More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08760 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_08760  glycosyl transferase  100 
 
 
296 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0855056  normal  0.752756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3890  glycosyl transferase family 2  62.91 
 
 
633 aa  298  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0371548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0625  glycosyl transferase family 2  56.67 
 
 
306 aa  278  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1169  glycosyl transferase family 2  56.46 
 
 
615 aa  232  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.390036  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20860  glycosyl transferase  44.71 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1455  glycosyl transferase family 2  40.67 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1773  glycosyl transferase family 2  35.21 
 
 
272 aa  176  3e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.61614  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2146  glycosyl transferase family 2  34.8 
 
 
271 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.125648  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0628  glycosyl transferase family 2  41.52 
 
 
280 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0695  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
270 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01936  putative glycosyltransferase WbbD  32.44 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01923  hypothetical protein  32.44 
 
 
255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1923  glycosyl transferase family 2  31.39 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0969327 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2415  glycosyl transferase family 2  31.8 
 
 
279 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000015495  normal  0.849916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3046  glycosyl transferase family protein  31.41 
 
 
271 aa  123  4e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1022  glycosyl transferase, group 2  26.88 
 
 
273 aa  110  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0371517  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0802  glycosyl transferase family 2  37.5 
 
 
338 aa  102  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.865033  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0353  glycosyl transferase family 2  31.08 
 
 
334 aa  99.8  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0782  glycosyl transferase family protein  32.13 
 
 
274 aa  99  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3227  glycosyl transferase family protein  37.04 
 
 
339 aa  96.3  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000210219  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0849  glycosyl transferase family 2  36.04 
 
 
336 aa  94.7  1e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3460  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.21 
 
 
330 aa  93.2  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0621  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.43 
 
 
367 aa  92.4  7e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2551  glycosyl transferase family 2  32.72 
 
 
336 aa  92.4  8e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5223  glycosyl transferase family protein  29.58 
 
 
321 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3612  glycosyl transferase, group 2 family protein  35.32 
 
 
349 aa  92  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2195  glycosyl transferase family 2  31.42 
 
 
351 aa  90.9  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.496313  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0335  glycosyl transferase family protein  27.06 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0761252  hitchhiker  0.0000358404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5561  glycosyl transferase domain-containing protein  28.64 
 
 
321 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0622  glycosyl transferase, group 2 family protein  34.39 
 
 
341 aa  86.3  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0212  glycosyl transferase family 2  36.68 
 
 
334 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2182  glycosyl transferase family 2  34.65 
 
 
356 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.50846  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4471  glycosyl transferase family 2  34.62 
 
 
353 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.700837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0201  glycosyl transferase family 2  36.44 
 
 
334 aa  85.5  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0767  glycosyl transferase family 2  34.74 
 
 
340 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0444656  normal  0.813996 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2832  glycosyl transferase family protein  24.57 
 
 
287 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0389241  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1648  glycosyl transferase family protein  37.5 
 
 
361 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.206697  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0398  glycosyl transferase family 2  30 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3393  glycosyl transferase family protein  31.34 
 
 
308 aa  84.3  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0190  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
334 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1763  glycosyl transferase family 2  32.39 
 
 
333 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3928  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
305 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.262414 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3840  glycosyl transferase family protein  35.34 
 
 
347 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2742  glycosyl transferase family 2  32.77 
 
 
267 aa  79.7  0.00000000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.569397  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0404  glycosyl transferase family protein  26.17 
 
 
283 aa  79.3  0.00000000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.032023  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01491  hypothetical protein  26.62 
 
 
296 aa  79  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2831  glycosyl transferase family protein  32.54 
 
 
345 aa  79  0.00000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.242472  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1682  glycosyl transferase family protein  27.62 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3881  glycosyl transferase family 2  30.23 
 
 
306 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2329  glycosyl transferase family 2  33.94 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03054  glycosyltransferase  27.73 
 
 
295 aa  77  0.0000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1578  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  8.854379999999999e-20 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2499  glycosyl transferase family protein  30.2 
 
 
274 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0266  glycosyl transferase family protein  29.67 
 
 
341 aa  76.6  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1931  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 
347 aa  76.6  0.0000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.211826  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4680  glycosyl transferase family protein  30.13 
 
 
367 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.359899 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1649  glycosyl transferase family 2  31.5 
 
 
327 aa  74.3  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2740  glycosyl transferase family 2  33.5 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.394138  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2269  glycosyl transferase family protein  30.04 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  0.336808 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3280  glycosyl transferase family 2  28.04 
 
 
341 aa  73.9  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6398  glycosyl transferase family 2  33.07 
 
 
262 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.855353 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0918  glycosyl transferase family 2  28.85 
 
 
276 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1811  glycosyl transferase family 2  27.52 
 
 
280 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0210  glycosyl transferase family protein  37.59 
 
 
334 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.640164  normal  0.0425626 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2747  glycosyl transferase family 2  27.04 
 
 
663 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3636  glycosyl transferase family protein  30 
 
 
322 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.281554  normal  0.0212445 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3338  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
1250 aa  70.1  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0770  glycosyl transferase family protein  30.98 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44450  Glycosyl transferase, family 2 protein  30.18 
 
 
340 aa  68.9  0.00000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3703  putative glycosyl transferase  31.62 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2504  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
373 aa  68.9  0.00000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.695425  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3206  glycosyltransferase  25.79 
 
 
258 aa  68.9  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.623087  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0861  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3988  glycosyl transferase family protein  32.27 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.10621 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13891  hypothetical protein  24.45 
 
 
332 aa  67  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1700  glycosyl transferase family protein  31.19 
 
 
318 aa  67  0.0000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0412  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0891  glycosyl transferase family protein  30.23 
 
 
274 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0211715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0147  glycosyl transferase family 2  24.88 
 
 
338 aa  67  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0781  glycosyl transferase family protein  31.4 
 
 
274 aa  66.6  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
1177 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  29.22 
 
 
1177 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2021  family 2 glycosyl transferase  27.13 
 
 
266 aa  65.5  0.0000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2193  glycosyl transferase, group 2 family protein  30.25 
 
 
278 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.783659  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2548  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793801  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3145  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3085  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0714  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.696355  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2066  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.265648  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02466  glycosyl transferase  27.75 
 
 
286 aa  64.7  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0810983  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4088  glycosyl transferase family protein  32.73 
 
 
1032 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.127971 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0402  glycosyl transferase family 2  31.55 
 
 
342 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3122  glycosyl transferase, group 2 family protein  28.83 
 
 
278 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.541657  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4485  glycosyl transferase family 2  31.67 
 
 
336 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0112223  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0394  glycosyl transferase family 2  33.97 
 
 
364 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0769  glycosyl transferase family 2  27.73 
 
 
352 aa  63.5  0.000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1487  glycosyl transferase, group 2 family protein  29.79 
 
 
278 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0511045  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3267  glycosyl transferase family protein  31.86 
 
 
364 aa  62  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0803351  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5383  glycosyl transferase family 2  29.03 
 
 
304 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1393  glycosyl transferase family protein  25.75 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>