More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08660 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08660  glycosyltransferase  100 
 
 		 484 aa  941    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.773029 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7635  glycosyl transferase group 1  28.71 
 
 		 507 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.212629  normal  0.696625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1691  glycosyl transferase, group 1  29.48 
 
 		 550 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.389067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1385  glycosyl transferase group 1  26.01 
 
 		 415 aa  136  9e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.011099 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1685  glycosyl transferase group 1  34.54 
 
 		 859 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.159285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1689  glycosyl transferase group 1  33.43 
 
 		 540 aa  130  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.224017  hitchhiker  0.00115774 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0958  glycosyl transferase, group 1  28.61 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7648  glycosyl transferase group 1  31.09 
 
 		 388 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2080  glycosyl transferase, group 1  34.46 
 
 		 447 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.371281  normal  0.082698 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1690  glycosyl transferase, group 1  31.53 
 
 		 517 aa  117  3e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.539973  normal  0.752628 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0960  glycosyl transferase, group 1  28.71 
 
 		 430 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0148  capsular polysaccharide synthesis enzyme Cap5I  24.53 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0143  hypothetical protein  24.53 
 
 		 369 aa  116  6.9999999999999995e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1687  glycosyl transferase group 1  31.37 
 
 		 519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00440693 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7642  glycosyl transferase group 1  29.75 
 
 		 516 aa  113  7.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09040  glycosyltransferase  28.93 
 
 		 861 aa  111  3e-23  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.892968  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1854  glycosyl transferase group 1  37.74 
 
 		 377 aa  110  6e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2781  a-glycosyltransferase  25.83 
 
 		 378 aa  102  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.27166  normal  0.140971 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2772  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0584  glycosyl transferase group 1  25.31 
 
 		 373 aa  97.8  4e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.83028  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1604  glycosyl transferase, group 1  26.4 
 
 		 385 aa  94.4  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4643  glycosyl transferase group 1  29.87 
 
 		 518 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.39122  normal  0.263686 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5367  glycosyl transferase, group 1 family protein  21.94 
 
 		 432 aa  87  6e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5518  group 1 family glycosyl transferase  21.94 
 
 		 432 aa  87.4  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4972  glycosyl transferase, group 1; lipopolysaccharide O antigen biosynthesis protein  21.35 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7644  glycosyl transferase group 1  28.66 
 
 		 545 aa  85.5  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.939663  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0354  glycosyl transferase group 1  28.75 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08810  glycosyltransferase  30.74 
 
 		 564 aa  81.6  0.00000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.139018  normal  0.49339 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0391  glycosyl transferase, group 1  24 
 
 		 369 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0999016  normal  0.0192466 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5126  glycosyl transferase, group 1 family protein  22.32 
 
 		 424 aa  80.9  0.00000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1334  glycosyl transferase group 1  35.14 
 
 		 385 aa  79.7  0.0000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3120  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1243  glycosyl transferase group 1  24.13 
 
 		 366 aa  76.6  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.160132  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4489  glycosyl transferase group 1  26.96 
 
 		 417 aa  74.3  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2517  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.0541201 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3605  glycosyl transferase, group 1  27.16 
 
 		 405 aa  72  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2584  glycosyl transferase, group 1  27.76 
 
 		 434 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1851  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.7 
 
 		 400 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.182301  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0228  glycosyl transferase, group 1  28.25 
 
 		 401 aa  69.7  0.0000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.631935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1295  glycosyl transferase group 1  25.18 
 
 		 522 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1746  glycosyl transferase, group 1  33.33 
 
 		 346 aa  69.7  0.0000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.418679  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12220  glycosyltransferase  28.88 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.296579  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4294  glycosyl transferase group 1  27.22 
 
 		 405 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.458687 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3833  glycosyl transferase, group 1  23.65 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15860  glycogen synthase  28.35 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.121629  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5881  glycosyl transferase group 1  30.95 
 
 		 419 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.30943  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3248  glycosyl transferase group 1  26.36 
 
 		 418 aa  67.4  0.0000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  26.42 
 
 		 434 aa  67  0.0000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1373  glycosyl transferase group 1  31.49 
 
 		 447 aa  67  0.0000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.3 
 
 		 405 aa  66.6  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3851  glycosyl transferase group 1  30.1 
 
 		 575 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0448869  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1003  hypothetical protein  29.38 
 
 		 416 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.911969  normal  0.550503 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2753  glycosyl transferase group 1  26.47 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1065  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.553519 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  28.95 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20960  hypothetical protein  29.02 
 
 		 373 aa  64.7  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3307  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 		 392 aa  64.7  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.322102 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1942  glycosyl transferase group 1  31.02 
 
 		 410 aa  64.3  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1773  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 395 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.255806  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4438  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 370 aa  64.3  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.356751  normal  0.769914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0324  glycosyl transferase, group 1  23.32 
 
 		 400 aa  63.9  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.546563  normal  0.700296 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4271  glycosyl transferase group 1  29.47 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0411  glycosyl transferase group 1  23.47 
 
 		 370 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.482672  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0612  glycosyl transferase group 1  27.48 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5252  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0241  glycosyl transferase group 1  23.18 
 
 		 371 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.514608  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0250  glycosyl transferase, group 1  28.7 
 
 		 378 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0137  glycosyl transferase, group 1  28 
 
 		 411 aa  63.2  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0776455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1510  glycosyl transferase, group 1  32.45 
 
 		 415 aa  63.2  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2391  glycosyl transferase, group 1  25.32 
 
 		 382 aa  62  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.481702  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0666  glycosyl transferase, group 1  26.39 
 
 		 381 aa  62.4  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000035657 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1120  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 386 aa  62.8  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.233547  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2409  glycosyl transferase, group 1  26.18 
 
 		 406 aa  62  0.00000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3241  lipopolysaccharide core biosynthesis mannosyltransferase  28.85 
 
 		 349 aa  61.6  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0171  glycosyl transferase, group 1  27.53 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0678  glycosyl transferase, group 1  27.59 
 
 		 411 aa  61.6  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0695146  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2737  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 		 416 aa  61.2  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.829529  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1354  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.39 
 
 		 382 aa  61.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3096  glycosyl transferase, group 1  31.98 
 
 		 439 aa  61.2  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.332935  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4282  glycosyl transferase group 1  24.2 
 
 		 405 aa  61.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.870736  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2858  group 1 glycosyl transferase  24.9 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1032  glycosyl transferase group 1  26.38 
 
 		 390 aa  60.8  0.00000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2160  glycosyl transferase group 1  27.97 
 
 		 517 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2253  hypothetical protein  24.1 
 
 		 386 aa  60.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0192058  hitchhiker  0.00258376 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  26.36 
 
 		 348 aa  60.8  0.00000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  26.02 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2234  glycosyl transferase, group 1  26.96 
 
 		 380 aa  60.8  0.00000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1374  glycosyl transferase group 1  26.46 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0717655  normal  0.0508272 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  26.02 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1303  glycosyl transferase, group 1  23.2 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0792  glycosyl transferase group 1  25.24 
 
 		 384 aa  60.1  0.00000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0375  Glycosyltransferase-like protein  27.09 
 
 		 569 aa  60.1  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  26.88 
 
 		 440 aa  60.1  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0634  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.73 
 
 		 398 aa  60.1  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.888697  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  28.04 
 
 		 409 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1224  glycosyl transferase, group 1  27.47 
 
 		 372 aa  59.3  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2345  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 391 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5195  glycosyl transferase group 1  25.26 
 
 		 396 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3048e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>