249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08260  predicted membrane protein, hemolysin III  100 
 
 		 262 aa  514  1.0000000000000001e-145  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0484863 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1888  Hly-III family protein  63.49 
 
 		 274 aa  322  5e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0945  Hly-III family protein  66.39 
 
 		 250 aa  295  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1083  Hly-III family protein  63.2 
 
 		 249 aa  287  1e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2630  Hly-III family protein  64.13 
 
 		 225 aa  273  3e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.468291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23050  predicted membrane protein, hemolysin III  60.19 
 
 		 276 aa  251  9.000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1104  Hly-III family protein  56.22 
 
 		 246 aa  248  5e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.316011  normal  0.122165 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0735  Hly-III family protein  50.68 
 
 		 221 aa  239  5e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.96955  normal  0.774443 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2335  Hly-III family protein  50 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0126816  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1055  Hly-III family protein  47.98 
 
 		 254 aa  231  9e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0744  channel protein, hemolysin III family  46.85 
 
 		 268 aa  229  3e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0373382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1243  Hly-III family protein  50.21 
 
 		 246 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000158656 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0862  HylII  44.62 
 
 		 366 aa  221  7e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.386201  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1172  Hly-III family protein  47.18 
 
 		 243 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0439  Hly-III family protein  52.43 
 
 		 218 aa  215  7e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.268584 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7682  hemolysin III family channel protein  51.44 
 
 		 224 aa  214  9.999999999999999e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3898  hemolysin III family channel protein  47.85 
 
 		 305 aa  210  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0832  hemolysin III family channel protein  44.1 
 
 		 273 aa  208  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.53621  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05120  channel protein, hemolysin III family  45.06 
 
 		 239 aa  185  6e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.297417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0093  hemolysin III family channel protein  50 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00042868 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0096  hemolysin III family channel protein  48.83 
 
 		 225 aa  182  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0767  hemolysin III-like membrane protein  41.7 
 
 		 314 aa  181  8.000000000000001e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00245971  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0949  channel protein, hemolysin III family  45.89 
 
 		 270 aa  180  2e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4663  hemolysin III family channel protein  43.97 
 
 		 243 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.189263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2054  hemolysin III family channel protein  42.21 
 
 		 250 aa  177  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.156136 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31590  channel protein, hemolysin III family  45.05 
 
 		 229 aa  172  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0713  channel protein, hemolysin III family  43.6 
 
 		 225 aa  170  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4138  hemolysin III family channel protein  42.98 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4213  hemolysin III family channel protein  42.98 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.370881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4369  hemolysin III family channel protein  42.98 
 
 		 247 aa  170  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.221935  normal  0.823365 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1355  putative hemolysin III-like membrane protein  44.95 
 
 		 285 aa  167  2e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.648452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11103  hemolysin-like protein  39.09 
 
 		 242 aa  155  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.2817e-49  normal  0.398095 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4414  channel protein, hemolysin III family  46.41 
 
 		 225 aa  155  8e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1532  channel protein, hemolysin III family  44.34 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.104876  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1656  channel protein, hemolysin III family  46.11 
 
 		 224 aa  143  3e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0223  hemolysin, putative  40.31 
 
 		 195 aa  141  9e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_199  membrane protein, Hly III family  40.31 
 
 		 195 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4658  hemolysin III family channel protein  44.79 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.096872  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4746  hemolysin III family channel protein  44.79 
 
 		 270 aa  137  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.506887 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0131  Hly-III family protein  40.35 
 
 		 192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5336  channel protein, hemolysin III family  38.25 
 
 		 235 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1153  hemolysin III family channel protein  41.67 
 
 		 219 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5041  hemolysin III family channel protein  43.56 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.45647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1200  hemolysin III family channel protein  43.2 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3062  hemolysin III family channel protein  40.87 
 
 		 216 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.478051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1283  channel protein, hemolysin III family  40.74 
 
 		 219 aa  131  9e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0230  hemolysin III family channel protein  45.18 
 
 		 217 aa  131  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0222965  normal  0.256971 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1213  channel protein, hemolysin III family  40.74 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1523  hemolysin III family channel protein  46.31 
 
