More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08820  glycosyltransferase  100 
 
 		 1188 aa  2383    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.338698  normal  0.471651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  40.67 
 
 		 569 aa  259  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0161  group 1 glycosyl transferase  38.94 
 
 		 557 aa  255  4.0000000000000004e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.725512  normal  0.434768 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  41 
 
 		 575 aa  250  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  37.62 
 
 		 564 aa  241  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  35.44 
 
 		 405 aa  219  2.9999999999999998e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  35.45 
 
 		 411 aa  208  6e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 406 aa  205  3e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0289  glycosyl transferase, group 1  34.54 
 
 		 405 aa  202  5e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1973  glycosyl transferase, group 1  35.41 
 
 		 416 aa  201  6e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0293  glycosyl transferase, group 1  33.49 
 
 		 406 aa  196  3e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.551542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  34.63 
 
 		 401 aa  192  2e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26850  glycosyltransferase  33.2 
 
 		 573 aa  192  2.9999999999999997e-47  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0670  glycosyl transferase, group 1  34.47 
 
 		 405 aa  191  5.999999999999999e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26810  glycosyltransferase  32.33 
 
 		 723 aa  187  1.0000000000000001e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08970  glycosyltransferase  33.04 
 
 		 601 aa  176  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3178  glycosyl transferase, group 1  33.09 
 
 		 402 aa  168  6.9999999999999995e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27990  glycosyltransferase  34.12 
 
 		 603 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0581  glycosyl transferase, group 1  31.85 
 
 		 405 aa  162  3e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4821  glycosyl transferase, group 1  31.99 
 
 		 401 aa  157  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.726751  normal  0.695392 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0635  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 403 aa  122  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4282  glycosyl transferase, group 1  27.93 
 
 		 396 aa  121  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.89 
 
 		 400 aa  120  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4968  hypothetical protein  25.89 
 
 		 906 aa  114  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3271  glycosyl transferase group 1  31.97 
 
 		 768 aa  114  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3107  glycosyl transferase, group 1  32.22 
 
 		 475 aa  109  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.27638  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  32.77 
 
 		 415 aa  104  8e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3705  hypothetical protein  28.15 
 
 		 557 aa  104  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.483181  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2141  glycosyltransferase  26.37 
 
 		 416 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00102383  normal  0.405566 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5513  hypothetical protein  23.32 
 
 		 896 aa  99.4  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5121  hypothetical protein  23.32 
 
 		 908 aa  99  5e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5363  hypothetical protein  23.32 
 
 		 896 aa  97.4  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1424  glycosyl transferase group 1  30.92 
 
 		 440 aa  90.5  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3328  glycosyl transferase, group 1  27.82 
 
 		 412 aa  89.7  3e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.311631 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0616  glycosyltransferase, group 1  28.63 
 
 		 414 aa  88.2  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0767  glycosyl transferase group 1  28.63 
 
 		 414 aa  88.2  9e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3878  glycosyl transferase group 1  25.48 
 
 		 535 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3940  glycosyl transferase group 1  29.79 
 
 		 402 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0393  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 403 aa  85.9  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.190389  normal  0.881453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1365  glycosyl transferase group 1  26.94 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000226511 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1805  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 		 372 aa  84.7  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8037  hypothetical protein  25 
 
 		 560 aa  84.7  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1534  glycosyl transferase group 1  24.66 
 
 		 407 aa  84.3  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.994246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3250  glycosyl transferase group 1  29.3 
 
 		 360 aa  84  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2434  glycosyl transferase, group 1  29.95 
 
 		 386 aa  84  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.433213 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4499  glycosyl transferase group 1  26.57 
 
 		 408 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  25.62 
 
 		 408 aa  82.4  0.00000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2807  glycosyl transferase group 1  30.28 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0360  glycosyl transferase group 1  23.72 
 
 		 412 aa  81.6  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 405 aa  81.3  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0585  glycosyl transferase group 1  22.22 
 
 		 415 aa  80.9  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1502  glycosyl transferase, group 1  26.98 
 
 		 420 aa  80.9  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3826  glycosyl transferase group 1  28.74 
 
 		 409 aa  81.3  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.762475  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0206  glycosyl transferase, group 1  28.97 
 
 		 399 aa  80.9  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  28.5 
 
 		 390 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0142  glycosyl transferase, group 1  25.99 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1905  glycosyltransferase  26.29 
 
 		 402 aa  79.3  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  23.68 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2257  glucosyltransferase  25.72 
 
 		 426 aa  78.6  0.0000000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.150164  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2383  glycosyl transferase group 1  28.52 
 
 		 398 aa  78.6  0.0000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.501705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0580  glycosyl transferase, group 1  28.15 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1373  glycosyl transferase group 1  21.03 
 
 		 689 aa  78.6  0.0000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167388  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15990  glycosyl transferase group 1  23.84 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5018  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.44 
 
 		 377 aa  77.4  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.437821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1128  glycosyltransferase  24.37 
 
 		 394 aa  77.4  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0685342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.48 
 
 		 453 aa  78.2  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1114  glycosyltransferase (group I)  21.46 
 
 		 404 aa  77  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  25.37 
 
 		 435 aa  75.5  0.000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  26.34 
 
 		 378 aa  75.5  0.000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0143  glycosyltransferase-like protein  25.57 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4035  glycosyl transferase group 1  28.36 
 
 		 421 aa  75.5  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00411563 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1108  glycosyl transferase group 1  30.04 
 
 		 357 aa  75.1  0.000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0280638  normal  0.0326528 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3119  glycosyl transferase, group 1  25.7 
 
 		 412 aa  74.7  0.000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  33.67 
 
 		 391 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1259  glycosyl transferase group 1  29.72 
 
 		 457 aa  74.3  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00525262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  32.54 
 
 		 370 aa  73.9  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5160  glycosyl transferase group 1  25.81 
 
 		 800 aa  73.6  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.170469  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  26.72 
 
 		 419 aa  73.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0139  glycosyl transferase, group 1  30.93 
 
 		 402 aa  73.2  0.00000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.211857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3022  heparinase II/III family protein  22.7 
 
 		 657 aa  73.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000040262  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1992  hypothetical protein  27.88 
 
 		 382 aa  72.8  0.00000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.073088  normal  0.53449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2878  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 380 aa  72.8  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305782 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  29.18 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1032  glycosyl transferase, group 1  30.88 
 
 		 384 aa  72.4  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0183  glycosyl transferase group 1  28.43 
 
 		 406 aa  72  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4446  glycosyl transferase, group 1  29.46 
 
 		 426 aa  72  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.342615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0913  a-glycosyltransferase  25.88 
 
 		 406 aa  71.6  0.00000000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.904555 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0185  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 406 aa  72  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0720154  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0211  glycosyl transferase, group 1 family protein  24 
 
 		 404 aa  71.6  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2081  glycosyl transferase group 1  28.12 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.212135  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3118  glycosyl transferase group 1  25.69 
 
 		 390 aa  71.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.353961  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  30.25 
 
 		 409 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4876  glycosyl transferase group 1  28.88 
 
 		 370 aa  71.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.756058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0297  glycosyl transferase group 1  23.36 
 
 		 416 aa  70.9  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 495 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 499 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.16 
 
 		 443 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>