136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_02000 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_02000  hypothetical protein  100 
 
 		 420 aa  813    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0286  protein of unknown function DUF1212  61.59 
 
 		 440 aa  482  1e-135  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.153937  normal  0.0652843 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0517  protein of unknown function DUF1212  55.74 
 
 		 422 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0133361  hitchhiker  0.00000293243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0175  protein of unknown function DUF1212  55.9 
 
 		 433 aa  373  1e-102  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4593  protein of unknown function DUF1212  50 
 
 		 422 aa  331  2e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0870  hypothetical protein  38.59 
 
 		 415 aa  270  5e-71  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1527  hypothetical protein  34.92 
 
 		 455 aa  227  3e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1397  hypothetical protein  39.51 
 
 		 637 aa  222  8e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1317  hypothetical protein  32.6 
 
 		 451 aa  219  7.999999999999999e-56  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0825512  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0019  hypothetical protein  36.99 
 
 		 573 aa  210  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0694356 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0850  hypothetical protein  34.04 
 
 		 458 aa  193  5e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000674483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3002  hypothetical protein  31.09 
 
 		 418 aa  159  8e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.682044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2856  hypothetical protein  31.13 
 
 		 289 aa  99.8  8e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00225782  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1048  hypothetical protein  26.6 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0526443  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3086  hypothetical protein  28.63 
 
 		 252 aa  95.5  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0970  hypothetical protein  31.97 
 
 		 253 aa  94.7  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.215146  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0982  hypothetical protein  32.13 
 
 		 253 aa  95.1  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.109631  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1039  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000460827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1072  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  95.1  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0364  membrane protein  28.12 
 
 		 259 aa  93.6  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.171907  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00803  hypothetical protein  29.76 
 
 		 266 aa  92.8  9e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04241  predicted inner membrane protein  27.82 
 
 		 256 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00100125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3633  protein of unknown function DUF1212  27.82 
 
 		 256 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000233755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3320  protein of unknown function DUF1212  31.3 
 
 		 253 aa  92.4  1e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.231123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0191  hypothetical protein  29.66 
 
 		 262 aa  92.8  1e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.890079  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5877  hypothetical protein  27.82 
 
 		 274 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00509244  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04207  hypothetical protein  27.82 
 
 		 256 aa  92.8  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00106289  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3691  hypothetical protein  27.82 
 
 		 256 aa  92.4  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00109237  hitchhiker  0.00166736 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4596  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  1.19778e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4957  hypothetical protein  27.82 
 
 		 277 aa  92  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000264038  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3648  hypothetical protein  31.71 
 
 		 253 aa  90.9  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3216  hypothetical protein  32.13 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00414919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2826  hypothetical protein  31.2 
 
 		 253 aa  91.3  3e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.270543  normal  0.361668 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4909  hypothetical protein  27.42 
 
 		 274 aa  89.7  8e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000641021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4904  hypothetical protein  27.42 
 
 		 277 aa  89.7  9e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000992297  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001670  hypothetical protein  31.25 
 
 		 266 aa  89.4  1e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.131782  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0898  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  89  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0152477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3122  hypothetical protein  31.33 
 
 		 253 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0522  hypothetical protein  27.94 
 
 		 258 aa  87.8  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00205537 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1290  hypothetical protein  29.41 
 
 		 258 aa  85.5  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.813938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0855  hypothetical protein  28.52 
 
 		 252 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00301757  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4901  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  85.1  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.528257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4867  inner membrane protein YjjP  25.51 
 
 		 303 aa  84.7  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.573654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4960  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  84.3  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4954  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4800  hypothetical protein  25.91 
 
 		 314 aa  84  0.000000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.329645  normal  0.457693 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2924  hypothetical protein  31.27 
 
 		 253 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000395261  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0872  hypothetical protein  29.27 
 
 		 253 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0780  hypothetical protein  26.72 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.494899  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3580  hypothetical protein  26.72 
 
 		 266 aa  82  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3451  hypothetical protein  27.13 
 
 		 266 aa  81.3  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1964  hypothetical protein  26.05 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1007  hypothetical protein  29.32 
 
 		 253 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.306388  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0557  protein of unknown function DUF1212  26.61 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.936785  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3643  hypothetical protein  27.94 
 
 		 273 aa  79  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1691  ThrE family exporter large subunit  26.05 
 
 		 267 aa  78.6  0.0000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3838  protein of unknown function DUF1212  27.94 
 
 		 279 aa  79  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1546  protein of unknown function DUF1212  27.69 
 
 		 426 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2002  hypothetical protein  27.41 
 
 		 262 aa  77.8  0.0000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0269225 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0957  hypothetical protein  29.27 
 
 		 253 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0597  protein of unknown function DUF1212  26.8 
 
 		 258 aa  76.3  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.43168  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0718  hypothetical protein  26.32 
 
 		 266 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.372885 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2596  hypothetical protein  29.43 
 
 		 281 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.517735  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8725  protein of unknown function DUF1212  28.37 
 
 		 461 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0908337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3691  hypothetical protein  28.15 
 
 		 261 aa  71.2  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.411423  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1476  protein of unknown function DUF1212  26.62 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.783892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1613  hypothetical protein  28.07 
 
 		 421 aa  63.2  0.000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0772  hypothetical protein  25 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.988975  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0908  protein of unknown function DUF1212  27.12 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.395602  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1962  protein of unknown function DUF1212  29.84 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0150285  hitchhiker  0.00184472 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3684  hypothetical protein  22.12 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0308  hypothetical protein  22.51 
 
 		 406 aa  59.3  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3672  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0273  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0887  protein of unknown function DUF1212  24.34 
 
 		 511 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3876  hypothetical protein  22.3 
 
 		 406 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0425412 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04050  hypothetical protein  26.45 
 
 		 634 aa  58.2  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0411  hypothetical protein  25.38 
 
 		 164 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0711  hypothetical protein  28.57 
 
 		 163 aa  57.4  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0549551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6449  hypothetical protein  25.06 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0151051  normal  0.0379764 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1433  hypothetical protein  22.38 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.684015  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0768  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0137277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0785  hypothetical protein  25 
 
 		 164 aa  57  0.0000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.218782  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00140  hypothetical protein  21.45 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0380  hypothetical protein  22.09 
 
 		 406 aa  55.8  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4092  hypothetical protein  21.8 
 
 		 406 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4179  hypothetical protein  21.38 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3983  protein of unknown function DUF1212  21.38 
 
 		 406 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1927  protein of unknown function DUF1212  27.88 
 
 		 466 aa  54.3  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.439769  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2185  hypothetical protein  23.98 
 
 		 256 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3441  hypothetical protein  22.91 
 
 		 422 aa  53.9  0.000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0291349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1662  hypothetical protein  25.06 
 
 		 414 aa  53.5  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0394  hypothetical protein  21.34 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4061  hypothetical protein  21.14 
 
 		 406 aa  53.1  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1818  hypothetical protein  25.23 
 
 		 475 aa  53.1  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1896  hypothetical protein  23.58 
 
 		 256 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0799  protein of unknown function DUF1212  25.82 
 
 		 239 aa  52.4  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1064  protein of unknown function DUF1212  27.72 
 
 		 478 aa  51.6  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.103063  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4220  hypothetical protein  22.41 
 
 		 406 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3640  protein of unknown function DUF1212  25.94 
 
 		 467 aa  51.2  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>