240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02320  HNH endonuclease  100 
 
 
605 aa  1187    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09680  HNH endonuclease  59.93 
 
 
584 aa  607  9.999999999999999e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.616841  normal  0.523409 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16190  HNH endonuclease  60 
 
 
558 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.46252 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37420  HNH endonuclease  58.02 
 
 
580 aa  589  1e-167  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0493526  normal  0.38203 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28260  HNH endonuclease  55.61 
 
 
580 aa  582  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31580  HNH endonuclease  46.45 
 
 
551 aa  351  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.967931  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30520  HNH endonuclease  73.03 
 
 
499 aa  335  2e-90  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.696325  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23990  hypothetical protein  68.58 
 
 
535 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.997288 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35950  HNH endonuclease  66.48 
 
 
628 aa  236  6e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.391714  normal  0.627541 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0324  HNH endonuclease  33.33 
 
 
585 aa  209  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19140  hypothetical protein  45.08 
 
 
530 aa  195  2e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.846076  normal  0.184811 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0794  HNH nuclease  33.33 
 
 
568 aa  182  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3427  HNH endonuclease  44.97 
 
 
566 aa  150  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0370  HNH nuclease  40.09 
 
 
556 aa  147  6e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0584  HNH nuclease  47.06 
 
 
507 aa  147  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0801451 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0239  HNH nuclease  45.6 
 
 
508 aa  146  1e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3191  HNH endonuclease  42.15 
 
 
602 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1626  HNH endonuclease  43.53 
 
 
620 aa  142  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000294245 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0277  HNH endonuclease  45.61 
 
 
714 aa  140  6e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2416  HNH endonuclease  52.55 
 
 
603 aa  138  2e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  decreased coverage  0.0000498536  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3609  HNH nuclease  43.12 
 
 
222 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0148  HNH endonuclease  33.79 
 
 
748 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.350878  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2222  HNH endonuclease  41.67 
 
 
485 aa  105  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2570  HNH endonuclease  30.14 
 
 
637 aa  105  2e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.729569 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0800  HNH nuclease  36.36 
 
 
510 aa  102  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6925  HNH endonuclease  43.41 
 
 
426 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.629252 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6862  HNH endonuclease  43.59 
 
 
443 aa  97.4  7e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.215288  normal  0.885214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18410  hypothetical protein  38.89 
 
 
521 aa  96.7  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.867748  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1671  HNH endonuclease  35.37 
 
 
567 aa  96.3  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2829  HNH endonuclease  37.59 
 
 
469 aa  95.1  3e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.418942  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15770  HNH endonuclease  35 
 
 
360 aa  94.7  4e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.323971  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4258  HNH endonuclease  41.88 
 
 
443 aa  94.7  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137511  normal  0.228597 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29150  hypothetical protein  41.73 
 
 
502 aa  92  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1427  HNH endonuclease  34.97 
 
 
546 aa  92  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.899807  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4047  HNH endonuclease  37.14 
 
 
516 aa  90.1  9e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0910573  normal  0.468754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3225  HNH endonuclease  35.21 
 
 
561 aa  89.4  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.978165  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1982  hypothetical protein  44.74 
 
 
310 aa  87.4  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.840083 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3157  HNH endonuclease  37.5 
 
 
441 aa  86.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000184807  hitchhiker  0.000205863 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31690  hypothetical protein  40.94 
 
 
577 aa  82.4  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06130  HNH endonuclease  40.94 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4123  HNH nuclease  40 
 
 
572 aa  80.5  0.00000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.621245 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3610  hypothetical protein  38.57 
 
 
228 aa  80.1  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1057  hypothetical protein  36.59 
 
 
567 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0946  hypothetical protein  35.23 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06770  hypothetical protein  35.29 
 
 
523 aa  78.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.417774  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3063  hypothetical protein  37.11 
 
 
480 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0277279  normal  0.257272 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3830  hypothetical protein  37.98 
 
 
512 aa  77  0.0000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0246359  normal  0.0803767 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3047  hypothetical protein  36.48 
 
 
480 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3106  hypothetical protein  36.48 
 
 
480 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.449478  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3596  hypothetical protein  36.69 
 
