More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08600 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08600  glycosyl transferase  100 
 
 		 225 aa  463  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.36917 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2592  glycosyl transferase family 2  69.41 
 
 		 235 aa  314  6e-85  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20890  glycosyl transferase  54.38 
 
 		 239 aa  256  2e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3897  glycosyl transferase family 2  59.81 
 
 		 215 aa  254  9e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.907985  normal  0.0281137 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8172  glycosyl transferase family 2  52.05 
 
 		 228 aa  224  8e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0992  glycosyl transferase family 2  48.86 
 
 		 240 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.861872  hitchhiker  0.00252858 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0757  glycosyl transferase family protein  46.61 
 
 		 226 aa  203  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.861392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0602  glycosyl transferase family 2  49.77 
 
 		 233 aa  202  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13662  glycosyltransferase  43.86 
 
 		 237 aa  194  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0122731 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0734  glycosyl transferase family protein  34.96 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0939265  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0490  glycosyl transferase family protein  33.94 
 
 		 230 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.49136  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1238  glycosyl transferase family protein  39.05 
 
 		 340 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0299197  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0418  glycosyl transferase family protein  33.19 
 
 		 230 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0496978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0417  glycosyl transferase family protein  32.46 
 
 		 230 aa  113  3e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.304436  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1501  glycosyl transferase family protein  32.74 
 
 		 230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0720079  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1061  glycosyl transferase family 2  36.82 
 
 		 448 aa  108  5e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1230  glycosyl transferase family 2  33.16 
 
 		 340 aa  106  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0165  glycosyl transferase family protein  30.41 
 
 		 321 aa  103  2e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000128177 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0220  glycosyl transferase family 2  31.37 
 
 		 353 aa  101  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0396  glycosyl transferase family protein  31.94 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.54121  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1821  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 		 237 aa  99.8  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2408  glycosyl transferase family 2  31.13 
 
 		 293 aa  99.8  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2228  glycosyl transferase family protein  32.88 
 
 		 229 aa  99.4  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000017115 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5098  glycosyl transferase family protein  33.65 
 
 		 336 aa  99  6e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2396  glycosyl transferase family protein  30.99 
 
 		 313 aa  99  6e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2133  glycosyl transferase family 2  33.98 
 
 		 340 aa  97.4  1e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0441778  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2653  glycosyltransferase  32.47 
 
 		 389 aa  96.3  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2109  b-glycosyltransferase  31.98 
 
 		 400 aa  96.7  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0591091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1305  glycosyl transferase family protein  30.57 
 
 		 229 aa  94.7  1e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0400  glycosyl transferase family protein  25.7 
 
 		 344 aa  93.6  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.156434  normal  0.0492083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2209  glycosyl transferase family 2  31.28 
 
 		 220 aa  92.8  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0581  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 228 aa  92.8  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.529493  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1366  glycosyl transferase family protein  29.32 
 
 		 228 aa  92  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000927738 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1132  dolichol-phosphate mannosyltransferase  34.54 
 
 		 299 aa  92  7e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1971  glycosyl transferase family protein  32.87 
 
 		 347 aa  91.7  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2933  glycosyl transferase family 2  32.35 
 
 		 355 aa  90.9  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.175593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0985  cell wall biogenesis glycosyltransferase  28.87 
 
 		 247 aa  90.1  2e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0589  glycosyl transferase family protein  29.05 
 
 		 226 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1686  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 		 220 aa  89.7  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000734571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0087  glycosyl transferase family 2  31.4 
 
 		 450 aa  89.4  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0090  glycosyl transferase family 2  34.87 
 
 		 252 aa  89  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0245  glycosyl transferase, group 2 family protein  31.91 
 
 		 220 aa  88.6  7e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3616  glycosyl transferase family protein  30.77 
 
 		 222 aa  88.6  7e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00297369  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1311  glycosyl transferase family 2  32.08 
 
 		 261 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3149  glycosyl transferase family 2  33.81 
 
 		 245 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.754874  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3051  glycosyl transferase family protein  34.29 
 
 		 245 aa  86.7  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3039  methyltransferase type 12  30.91 
 
 		 578 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3793  glycosyl transferase family protein  30.28 
 
 		 237 aa  86.3  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3898  glycosyl transferase family 2  33.68 
 
