17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_03550 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_03550  protein of unknown function (DUF916)  100 
 
 
356 aa  681    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0090  hypothetical protein  50 
 
 
382 aa  248  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2031  hypothetical protein  42 
 
 
345 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.37822 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2622  hypothetical protein  41.84 
 
 
365 aa  203  5e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2880  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  40.65 
 
 
366 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1841  hypothetical protein  44.21 
 
 
292 aa  179  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2378  dihydroorotate oxidase B, electron transfer subunit  36.57 
 
 
407 aa  179  7e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01080  protein of unknown function (DUF916)  39.93 
 
 
378 aa  170  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0071  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  38.54 
 
 
341 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3873  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  38.96 
 
 
322 aa  162  9e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.1742  normal  0.257699 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4774  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  41.38 
 
 
334 aa  160  3e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.125514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0451  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  37.01 
 
 
385 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.824253  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2771  hypothetical protein  35.91 
 
 
348 aa  149  7e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2765  protein of unknown function DUF916 cell surface putative  39.56 
 
 
331 aa  127  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8823  hypothetical protein  30.99 
 
 
388 aa  84.3  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.388128  normal  0.40576 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2985  hypothetical protein  27.08 
 
 
336 aa  50.8  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1770  hypothetical protein  27.27 
 
 
359 aa  46.6  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.16487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>