More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_07430 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0589  NADH dehydrogenase (quinone)  76.96 
 
 
428 aa  646    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.232944  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0474  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  78.12 
 
 
448 aa  718    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2690  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  77.41 
 
 
438 aa  686    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2711  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  85.14 
 
 
444 aa  744    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5058  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.96 
 
 
439 aa  649    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0544  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  85.71 
 
 
448 aa  782    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.789941 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4413  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  74.19 
 
 
433 aa  658    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3224  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  76.76 
 
 
439 aa  659    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00762011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0286  NADH-quinone oxidoreductase subunit F  75.25 
 
 
428 aa  634    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07430  NADH dehydrogenase subunit F  100 
 
 
449 aa  912    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0432719 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0272  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  73.79 
 
 
434 aa  629  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0397  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  72.22 
 
 
706 aa  622  1e-177  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7686  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  69 
 
 
441 aa  617  1e-175  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0525  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.42 
 
 
440 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6677  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.07 
 
 
431 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03210  NADH dehydrogenase subunit F  69.95 
 
 
424 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.589987  normal  0.53715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13171  NADH dehydrogenase I chain F nuoF (NADH-ubiquinone oxidoreductase chain F)  69.86 
 
 
445 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4553  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  66.22 
 
 
442 aa  600  1e-170  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1575  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.14 
 
 
438 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1545  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.37 
 
 
438 aa  601  1e-170  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.349481  normal  0.139293 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1599  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  70.14 
 
 
438 aa  599  1e-170  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.160681  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6089  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  68.47 
 
 
447 aa  590  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0248618 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0543  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  67.49 
 
 
443 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.315884  normal  0.338133 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4486  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.15 
 
 
438 aa  585  1e-166  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.144316  hitchhiker  0.0024852 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1880  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  71.15 
 
 
441 aa  582  1.0000000000000001e-165  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4458  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.29 
 
 
443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4060  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  64.56 
 
 
443 aa  560  1e-158  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.306589 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3173  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.93 
 
 
446 aa  556  1e-157  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0979  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  65.6 
 
 
439 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1279  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  59.71 
 
 
438 aa  528  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.325517  normal  0.538152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1044  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  56.96 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3618  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.92 
 
 
421 aa  447  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.997911  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3084  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.15 
 
 
422 aa  439  9.999999999999999e-123  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0991  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  53.75 
 
 
425 aa  439  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.315379  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2238  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  54.32 
 
 
449 aa  436  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3391  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.39 
 
 
451 aa  432  1e-120  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1760  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.25 
 
 
426 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1872  NADH-quinone oxidoreductase F subunit  53.2 
 
 
438 aa  425  1e-118  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.901047  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2625  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.88 
 
 
427 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0713  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.53 
 
 
426 aa  427  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.591559  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0914  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.76 
 
 
446 aa  425  1e-118  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2252  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.88 
 
 
427 aa  425  1e-118  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000522116 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1278  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.58 
 
 
444 aa  422  1e-117  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.327335  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2560  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.12 
 
 
427 aa  420  1e-116  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.652928  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1096  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.39 
 
 
425 aa  421  1e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.763284  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1965  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50 
 
 
425 aa  419  1e-116  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.789602  normal  0.0852998 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0954  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.63 
 
 
442 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.613915 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4083  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.19 
 
 
446 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.323862  normal  0.192714 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1959  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.74 
 
 
429 aa  413  1e-114  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00121653  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4354  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 
441 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.168378  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4331  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 
441 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0822  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.74 
 
 
426 aa  414  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.76792  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4199  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.86 
 
 
441 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3630  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  52.18 
 
 
424 aa  413  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.414875 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1147  NADH-quinone oxidoreductase, chain F  50.38 
 
 
426 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.450213  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3251  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.43 
 
 
467 aa  410  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.915632  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2988  NADH dehydrogenase I subunit F  51.76 
 
 
432 aa  410  1e-113  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.437641  normal  0.652273 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2808  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.51 
 
 
452 aa  411  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.318521 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0877  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.5 
 
 
453 aa  407  1.0000000000000001e-112  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1824  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2831  NADH dehydrogenase I chain F  48.54 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2700  NADH dehydrogenase I chain F  48.54 
 
 
425 aa  405  1.0000000000000001e-112  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2161  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.66 
 
 
440 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.615795  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1440  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0584655  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0732  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5572  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294569  normal  0.298665 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0962  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.5 
 
 
453 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0089517 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1066  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0842517  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1295  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5175  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.05 
 
 
452 aa  405  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.82972  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1632  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1135  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305748  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1241  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  50.36 
 
 
456 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  51.85 
 
 
441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.548898  normal  0.181766 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2282  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.502286  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1304  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2244  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.17 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0418  NADH dehydrogenase I, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.121706  normal  0.072136 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1268  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.65 
 
 
452 aa  402  1e-111  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.262247  normal  0.27645 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1747  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.07 
 
 
439 aa  402  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2057  NADH dehydrogenase I chain F  47.92 
 
 
431 aa  402  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.728933  normal  0.0269366 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2209  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
431 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.377911 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4077  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.77 
 
 
454 aa  403  1e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.856999  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1154  NADH dehydrogenase (quinone)  50.38 
 
 
436 aa  402  1e-111  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2295  NADH dehydrogenase I subunit F  49.63 
 
 
428 aa  403  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2004  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.8 
 
 
442 aa  404  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.462519  normal  0.256027 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0932  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.05 
 
 
431 aa  402  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.5981  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1027  NADH dehydrogenase I subunit F  52.02 
 
 
434 aa  402  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1886  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
431 aa  404  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.415851  normal  0.35892 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3209  putative NADH dehydrogenase I (chain F), NuoF  47.32 
 
 
442 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.489699  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1348  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  47.32 
 
 
442 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.020872  hitchhiker  0.00762126 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3221  NADH dehydrogenase I subunit F  50.88 
 
 
429 aa  401  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0550  NADH-quinone oxidoreductase chain F  46.87 
 
 
422 aa  398  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.842517  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3862  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.66 
 
 
443 aa  396  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0966  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.78 
 
 
431 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286916  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3505  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  49.25 
 
 
446 aa  395  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1613  NADH dehydrogenase (ubiquinone), F subunit  46.87 
 
 
422 aa  397  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1033  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.41 
 
 
436 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.970624  normal  0.170382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1925  NADH-quinone oxidoreductase, F subunit  48.14 
 
 
445 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>