 		 285 aa  85.5  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3250  glycosyl transferase family 2  34.54 
 
 		 245 aa  85.1  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0680662  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0921  glycosyl transferase family protein  32.79 
 
 		 399 aa  85.1  8e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0044  glycosyltransferase  29.53 
 
 		 352 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000117079  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02881  glycosyltransferase  31.61 
 
 		 273 aa  82  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1872  glycosyl transferase family 2  27.84 
 
 		 401 aa  81.6  0.000000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803329  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2870  glycosyl transferase family 2  27.15 
 
 		 227 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000193907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0320  glycosyl transferase family protein  28.44 
 
 		 567 aa  81.3  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00187922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8133  glycosyl transferase, family 2  32.56 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.314026  normal  0.0482114 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3050  glycosyl transferase family 2  27.18 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3242  glycosyl transferase family protein  28.37 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412321 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2302  glycosyl transferase family protein  26.64 
 
 		 287 aa  80.1  0.00000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3099  glycosyl transferase family protein  27.18 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000071788  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2273  glycosyl transferase family 2  30.77 
 
 		 295 aa  79.3  0.00000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3944  glycosyl transferase family protein  29.86 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1961  glycosyl transferase family 2  30.29 
 
 		 230 aa  79.3  0.00000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00401817  hitchhiker  0.00275199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2413  glycosyl transferase family 2  33.12 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.367693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0471  glycosyl transferase family 2  30.24 
 
 		 246 aa  79.3  0.00000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1079  glycosyl transferase family protein  25.5 
 
 		 395 aa  79  0.00000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5607  glycosyl transferase family 2  29.86 
 
 		 242 aa  79  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.212888  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1247  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  30.87 
 
 		 270 aa  78.6  0.00000000000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001053  glycosyltransferase  30.77 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.110978  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5220  glycosyl transferase family protein  28.91 
 
 		 242 aa  78.6  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1217  glycosyl transferase family protein  30.87 
 
 		 274 aa  78.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.906875  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3730  glycosyl transferase family protein  27.91 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00146021 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0146  glycosyl transferase family protein  31.28 
 
 		 336 aa  78.2  0.0000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1110  glycosyl transferase family 2  26.54 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0704361  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0752  glycosyl transferase family protein  34.59 
 
 		 243 aa  77.4  0.0000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000917436  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0903  hypothetical protein  32.64 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0767729 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0837  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0480  glycosyl transferase family 2  28.95 
 
 		 377 aa  76.6  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0370888  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4987  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 235 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.278061  hitchhiker  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4474  glycosyl transferase family protein  25.91 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0455914 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0441  glycosyl transferase family protein  36.99 
 
 		 271 aa  75.9  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.397838  normal  0.437223 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3771  glycosyl transferase family protein  30.14 
 
 		 238 aa  75.1  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0033  dolichyl-phosphate beta-D-mannosyltransferase  27.81 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0326174 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1765  glycosyl transferase family protein  27.96 
 
 		 229 aa  74.7  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5400  glycosyl transferase family 2  28.91 
 
 		 242 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.859637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1976  glycosyl transferase family 2  29.81 
 
 		 230 aa  74.7  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.364573  normal  0.0138769 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1182  glycosyl transferase family protein  32.47 
 
 		 228 aa  74.7  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0187488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0571  glycosyltransferase ycbB  25.91 
 
 		 234 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.50645  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0441  glycosyl transferase family protein  31.44 
 
 		 629 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0794  glycosyl transferase family 2  30.41 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5209  glycosyl transferase family 2  28.43 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.779057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0337  glycosyl transferase family protein  30.25 
 
 		 619 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32660  glycosyl transferase  30.73 
 
 		 377 aa  74.7  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1142  dolichyl-phosphate mannose synthase related protein  26.8 
 
 		 321 aa  73.6  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1655  glycosyl transferase family 2  29.38 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03835  dolichyl-phosphate mannose synthase-like protein  24.75 
 
 		 397 aa  74.3  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.125771  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1440  cell wall biosynthesis glycosyltransferase  31.01 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000177815  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0345  glycosyl transferase family 2  31 
 
 		 623 aa  73.6  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00259601 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1549  glycosyl transferase family protein  24.66 
 
 		 228 aa  73.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>