55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_08060 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  100 
 
 		 232 aa  465  9.999999999999999e-131  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  40.76 
 
 		 230 aa  148  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.32 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  38.67 
 
 		 227 aa  107  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  38.1 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  35.55 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  35.75 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  33.5 
 
 		 213 aa  98.6  7e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 210 aa  95.5  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  33.15 
 
 		 180 aa  93.6  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  34.01 
 
 		 206 aa  92.4  5e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  35.08 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 198 aa  85.5  6e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.23 
 
 		 192 aa  84  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  32.8 
 
 		 192 aa  83.6  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  32.12 
 
 		 182 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  32.62 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  32.31 
 
 		 214 aa  80.5  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  35.48 
 
 		 201 aa  80.1  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.73 
 
 		 213 aa  79  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  34.34 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  33.51 
 
 		 212 aa  78.6  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 187 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  50 
 
 		 216 aa  75.5  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  47.37 
 
 		 183 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  35.93 
 
 		 212 aa  74.3  0.000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  29.19 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  30.99 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  32.99 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  31.94 
 
 		 193 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  33.85 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  29.35 
 
 		 201 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  32.43 
 
 		 195 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  26.04 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  30.25 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  31.11 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 186 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0746  transcriptional regulator, ArsR family  26.09 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 98 aa  47  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3269  ArsR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 207 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.574198  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0109  ArsR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 197 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  25.43 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0383  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0395  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  41.07 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0404  hypothetical protein  28.73 
 
 		 197 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.748136 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3654  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.162067 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2299  regulatory protein, ArsR  26.67 
 
 		 196 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.718193  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  34.88 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0328  putative transcriptional regulator  27.96 
 
 		 201 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0496107 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3867  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 118 aa  42.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248206  normal  0.706318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2973  putative transcriptional regulator  27.11 
 
 		 207 aa  42.7  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0226444  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 224 aa  42.7  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3245  transcriptional regulator, ArsR family  23.04 
 
 		 208 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>