More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07530 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_07530  serine/threonine protein phosphatase  100 
 
 
266 aa  532  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.090803 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0489  protein serine/threonine phosphatase  51.91 
 
 
285 aa  223  2e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.650161  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1336  protein serine/threonine phosphatase  48.41 
 
 
323 aa  215  7e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1292  protein serine/threonine phosphatases  47.37 
 
 
325 aa  202  4e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1928  protein serine/threonine phosphatase  46.72 
 
 
270 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0340359  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2294  Phosphoprotein phosphatase  49 
 
 
274 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2201  protein serine/threonine phosphatase  48.43 
 
 
296 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.921006  decreased coverage  0.00279452 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0456  protein serine/threonine phosphatase  44.58 
 
 
287 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.137154  normal  0.894347 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1325  protein serine/threonine phosphatase  47.39 
 
 
258 aa  180  2e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.235242  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1755  protein serine/threonine phosphatase  45.12 
 
 
284 aa  180  2.9999999999999997e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.959742  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3041  protein serine/threonine phosphatase  47.86 
 
 
395 aa  178  8e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2701  protein serine/threonine phosphatase  47.6 
 
 
256 aa  175  7e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.312462  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21560  serine/threonine protein phosphatase  42.53 
 
 
293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.146725  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3942  protein phosphatase 2C domain-containing protein  43.03 
 
 
280 aa  169  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145265  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27050  serine/threonine protein phosphatase  44.63 
 
 
425 aa  165  9e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05590  serine/threonine protein phosphatase  48.21 
 
 
302 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.721089  normal  0.280672 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03320  serine/threonine protein phosphatase  45.87 
 
 
452 aa  162  6e-39  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0159722  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0386  protein serine/threonine phosphatase  43.67 
 
 
250 aa  157  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.169531  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1343  protein serine/threonine phosphatase  41.1 
 
 
394 aa  154  1e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00740563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0849  protein serine/threonine phosphatase  40.42 
 
 
247 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.102968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3050  protein serine/threonine phosphatase  42.37 
 
 
267 aa  145  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0090  protein serine/threonine phosphatase  40.09 
 
 
422 aa  144  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00790  serine/threonine protein phosphatase  40.5 
 
 
571 aa  143  3e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3297  protein serine/threonine phosphatases  37.39 
 
 
243 aa  142  6e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00780778 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05930  serine/threonine protein phosphatase  43.46 
 
 
252 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0022  protein serine/threonine phosphatases  40.55 
 
 
421 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2392  protein serine/threonine phosphatase  35.94 
 
 
597 aa  139  6e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.685774  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1312  protein serine/threonine phosphatase  36.97 
 
 
236 aa  138  8.999999999999999e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0174  protein serine/threonine phosphatase  36.9 
 
 
500 aa  138  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.841118 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0039  protein serine/threonine phosphatase  38.85 
 
 
472 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759123  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3111  protein serine/threonine phosphatase  38.89 
 
 
319 aa  137  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0426507 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0075  Protein phosphatase 2C-like  39.84 
 
 
463 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0579215  normal  0.315447 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1581  Phosphoprotein phosphatase  39.17 
 
 
265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2879  protein serine/threonine phosphatase  41.56 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0260244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4432  protein serine/threonine phosphatases  40.08 
 
 
469 aa  136  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.35733 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0909  protein serine/threonine phosphatases  40.52 
 
 
236 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0310722  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2307  protein serine/threonine phosphatase  34.44 
 
 
238 aa  135  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0816987  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0026  protein phosphatase 2C domain-containing protein  34.82 
 
 
438 aa  135  5e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.887791  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1685  protein serine/threonine phosphatase  43.17 
 
 
221 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.614015  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2766  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.91 
 
 
611 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1379  serine/threonine protein phosphatase  35.63 
 
 
564 aa  134  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1333  protein serine/threonine phosphatase  38.76 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.535084  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0067  protein serine/threonine phosphatase  39.76 
 
 
540 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00220  serine/threonine protein phosphatase  40.09 
 
 
519 aa  133  3e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0138  protein serine/threonine phosphatase  40.26 
 
 
467 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.568402  decreased coverage  0.00197643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1534  protein serine/threonine phosphatase  30.04 
 
 
241 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0034  protein phosphatase 2C  34.54 
 
 
554 aa  132  6e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1743  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.42 
 
 
241 aa  132  6e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.962948  normal  0.902716 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0081  protein serine/threonine phosphatase  38.87 
 
