15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_05340 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_05340  ankyrin repeat protein  100 
 
 
362 aa  713    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0923  ankyrin repeat-containing protein  31.21 
 
 
177 aa  67  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269942  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0878  Ankyrin  34.13 
 
 
173 aa  66.2  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.000604849  normal  0.187608 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1435  hypothetical protein  27.44 
 
 
1585 aa  52  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.015567 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4169  Ankyrin  33.19 
 
 
269 aa  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.655086  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1610  hypothetical protein  24.22 
 
 
4520 aa  47.8  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0909  hypothetical protein  25.96 
 
 
865 aa  46.2  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.122525 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0898  ankyrin  33.96 
 
 
450 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.0000205657  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00214  conserved hypothetical protein  28.69 
 
 
321 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574203  normal  0.267859 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0911  hypothetical protein  28.72 
 
 
931 aa  44.3  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0380613 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02195  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 
1800 aa  44.3  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.222907  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0340  hypothetical protein  26.51 
 
 
2413 aa  44.3  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.259192 
 
 
-
 
NC_002978  WD0385  ankyrin repeat-containing protein  43.55 
 
 
542 aa  43.9  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.317443  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI02880  oxysterol-binding protein, putative  33.05 
 
 
1249 aa  42.7  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0356692  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1284  ankyrin  28.4 
 
 
870 aa  42.7  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.226002  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>