19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  100 
 
 
134 aa  266  7e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  50.88 
 
 
146 aa  116  9e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  38.35 
 
 
147 aa  100  5e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  37.14 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2354  hypothetical protein  42.86 
 
 
130 aa  75.1  0.0000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.00810351  hitchhiker  0.0000298735 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2414  hypothetical protein  40.78 
 
 
136 aa  70.5  0.000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.437891 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8188  hypothetical protein  39.18 
 
 
159 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3792  hypothetical protein  25.21 
 
 
126 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3150  hypothetical protein  27.87 
 
 
131 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.834226  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  27.83 
 
 
126 aa  55.5  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5208  hypothetical protein  29.7 
 
 
135 aa  54.7  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.954261  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3251  hypothetical protein  28.04 
 
 
127 aa  54.3  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.072777  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  28 
 
 
118 aa  52  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3052  hypothetical protein  28.57 
 
 
127 aa  51.2  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  25.51 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  28.7 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  23.08 
 
 
121 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  25.69 
 
 
116 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  26.51 
 
 
117 aa  40.4  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>