More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02150 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
246 aa  483  1e-135  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  67.69 
 
 
262 aa  283  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.96 
 
 
257 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.07 
 
 
248 aa  254  7e-67  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.01 
 
 
252 aa  247  1e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  57.02 
 
 
258 aa  246  3e-64  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.09 
 
 
250 aa  241  7.999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  55.32 
 
 
246 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.02 
 
 
254 aa  226  3e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.16 
 
 
525 aa  225  6e-58  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.59 
 
 
238 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.15 
 
 
1051 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.42 
 
 
244 aa  211  9e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.42 
 
 
263 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
263 aa  211  1e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
263 aa  208  5e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.89 
 
 
1314 aa  208  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.3 
 
 
1052 aa  207  1e-52  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  48.51 
 
 
249 aa  207  2e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.14 
 
 
251 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.88 
 
 
1053 aa  204  8e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.17 
 
 
1051 aa  204  9e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.46 
 
 
243 aa  204  1e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.3 
 
 
1053 aa  202  3e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  49.58 
 
 
262 aa  202  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
244 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  42.32 
 
 
1055 aa  199  3e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.26 
 
 
1050 aa  199  3e-50  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.08 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.79 
 
 
236 aa  195  5.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  49.15 
 
 
268 aa  194  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.12 
 
 
248 aa  193  2e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.86 
 
 
240 aa  186  2e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.16 
 
 
313 aa  186  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.63 
 
 
1088 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.03 
 
 
253 aa  182  3e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.98 
 
 
1053 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.98 
 
 
250 aa  181  9.000000000000001e-45  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  43.83 
 
 
260 aa  172  5e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.84 
 
 
252 aa  169  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  42.35 
 
 
1125 aa  164  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.02 
 
 
252 aa  164  9e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.49 
 
 
223 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.97 
 
 
248 aa  113  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  32.78 
 
 
219 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  35.71 
 
 
248 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  35.56 
 
 
1327 aa  105  7e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  36.36 
 
 
242 aa  99.8  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  33.06 
 
 
219 aa  98.6  8e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  32.24 
 
 
216 aa  96.7  3e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.7 
 
 
218 aa  96.7  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  35.81 
 
 
218 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  29.81 
 
 
223 aa  94  2e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  33.88 
 
 
246 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  30.3 
 
 
215 aa  93.6  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.89 
 
 
214 aa  93.2  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0055  beta-phosphoglucomutase  33.81 
 
 
220 aa  92.4  5e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000775406  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  30.63 
 
 
221 aa  91.3  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  31.92 
 
 
230 aa  89.7  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0217  HAD family sugar phosphatase  30.54 
 
 
220 aa  89.7  4e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000425935  hitchhiker  0.000000624715 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  30.54 
 
 
219 aa  89.4  4e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.79 
 
 
245 aa  89  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1531  beta-phosphoglucomutase  30.5 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.19 
 
 
242 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  30.05 
 
 
209 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0811  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.61 
 
 
225 aa  87.4  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.332678 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.91 
 
 
242 aa  86.7  3e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0532  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
248 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2157  beta-phosphoglucomutase  29.7 
 
 
585 aa  83.6  0.000000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
221 aa  82  0.000000000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  29 
 
 
207 aa  82  0.000000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0895  HAD family sugar phosphatase  28.51 
 
 
228 aa  82  0.000000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.76 
 
 
217 aa  81.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  36.17 
 
 
221 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  29.85 
 
 
215 aa  81.3  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  32.98 
 
 
978 aa  81.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  32.79 
 
 
227 aa  81.6  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  33.76 
 
 
218 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  31.17 
 
 
208 aa  80.5  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1402  beta-phosphoglucomutase  27 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.340542  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0409  HAD family hydrolase  29.61 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  32.12 
 
 
965 aa  79.7  0.00000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4795  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.15 
 
 
268 aa  79.7  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7385  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  37.85 
 
 
248 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  31.67 
 
 
221 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.31 
 
 
227 aa  78.2  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  29.44 
 
 
221 aa  78.2  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  27.97 
 
 
220 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  29.82 
 
 
216 aa  78.6  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  26.09 
 
 
220 aa  77  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.583067  normal  0.103324 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1356  HAD family hydrolase  26.16 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.14421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  27.39 
 
 
456 aa  76.6  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  32.98 
 
 
202 aa  76.6  0.0000000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3349  phosphatase/phosphohexomutase-like  26.6 
 
 
221 aa  76.6  0.0000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0143367  normal  0.0340969 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  26.12 
 
 
396 aa  75.9  0.0000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30.81 
 
 
233 aa  75.1  0.0000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.54 
 
 
238 aa  74.7  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2878  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.59 
 
 
233 aa  75.1  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2948  HAD-superfamily hydrolase  31.28 
 
 
221 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2465  HAD family hydrolase  29.06 
 
 
220 aa  74.3  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>