 		 200 aa  130  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0422  hemolysin III family channel protein  39.59 
 
 		 216 aa  129  6e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113561  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1757  channel protein, hemolysin III family  39.15 
 
 		 218 aa  128  9.000000000000001e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0210  channel protein, hemolysin III family  38.95 
 
 		 216 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3776  hemolysin III family channel protein  34.36 
 
 		 223 aa  125  6e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000709821  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1725  hemolysin III  35.26 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000437413  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1453  hemolysin III  35.26 
 
 		 215 aa  121  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0724044  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2247  channel protein, hemolysin III family  38.1 
 
 		 215 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.528466 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5245  hemolysin III family channel protein  34.08 
 
 		 215 aa  120  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5305  hemolysin III family channel protein  34.08 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5372  channel protein, hemolysin III family  33.52 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.239102  hitchhiker  0.000844447 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5701  hemolysin III family channel protein  34.08 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5546  channel protein, hemolysin III family  34.08 
 
 		 215 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189544 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5590  hemolysin III family channel protein  33.52 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5637  channel protein, hemolysin III family  33.52 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5575  channel protein, hemolysin III family  33.52 
 
 		 215 aa  119  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.360827  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5147  hemolysin III-like protein  34.24 
 
 		 215 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000999061  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0549  hemolysin III family channel protein  40 
 
 		 213 aa  117  1.9999999999999998e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5132  hemolysin III-like protein  33.52 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00313376  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1904  membrane protein, hemolysin III-like protein  35.23 
 
 		 232 aa  112  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2636  channel protein, hemolysin III family  39.69 
 
 		 208 aa  112  7.000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.274302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0099  hemolysin III family channel protein  40.91 
 
 		 215 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00987252  normal  0.4517 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2864  Hly-III family protein  38.18 
 
 		 239 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.107423  normal  0.018726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1696  hemolysin III family channel protein  36.08 
 
 		 214 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1130  channel protein, hemolysin III family protein  33.73 
 
 		 208 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00435698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1188  channel protein, hemolysin III family  32.94 
 
 		 214 aa  103  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.30229e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04990  predicted membrane protein, hemolysin III  35.84 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.900042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3135  hemolysin III family channel protein  31.48 
 
 		 219 aa  99.4  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1583  channel protein, hemolysin III family  31.79 
 
 		 218 aa  94.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.994692 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01230  channel protein, hemolysin III family  28.84 
 
 		 257 aa  91.7  1e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0784  channel protein, hemolysin III family  33.77 
 
 		 215 aa  91.3  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46556  predicted protein  31.85 
 
 		 268 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000802712  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1608  Hly-III family protein  36.21 
 
 		 226 aa  89.7  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.60621  normal  0.167379 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1889  Hly-III family protein  36.21 
 
 		 226 aa  89.4  5e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.514371  normal  0.582334 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00397  hypothetical protein  32.74 
 
 		 233 aa  88.6  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0042  channel protein, hemolysin III family  31.49 
 
 		 230 aa  88.2  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2710  Hly-III family protein  34.91 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0918513 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2385  hemolysin III family channel protein  33.14 
 
 		 249 aa  87  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.872491  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00250  channel protein, hemolysin III family  36.05 
 
 		 259 aa  86.3  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0636  channel protein, hemolysin III family  33.51 
 
 		 215 aa  85.1  0.000000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2098  hemolysin III family channel protein  31.18 
 
 		 236 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0246  channel protein, hemolysin III family  30.77 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3869  hemolysin III family channel protein  35.43 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1631  Hly-III family protein  32.86 
 
 		 226 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.771298  normal  0.786248 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0092  hemolysin III family channel protein  28.99 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.0000116234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3595  hemolysin III family channel protein  29.67 
 
 		 216 aa  83.2  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0850  channel protein, hemolysin III family  33.51 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1773  Hly-III family protein  29.61 
 
 		 231 aa  82.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3432  channel protein, hemolysin III family  34.3 
 
 		 216 aa  82.8  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0067  hemolysin III family channel protein  33.33 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2479  putative hemolysin  30.41 
 
 		 215 aa  82.4  0.000000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0114  hemolysin III family channel protein  35.68 
 
 		 227 aa  82  0.000000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>