 
519 aa  132  6e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0625  protein serine/threonine phosphatase  36.36 
 
 
241 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6475  protein serine/threonine phosphatase  41 
 
 
463 aa  132  6.999999999999999e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0121274 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1589  protein phosphatase 2C domain-containing protein  37.39 
 
 
237 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0024  protein serine/threonine phosphatase  36.67 
 
 
567 aa  131  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00164542 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3965  protein serine/threonine phosphatase  37.7 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4111  protein phosphatase 2C domain-containing protein  40.57 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1750  protein phosphatase 2C domain-containing protein  32.39 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165871  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1935  protein serine/threonine phosphatase  37.82 
 
 
321 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.709495  hitchhiker  0.0000466361 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0051  protein serine/threonine phosphatase  36.44 
 
 
426 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00361373  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1044  protein serine/threonine phosphatase  33.47 
 
 
245 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2397  Phosphoprotein phosphatase  36.33 
 
 
246 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4532  protein serine/threonine phosphatase  39.66 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00167554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1726  protein serine/threonine phosphatase  38.4 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459048  hitchhiker  0.00271711 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0029  Phosphoprotein phosphatase  39.58 
 
 
505 aa  130  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5250  protein serine/threonine phosphatase  37.66 
 
 
449 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.383211 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1711  protein phosphatase 2C domain-containing protein  33.06 
 
 
238 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4212  protein serine/threonine phosphatase  33.59 
 
 
548 aa  129  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.685502  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2562  protein serine/threonine phosphatases  39.92 
 
 
256 aa  129  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.144925  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0024  protein serine/threonine phosphatases  41.15 
 
 
381 aa  130  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0105  protein phosphatase 2C domain-containing protein  36.51 
 
 
242 aa  130  3e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.895672  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0573  protein serine/threonine phosphatases  32.93 
 
 
245 aa  130  3e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000179403  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0024  protein serine/threonine phosphatases  37.08 
 
 
558 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3062  protein phosphatase 2C-like  37.25 
 
 
474 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00558874  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1682  protein serine/threonine phosphatase  32.82 
 
 
313 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0029  protein serine/threonine phosphatase  40.42 
 
 
479 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.893327  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0846  protein serine/threonine phosphatase  38.98 
 
 
234 aa  129  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0996  protein phosphatase 2C-like protein  39.39 
 
 
305 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0912  protein serine/threonine phosphatase  39.67 
 
 
276 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0472  protein serine/threonine phosphatase  36.78 
 
 
320 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0068  serine/threonine specific protein phosphatase (putative)  38.58 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4547  protein phosphatase 2C domain-containing protein  39.26 
 
 
470 aa  127  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4426  protein serine/threonine phosphatase  39.91 
 
 
364 aa  127  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0345572  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3389  protein serine/threonine phosphatase  36.82 
 
 
271 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.830216  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3279  protein serine/threonine phosphatase  39.39 
 
 
239 aa  126  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0342003 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0666  protein serine/threonine phosphatase  29.05 
 
 
241 aa  126  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.719355  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4044  protein phosphatase 2C domain-containing protein  35.5 
 
 
271 aa  126  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2487  protein serine/threonine phosphatase  34.31 
 
 
241 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00028988  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2083  Serine/threonine protein phosphatase  34.29 
 
 
258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1992  protein phosphatase 2C family protein  34.32 
 
 
239 aa  126  5e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0753  protein serine/threonine phosphatase  35.27 
 
 
574 aa  125  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.17783 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0115  Phosphoprotein phosphatase  37.39 
 
 
441 aa  126  5e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.11266  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1710  protein phosphatase 2C family protein  34.32 
 
 
239 aa  125  7e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00220  serine/threonine protein phosphatase  36.6 
 
 
507 aa  125  8.000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.682874 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09950  phosphoric monoester hydrolase  30.42 
 
 
236 aa  124  1e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0014  protein serine/threonine phosphatase  39.65 
 
 
416 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0477  protein serine/threonine phosphatases  36.96 
 
 
256 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1170  protein phosphatase 2C-like protein  36.63 
 
 
246 aa  124  2e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.325557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3382  protein serine/threonine phosphatase  36.71 
 
 
240 aa  123  3e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1774  serine/threonine protein phosphatase-like  35.55 
 
 
264 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0461354  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0229  protein serine/threonine phosphatases  38.66 
 
 
348 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3691  serine/threonine phosphatase  37.35 
 
 
256 aa  122  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.221121  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>