More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_06110 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_06110  methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 
533 aa  1034    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.232988  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32370  methyl-accepting chemotaxis protein  52.99 
 
 
531 aa  429  1e-119  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5009  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.5 
 
 
537 aa  425  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07600  methyl-accepting chemotaxis protein  52.68 
 
 
533 aa  423  1e-117  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0696595 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32360  methyl-accepting chemotaxis protein  53.28 
 
 
530 aa  421  1e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5010  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.55 
 
 
538 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30970  methyl-accepting chemotaxis protein  47.42 
 
 
562 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30960  methyl-accepting chemotaxis protein  51.04 
 
 
540 aa  384  1e-105  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36630  methyl-accepting chemotaxis protein  54.9 
 
 
540 aa  377  1e-103  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05890  methyl-accepting chemotaxis protein  48.55 
 
 
538 aa  374  1e-102  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.383381 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3602  chemotaxis sensory transducer  62.46 
 
 
518 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1961  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.25 
 
 
535 aa  362  8e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.286616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36620  methyl-accepting chemotaxis protein  51.98 
 
 
543 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0835028  normal  0.811978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2984  chemotaxis sensory transducer  51.02 
 
 
545 aa  349  8e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.660626  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0421  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.68 
 
 
623 aa  341  2e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.308823 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30950  methyl-accepting chemotaxis protein  54.15 
 
 
540 aa  341  2e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.664181  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1995  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.98 
 
 
394 aa  339  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30940  methyl-accepting chemotaxis protein  57.83 
 
 
407 aa  336  5.999999999999999e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.682285  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4449  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.71 
 
 
538 aa  328  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.018308  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2323  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  62.46 
 
 
545 aa  327  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0109  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  58.24 
 
 
528 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.268294  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2095  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.79 
 
 
538 aa  316  8e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0359  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  56.46 
 
 
542 aa  316  9e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1293  chemotaxis sensory transducer  55.33 
 
 
542 aa  308  2.0000000000000002e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.320257  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2197  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.81 
 
 
522 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30920  methyl-accepting chemotaxis protein  44.49 
 
 
583 aa  305  1.0000000000000001e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0360  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  43.84 
 
 
544 aa  300  3e-80  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5008  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  64.56 
 
 
546 aa  298  1e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03110  methyl-accepting chemotaxis protein  54.79 
 
 
347 aa  298  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0123169  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1613  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  49.47 
 
 
523 aa  280  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00385179  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0375  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.14 
 
 
544 aa  279  8e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0199  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
532 aa  278  2e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.570256  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0651  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.75 
 
 
535 aa  276  6e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.406234  normal  0.0260089 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1751  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  53.35 
 
 
547 aa  275  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1672  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.87 
 
 
904 aa  274  3e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.707022 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27420  methyl-accepting chemotaxis protein  55.88 
 
 
540 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.141989  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4077  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.76 
 
 
545 aa  261  2e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1974  chemotaxis sensory transducer  52.22 
 
 
535 aa  259  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4184  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  54.29 
 
 
536 aa  256  9e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483396  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4229  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  57.54 
 
 
1150 aa  256  1.0000000000000001e-66  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.591053 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1002  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.51 
 
 
529 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00624598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1914  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.35 
 
 
550 aa  251  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.37871  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1526  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.96 
 
 
858 aa  251  3e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.787952  normal  0.35844 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1755  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  52.22 
 
 
538 aa  250  5e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2460  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
531 aa  236  6e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.28 
 
 
545 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0156977  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.09 
 
 
530 aa  232  1e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.376441  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0198  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  44.51 
 
 
715 aa  231  2e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.419669  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3089  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.31 
 
 
526 aa  227  4e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0049  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.15 
 
 
539 aa  225  1e-57  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0550535  normal  0.228084 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.67 
 
 
702 aa  224  4e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.105528  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0026  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.84 
 
 
686 aa  219  7.999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1909  chemotaxis sensory transducer  58.04 
 
 
965 aa  219  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.11776  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1913  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.64 
 
 
524 aa  218  2e-55  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0934644  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1783  chemotaxis sensory transducer  46.88 
 
 
515 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.552405  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0127  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  48.67 
 
 
397 aa  210  5e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.362921  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2742  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.32 
 
 
560 aa  209  8e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.429688 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1857  chemotaxis sensory transducer  31.43 
 
 
563 aa  209  9e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0753  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.08 
 
 
558 aa  206  6e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.75846  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3610  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.21 
 
 
563 aa  205  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.735593  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4271  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  47.19 
 
 
535 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.79817  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5172  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.37 
 
 
656 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.87 
 
 
554 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000234986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1321  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  46.18 
 
 
730 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0177086  normal  0.260794 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1064  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.71 
 
 
573 aa  201  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.223413  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2653  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.82 
 
 
691 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00184965  normal  0.0777916 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4406  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.7 
 
 
566 aa  200  5e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2757  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.82 
 
 
561 aa  200  6e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0630329  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4407  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.75 
 
 
566 aa  199  7.999999999999999e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.365939 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2484  chemotaxis sensory transducer  40.79 
 
 
563 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.1562  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1830  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.2 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0994  chemotaxis sensory transducer  37.43 
 
 
656 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.357708  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0969  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.77 
 
 
562 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.956339  normal  0.570918 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5120  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.34 
 
 
563 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0995  chemotaxis sensory transducer  38.07 
 
 
656 aa  197  3e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.880627  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2646  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.35 
 
 
625 aa  197  3e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0885  putative methyl-accepting chemotaxis protein  34.76 
 
 
691 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.493714  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.27 
 
 
670 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4789  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  50.41 
 
 
493 aa  197  5.000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3380  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.86 
 
 
567 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5110  hypothetical protein  38.26 
 
 
688 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.791751 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6993  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer  36.32 
 
 
697 aa  196  9e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1710  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.42 
 
 
449 aa  195  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.140977  normal  0.0321459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6483  methyl-accepting chemotaxis protein  34.33 
 
 
565 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.877741  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2076  chemotaxis sensory transducer  33.81 
 
 
561 aa  195  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.723039  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3598  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  39.14 
 
 
672 aa  194  3e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0337  chemotaxis sensory transducer  32.02 
 
 
563 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.760858  normal  0.789667 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5403  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  41.4 
 
 
538 aa  194  5e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4280  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.47 
 
 
563 aa  194  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3563  chemotaxis sensory transducer  36.33 
 
 
563 aa  192  9e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4269  putative methyl-accepting chemotaxis receptor/sensory transducer protein  37.47 
 
 
691 aa  192  9e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.35374 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0065  chemotaxis sensory transducer  39.29 
 
 
688 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0714339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0840  chemotaxis sensory transducer  40.39 
 
 
712 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.174635 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2983  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  37.53 
 
 
561 aa  192  2e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0323515 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3504  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.44 
 
 
657 aa  191  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.193477  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4191  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  51.58 
 
 
538 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3471  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  35.66 
 
 
561 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.130295  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4783  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  38.02 
 
 
730 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2149  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  45.63 
 
 
675 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0391093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  42.02 
 
 
712 aa  191  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.991242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>