
 
 
337 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.01 
 
 
442 aa  171  2e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.47 
 
 
442 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.88 
 
 
442 aa  170  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.88 
 
 
442 aa  169  7e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.18 
 
 
442 aa  169  8e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.47 
 
 
440 aa  169  8e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  35.69 
 
 
344 aa  169  9e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  34.54 
 
 
443 aa  169  9e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.18 
 
 
442 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  34.15 
 
 
333 aa  169  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  31.53 
 
 
448 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0191  putative transporter  31.25 
 
 
428 aa  167  2e-40  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  31.38 
 
 
441 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  36.78 
 
 
474 aa  167  2.9999999999999998e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.43 
 
 
430 aa  167  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0214  transporter, putative  31.25 
 
 
428 aa  166  4e-40  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
428 aa  165  9e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.42 
 
 
442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>