More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08980 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08980  glycosyl transferase  100 
 
 
329 aa  654    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.150997 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12320  glycosyl transferase  31.8 
 
 
343 aa  105  1e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0961  glycosyl transferase family protein  50 
 
 
302 aa  104  2e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.121689  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0321  glycosyl transferase family protein  31.54 
 
 
342 aa  100  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3393  glycosyl transferase family protein  29.95 
 
 
324 aa  100  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1059  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  29.02 
 
 
326 aa  100  4e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.113475  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  39.65 
 
 
760 aa  99  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0703  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
348 aa  98.6  1e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  6.39468e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2524  glycosyl transferase family 2  36.09 
 
 
337 aa  97.4  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0357419 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2950  glycosyl transferase family protein  51.58 
 
 
347 aa  96.7  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.32753  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2900  glycosyl transferase family 2  29.18 
 
 
349 aa  96.3  6e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0636  family 2 glycosyl transferase  36.84 
 
 
785 aa  96.3  7e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.678698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0186  glycosyl transferase family protein  35.22 
 
 
348 aa  95.9  8e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4118  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.910618  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4042  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
344 aa  95.1  1e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.24261  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0269  glycosyl transferase family protein  35.4 
 
 
346 aa  94.4  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1165  glycosyl transferase CpsO(V)  32.52 
 
 
327 aa  94.4  3e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0353426  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3951  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
344 aa  94.4  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.174357  normal  0.660654 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1106  glycosyl transferase  40.94 
 
 
215 aa  93.6  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.648038  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3827  putative glycosyl transferase  30.91 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0526095  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4032  putative glycosyl transferase  32.27 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0315657  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4840  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
337 aa  93.2  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00151484  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3520  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  26.41 
 
 
323 aa  93.2  5e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3987  putative glycosyl transferase  32.27 
 
 
344 aa  93.2  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1085  glycosyl transferase family 2  24.71 
 
 
329 aa  93.2  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1087  glycosyl transferase family 2  40.18 
 
 
209 aa  92.8  6e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.674225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29970  Glycosyl transferase, family 2 protein  38.57 
 
 
292 aa  92.8  7e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2371  glycosyltransferase  27.98 
 
 
326 aa  92.4  9e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03473  predicted glycosyl transferase  30.45 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.320225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0090  glycosyl transferase family 2  30.45 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0093  putative glycosyl transferase  30.45 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.516407  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1164  glycosyl transferase CpsJ(V)  31.71 
 
 
321 aa  92  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.183991  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03424  hypothetical protein  30.45 
 
 
344 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.245637  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1081  glycosyl transferase family protein  35.24 
 
 
324 aa  92  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0364187  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1441  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  24.91 
 
 
322 aa  91.7  1e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.692478  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  44.95 
 
 
1250 aa  92  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  33.95 
 
 
373 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0118  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.83 
 
 
351 aa  91.3  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000526958 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3925  putative glycosyl transferase  32.27 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3906  putative glycosyl transferase  32.27 
 
 
344 aa  91.3  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66206  normal  0.305957 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1847  glycosyl transferase family 2  29.68 
 
 
1116 aa  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.944284  normal  0.0115409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3044  glycosyl transferase family protein  36.43 
 
 
297 aa  91.7  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4579  glycosyl transferase family 2  42.31 
 
 
347 aa  90.9  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1428  hypothetical protein  30 
 
 
346 aa  90.5  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.166911  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0132  glycosyl transferase family protein  43.48 
 
 
597 aa  90.1  4e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1145  general glycosylation pathway protein  29.69 
 
 
309 aa  90.5  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5387  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.63 
 
 
350 aa  90.1  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1578  cell wall membrane glycosyltransferase  30.54 
 
 
349 aa  89.7  5e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0754  glycosyl transferase family 2  31.02 
 
 
341 aa  90.1  5e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.909004 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0297  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  31.4 
 
 
970 aa  90.1  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2006  glycosyl transferase family protein  44.23 
 
