More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05870 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05870  CBS domain-containing protein  100 
 
 
342 aa  678    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0413  protein of unknown function DUF21  65.87 
 
 
333 aa  414  1e-114  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.75735  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0446  protein of unknown function DUF21  64.95 
 
 
336 aa  401  1e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.147146 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2794  protein of unknown function DUF21  66.77 
 
 
340 aa  395  1e-109  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2950  protein of unknown function DUF21  66.07 
 
 
341 aa  397  1e-109  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0016  protein of unknown function DUF21  59.46 
 
 
334 aa  375  1e-103  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.430522  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2682  hypothetical protein  62.24 
 
 
332 aa  370  1e-101  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3861  hypothetical protein  62.54 
 
 
332 aa  363  2e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.173043  normal  0.14179 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3478  hypothetical protein  60.42 
 
 
332 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3541  hypothetical protein  60.42 
 
 
332 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3491  hypothetical protein  60.42 
 
 
332 aa  359  4e-98  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648386  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3860  protein of unknown function DUF21  59.76 
 
 
350 aa  350  3e-95  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00358184  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1686  CBS  54.57 
 
 
340 aa  343  2e-93  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1940  protein of unknown function DUF21  52.04 
 
 
336 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.177932  normal  0.094391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0319  protein of unknown function DUF21  52.8 
 
 
342 aa  325  6e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000713194  normal  0.0140808 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3114  hypothetical protein  50 
 
 
345 aa  313  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5780  protein of unknown function DUF21  42.77 
 
 
353 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0118  hypothetical protein  41.12 
 
 
344 aa  220  3e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.667221  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1369  hypothetical protein  40.3 
 
 
354 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.791695  hitchhiker  0.00309173 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1410  hypothetical protein  39.34 
 
 
354 aa  206  4e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.575326  normal  0.42093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24010  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 
358 aa  203  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.864311 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0048  hypothetical protein  41.32 
 
 
334 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.783092  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4666  protein of unknown function DUF21  38.39 
 
 
337 aa  196  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6908  hypothetical protein  40.38 
 
 
337 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1721  protein of unknown function DUF21  35.5 
 
 
357 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1953  hypothetical protein  35.84 
 
 
348 aa  182  9.000000000000001e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.098143  normal  0.528904 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5678  protein of unknown function DUF21  36.01 
 
 
347 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400614  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6403  hypothetical protein  34.45 
 
 
335 aa  172  6.999999999999999e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0913  hypothetical protein  35.58 
 
 
365 aa  171  2e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.471869  normal  0.209889 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3000  hypothetical protein  36.9 
 
 
355 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.911183  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22520  CBS domain-containing protein  33.93 
 
 
351 aa  169  8e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0313025  normal  0.775283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1235  protein of unknown function DUF21  35.24 
 
 
346 aa  168  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.100418 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31510  CBS domain-containing protein  35.74 
 
 
346 aa  168  1e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2719  hypothetical protein  35.61 
 
 
349 aa  168  1e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.244319  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2765  protein of unknown function DUF21  31.9 
 
 
358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.850743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2815  hypothetical protein  36.53 
 
 
351 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2859  hypothetical protein  36.53 
 
 
351 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.431917  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2842  hypothetical protein  36.53 
 
 
351 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.124915  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5345  protein of unknown function DUF21  34.03 
 
 
348 aa  163  4.0000000000000004e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125368  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09600  CBS domain-containing protein  32.12 
 
 
346 aa  162  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.21875 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2370  protein of unknown function DUF21  33.91 
 
 
355 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.1834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2318  protein of unknown function DUF21  31.88 
 
 
357 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3095  hypothetical protein  33.63 
 
 
353 aa  155  7e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.148028  normal  0.41587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3365  hypothetical protein  33.63 
 
 
353 aa  154  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2642  hypothetical protein  31.07 
 
 
356 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3663  hypothetical protein  32.35 
 
 
346 aa  154  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07760  CBS domain-containing protein  34.48 
 
 
352 aa  152  8.999999999999999e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11869  hypothetical protein  33.75 
 
 
345 aa  151  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000548462  normal  0.224514 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0062  protein of unknown function DUF21  31.8 
 
 
346 aa  151  2e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0921  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
443 aa  149  5e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0507  protein of unknown function DUF21  34.06 
 
 
366 aa  149  7e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2483  protein of unknown function DUF21  31.82 
 
 
365 aa  147  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.06 
 
 
437 aa  147  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2962  protein of unknown function DUF21  32.34 
 
 
486 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.387429  hitchhiker  0.00195258 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2961  protein of unknown function DUF21  32.77 
 
 
376 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.192256  hitchhiker  0.00460853 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  27.27 
 
 
444 aa  142  7e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  28.78 
 
 
446 aa  141  1.9999999999999998e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1223  protein of unknown function DUF21  34.18 
 
 
347 aa  139  7.999999999999999e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.166933  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2377  protein of unknown function DUF21  29.82 
 
 
356 aa  138  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000976861 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.57 
 
 
440 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  28.01 
 
 
442 aa  136  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  28.01 
 
 
442 aa  136  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  28.27 
 
 
440 aa  136  5e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  28.66 
 
 
446 aa  136  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  28.01 
 
 
442 aa  136  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  29.15 
 
 
446 aa  136  7.000000000000001e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  27.71 
 
 
442 aa  135  8e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  30.63 
 
 
440 aa  135  8e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  27.71 
 
 
442 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  27.11 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0914  hypothetical protein  36.4 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447806  normal  0.0678288 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  27.11 
 
 
442 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  29 
 
 
443 aa  133  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2764  protein of unknown function DUF21  31.27 
 
 
461 aa  133  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.357691  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 
442 aa  133  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1889  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
464 aa  133  5e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.483019  normal  0.437772 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  26.97 
 
 
435 aa  132  6e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22510  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
438 aa  132  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0516538  normal  0.801852 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  25.3 
 
 
449 aa  132  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  26.06 
 
 
437 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 
437 aa  131  2.0000000000000002e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1222  protein of unknown function DUF21  32.64 
 
 
439 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.250523  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2179  protein of unknown function DUF21  34.04 
 
 
431 aa  130  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  27.46 
 
 
441 aa  130  3e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  32.12 
 
 
433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  30.77 
 
 
430 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  28.04 
 
 
439 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2317  protein of unknown function DUF21  30.12 
 
 
450 aa  129  8.000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  25.84 
 
 
448 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1725  hypothetical protein  28.23 
 
 
440 aa  128  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.996792 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  24.77 
 
 
444 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2371  protein of unknown function DUF21  29.54 
 
 
490 aa  127  3e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.304604 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  29.97 
 
 
443 aa  126  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09590  CBS domain-containing protein  28.82 
 
 
443 aa  126  6e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2484  protein of unknown function DUF21  31.45 
 
 
442 aa  126  6e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0575  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 
361 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0608  CBS domain-containing protein  25.96 
 
 
361 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0380  protein of unknown function DUF21  27.89 
 
 
441 aa  125  8.000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.279399  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  25.96 
 
 
432 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1234  protein of unknown function DUF21  34.13 
 
 
453 aa  125  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.106715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>