 
464 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.736213  normal  0.654311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4252  hypothetical protein  41.13 
 
 
578 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.698404  normal  0.0628419 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1708  HNH endonuclease  32.95 
 
 
519 aa  75.9  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0664589  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3627  HNH endonuclease  35.48 
 
 
743 aa  74.3  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0415546 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2220  HNH endonuclease  44.44 
 
 
535 aa  73.6  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.176223  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3736  HNH nuclease  35.42 
 
 
661 aa  73.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.232879  normal  0.0693665 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13091  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  73.2  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000169747  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1040  hypothetical protein  39.52 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.35797  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2855  hypothetical protein  38.71 
 
 
581 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1056  hypothetical protein  39.52 
 
 
593 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.240254 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2899  hypothetical protein  38.71 
 
 
581 aa  72.8  0.00000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.613632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3082  HNH endonuclease  35.66 
 
 
709 aa  72.8  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.520788  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2886  hypothetical protein  39.52 
 
 
578 aa  72.4  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.816212  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0807  HNH endonuclease  36.51 
 
 
566 aa  72  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3819  HNH endonuclease  40.18 
 
 
620 aa  72  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.125126  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4022  hypothetical protein  39.52 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4097  hypothetical protein  39.52 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.481016  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3127  HNH nuclease  30.66 
 
 
474 aa  70.9  0.00000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0215087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3345  HNH nuclease  33.79 
 
 
469 aa  70.5  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12134  hypothetical protein  42.59 
 
 
550 aa  69.7  0.0000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000034137  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0390  HNH endonuclease  29.94 
 
 
405 aa  69.7  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1140  HNH nuclease  29.94 
 
 
405 aa  70.1  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.998579  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2756  HNH nuclease  26.89 
 
 
550 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3644  HNH endonuclease  34.27 
 
 
408 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.499825  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5096  HNH nuclease  35.24 
 
 
442 aa  68.9  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13810  hypothetical protein  41.67 
 
 
519 aa  68.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.200987  normal  0.109205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0611  HNH endonuclease  35.24 
 
 
432 aa  68.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0314  hypothetical protein  37.8 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.189609 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3052  HNH endonuclease  29.34 
 
 
403 aa  67.8  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00448111  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0538  HNH nuclease  28.65 
 
 
404 aa  67.8  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.357071  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0426  hypothetical protein  39.45 
 
 
539 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0327015  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3778  hypothetical protein  40.18 
 
 
473 aa  66.6  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.499553 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3341  HNH nuclease  35.33 
 
 
408 aa  65.9  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0650205  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3785  HNH endonuclease  39.81 
 
 
498 aa  65.1  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0713491  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10397  13E12 repeat-containing protein  45.07 
 
 
441 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09750  HNH endonuclease  43.59 
 
 
494 aa  65.5  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00000378313  normal  0.0136835 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3920  hypothetical protein  40.95 
 
 
508 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319111  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1741  HNH nuclease  36 
 
 
414 aa  65.1  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.206853  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3994  hypothetical protein  40.95 
 
 
508 aa  64.7  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.00383359  normal  0.960587 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4099  hypothetical protein  41.82 
 
 
517 aa  64.3  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.165873  normal  0.595439 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0347  HNH endonuclease  37.25 
 
 
627 aa  64.3  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5084  hypothetical protein  31.75 
 
 
434 aa  63.9  0.000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113034  normal  0.299663 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1199  hypothetical protein  33.75 
 
 
505 aa  63.9  0.000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0663076  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0069  HNH nuclease  32.64 
 
 
413 aa  63.2  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10341  13E12 repeat-containing protein  43.66 
 
 
511 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10526  13E12 repeat-containing protein  43.66 
 
 
488 aa  63.5  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1463  HNH nuclease  36.05 
 
 
414 aa  63.2  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0728  hypothetical protein  36.84 
 
 
535 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0834953 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02590  HNH endonuclease  34.78 
 
 
169 aa  63.5  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1180  hypothetical protein  40.91 
 
 
519 aa  63.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209528  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4785  hypothetical protein  30.95 
 
 
434 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.407603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>