 
351 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0755344 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1457  glycosyl transferase family protein  37.6 
 
 
341 aa  89.7  6e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00556553  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0619  glycosyl transferase family 2  44.66 
 
 
310 aa  89  9e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5165  CDP-glycerol:poly(glycerophosphate) glycerophosphotransferase  34.09 
 
 
1168 aa  89  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.390829 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1270  general glycosylation pathway protein  29.69 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.553122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1723  glycosyl transferase family 2  30.74 
 
 
398 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.195684  normal  0.0245035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1267  putative glycosyl transferase  30.86 
 
 
300 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1268  glycosyl transferase family 2  34.68 
 
 
369 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.6355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1455  glycosyl transferase, group 2 family protein  32.88 
 
 
295 aa  87.8  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.937083  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2014  glycosyl transferase family protein  28.26 
 
 
303 aa  87.8  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0488163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5438  N-acetylglucosaminyltransferase  27.23 
 
 
353 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0647  glycosyl transferase family protein  33.33 
 
 
354 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1163  lipooligosaccharide biosynthesis glycosyltransferase  31.54 
 
 
275 aa  88.2  2e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0532064  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0593  general glycosylation pathway protein  29.26 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.422601  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1728  glycosyl transferase family 2  34.03 
 
 
573 aa  87.4  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230858 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1695  glycosyl transferase family protein  46.32 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0898  sugar transferase  28.05 
 
 
333 aa  87.4  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.137243  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0642  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  30.84 
 
 
1157 aa  87  4e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4093  putative glycosyl transferase  31.36 
 
 
344 aa  87  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26480  glycosyl transferase  36.33 
 
 
672 aa  87  4e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0232  glycosyl transferase family 2  31.78 
 
 
276 aa  87  4e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3031  glycosyl transferase family protein  39.22 
 
 
249 aa  86.7  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.170793 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2363  glycosyltransferase  42.86 
 
 
301 aa  86.7  5e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  35.59 
 
 
321 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0838  glycosyl transferase family protein  39.09 
 
 
324 aa  86.7  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.115028  normal  0.0515861 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1971  glycosyl transferase family protein  40.66 
 
 
418 aa  86.3  6e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0540831 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2980  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  39.34 
 
 
317 aa  86.3  6e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.815971 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1355  glycosyl transferase family protein  39.81 
 
 
310 aa  86.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3275  glycosyl transferase family 2  44.63 
 
 
362 aa  86.3  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.355424  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.48 
 
 
1015 aa  86.3  7e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2953  glycosyl transferase family 2  42.06 
 
 
397 aa  85.9  9e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.831757 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1260  glycosyl transferase family protein  35.88 
 
 
309 aa  85.1  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.736334  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0843  glycosyl transferase family protein  33.56 
 
 
316 aa  85.1  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.273314  hitchhiker  0.00465248 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2176  glycosyl transferase family protein  37.32 
 
 
455 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0343  glycosyl transferase family protein  37.86 
 
 
302 aa  85.5  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00301214  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1199  CDP- glycerol:poly(glycerophosphate)glycerophosph otransferase  33.04 
 
 
941 aa  85.1  0.000000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.457578 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1626  glycosyl transferase family protein  35.61 
 
 
299 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07275  glycosyl transferase  33.06 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170431  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4597  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5397  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.14 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0830  glycosyl transferase family 2  41.51 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0503385  normal  0.0971382 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3947  glycosyl transferase family protein  36.45 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0633  glycosyl transferase family 2  41.28 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.718934 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2974  WbdN  35 
 
 
260 aa  84.7  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0521919  hitchhiker  0.0000000316715 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1346  glycosyl transferase  31 
 
 
697 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.938308  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5552  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  31.14 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5610  beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase  37.27 
 
 
326 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0575  glycosyl transferase family 2  34.04 
 
 
320 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.910069  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2888  glycosyl transferase family protein  35 
 
 
247 aa  84  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.468847  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  34.75 
 
 
321 aa  84  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>