More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_09300 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_09300  MoxR-like ATPase  100 
 
 
353 aa  692    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.293908 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2336  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  85.44 
 
 
355 aa  519  1e-146  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00989852  decreased coverage  0.000000618175 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2518  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  82.01 
 
 
342 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2447  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  78.85 
 
 
331 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000279611 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1832  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75.23 
 
 
327 aa  493  9.999999999999999e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0761844  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1408  AAA family ATPase  70.64 
 
 
336 aa  480  1e-134  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.174801  decreased coverage  0.00669065 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2500  ATPase  75.45 
 
 
327 aa  479  1e-134  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.352977  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4821  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  75 
 
 
354 aa  479  1e-134  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5846  ATPase  75.96 
 
 
346 aa  468  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.666106  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2716  ATPase  72.59 
 
 
342 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0331951  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3819  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  79.87 
 
 
332 aa  470  1.0000000000000001e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0427494  normal  0.0142776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7598  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  77.24 
 
 
320 aa  465  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0066135  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5455  ATPase  75 
 
 
320 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.390863  normal  0.421522 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3749  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.42 
 
 
327 aa  462  1e-129  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4860  ATPase  74.36 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1845  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  68.44 
 
 
326 aa  459  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4949  ATPase  74.36 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5228  ATPase  74.36 
 
 
329 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.537917  normal  0.162755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13723  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR2  67.23 
 
 
358 aa  454  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.861123  normal  0.434695 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3910  ATPase  74.77 
 
 
332 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0582346  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20690  MoxR-like ATPase  70.79 
 
 
340 aa  451  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.138823  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4048  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  76.6 
 
 
340 aa  442  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1337  ATPase  75 
 
 
320 aa  444  1e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.384179 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0759  AAA_3 ATPase associated with various cellular activities  73.9 
 
 
351 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605957  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1835  ATPase  57.52 
 
 
315 aa  363  2e-99  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2509  ATPase  54.9 
 
 
315 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0074  ATPase  53.59 
 
 
315 aa  347  2e-94  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2293  ATPase associated with various cellular activities  52.81 
 
 
316 aa  331  1e-89  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0121  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.12 
 
 
315 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.13785  hitchhiker  0.00112099 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1713  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.12 
 
 
318 aa  325  6e-88  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0920978  hitchhiker  0.00500993 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3126  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.22 
 
 
318 aa  325  9e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.336676  normal  0.404825 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0164  ATPase  52.72 
 
 
319 aa  323  3e-87  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4333  moxR protein, putative  49.09 
 
 
349 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0345  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.92 
 
 
310 aa  313  1.9999999999999998e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.898086  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2089  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.45 
 
 
332 aa  313  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4025  ATPase  48.55 
 
 
346 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.732466  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0615  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.31 
 
 
319 aa  312  5.999999999999999e-84  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.558521  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2136  MoxR-like ATPase, regulator  45.31 
 
 
326 aa  311  7.999999999999999e-84  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1054  ATPase  48.05 
 
 
318 aa  309  4e-83  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3847  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.69 
 
 
328 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2229  ATPase  46.08 
 
 
337 aa  305  6e-82  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4963  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.16 
 
 
329 aa  303  3.0000000000000004e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000842987 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09798  magnesium chelatase, subunit I, putative ATPase  43.07 
 
 
340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2678  ATPase  53.27 
 
 
320 aa  303  4.0000000000000003e-81  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38370  hypothetical protein  51.46 
 
 
328 aa  302  5.000000000000001e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4443  ATPase  49.67 
 
 
333 aa  302  7.000000000000001e-81  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.259464  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  48.88 
 
 
323 aa  302  7.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1323  ATPase  43.73 
 
 
309 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.305812  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2870  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.98 
 
 
324 aa  301  9e-81  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.648175  normal  0.0812651 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
318 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2204  putative magnesium chelatase  44.27 
 
 
328 aa  300  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.107246  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1592  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.19 
 
 
325 aa  300  3e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.488895  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2551  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.53 
 
 
331 aa  298  8e-80  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0032  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.63 
 
 
318 aa  298  9e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.062228  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.48 
 
 
321 aa  298  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1478  ATPase  52.12 
 
 
340 aa  298  1e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.000160729  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  46.1 
 
 
312 aa  298  1e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0622  ATPase  48.38 
 
 
327 aa  297  2e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2398  ATPase  47.48 
 
 
324 aa  296  3e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.873685 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.28 
 
 
347 aa  296  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3320  ATPase  49.35 
 
 
347 aa  296  4e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4904  ATPase  44.55 
 
 
325 aa  296  5e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.128698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0413  methanol dehydrogenase regulatory protein  48.4 
 
 
325 aa  295  6e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1945  ATPase  49.22 
 
 
320 aa  295  7e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1579  MoxR family ATPase  43.87 
 
 
331 aa  295  8e-79  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0600  ATPase  43.38 
 
 
309 aa  295  8e-79  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0120764  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0154  ATPase  51.96 
 
 
320 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56160  hypothetical protein  49.35 
 
 
335 aa  295  9e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0163  ATPase  51.96 
 
 
320 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.489404  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0144  ATPase  51.96 
 
 
320 aa  295  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0244159 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0402  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50 
 
 
317 aa  295  1e-78  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.319786  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1781  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.88 
 
 
327 aa  294  1e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.0560879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0187  ATPase  46.69 
 
 
313 aa  294  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0464  ATPase AAA_3  51.11 
 
 
318 aa  294  2e-78  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.58496  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2295  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.65 
 
 
332 aa  293  2e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.459275  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2455  ATPase  45.43 
 
 
332 aa  294  2e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0476  ATPase  50.33 
 
 
317 aa  294  2e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4891  hypothetical protein  49.35 
 
 
335 aa  293  3e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.233376  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13185  methanol dehydrogenase transcriptional regulatory protein moxR3  51.47 
 
 
320 aa  291  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.585917 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  47.87 
 
 
310 aa  291  1e-77  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0095  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  52.46 
 
 
342 aa  291  2e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3911  methanol dehydrogenase regulatory protein  52.73 
 
 
325 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0358591  normal  0.240116 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1353  ATPase  41.97 
 
 
309 aa  290  3e-77  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.130927  hitchhiker  0.00000046022 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0222  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.9 
 
 
332 aa  290  3e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.876076  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.48 
 
 
320 aa  289  4e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0237  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.62 
 
 
325 aa  289  4e-77  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  44.81 
 
 
308 aa  289  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.48 
 
 
320 aa  289  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0601  ATPase  45.83 
 
 
328 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.122175  normal  0.0641018 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.15 
 
 
320 aa  289  6e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  45.74 
 
 
320 aa  289  6e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.74 
 
 
320 aa  288  7e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.65 
 
 
319 aa  288  7e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0494  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  49.18 
 
 
313 aa  288  9e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  48.15 
 
 
320 aa  288  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0517  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  41.03 
 
 
329 aa  288  1e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000124514  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  48.15 
 
 
320 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0653  ATPase  44.13 
 
 
315 aa  286  4e-76  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.642652  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0473  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.52 
 
 
320 aa  286  5e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0153  methanol dehydrogenase regulator  41.95 
 
 
330 aa  286  5.999999999999999e-76  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.442514  normal  0.724123 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>