78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00970 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00970  transcriptional regulator, tetR family  100 
 
 		 195 aa  379  1e-104  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2788  transcriptional regulator, TetR family  66.84 
 
 		 191 aa  252  3e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2085  regulatory protein TetR  49.74 
 
 		 194 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  49.18 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2000  transcriptional regulator, TetR family  49.08 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.564621  normal  0.698036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4461  transcriptional regulator, TetR family  46.86 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1142  transcriptional regulator, TetR family  43.9 
 
 		 206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.759817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5854  hypothetical protein  45.4 
 
 		 190 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4231  regulatory protein TetR  48.33 
 
 		 188 aa  125  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4405  hypothetical protein  42.7 
 
 		 205 aa  119  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00842342 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1480  hypothetical protein  42.94 
 
 		 190 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.473033  normal  0.172398 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  40 
 
 		 183 aa  118  6e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5284  hypothetical protein  44.83 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.325627 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19390  transcriptional regulator, tetR family  43.96 
 
 		 189 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4715  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 185 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4730  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 182 aa  102  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5140  transcriptional regulator, putative  31.87 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5151  transcriptional regulator, TetR family  31.35 
 
 		 185 aa  102  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.687993  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5113  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 182 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5145  putative transcriptional regulator  31.32 
 
 		 182 aa  100  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.733226  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4831  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 		 185 aa  99.8  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4873  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5244  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 182 aa  99.4  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0714  transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 		 197 aa  95.5  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.113218 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 218 aa  87  1e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 		 192 aa  85.5  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0128  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 191 aa  84.7  9e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 212 aa  79  0.00000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1278  TetR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 191 aa  77.8  0.00000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.190846  normal  0.885926 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0927  putative transcriptional regulator, TetR family  34.64 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.594816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2709  regulatory protein TetR  34.59 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.69 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4198  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 191 aa  50.4  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000131779  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  49.02 
 
 		 283 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 211 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  52.27 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  53.49 
 
 		 240 aa  45.8  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0468  putative transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 		 319 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  33.6 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  33.6 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  33.6 
 
 		 225 aa  45.4  0.0005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  50.98 
 
 		 263 aa  45.1  0.0006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 272 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 235 aa  45.1  0.0007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 234 aa  45.1  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 224 aa  45.1  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4603  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204139  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 228 aa  43.9  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  26.7 
 
 		 222 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  46.67 
 
 		 310 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 250 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3125  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.328687  normal  0.85949 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  25.53 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  41.89 
 
 		 253 aa  42.7  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 243 aa  42.7  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  26.76 
 
 		 237 aa  43.1  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 250 aa  42.4  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  30.11 
 
 		 191 aa  42.4  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1793  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 216 aa  42  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 258 aa  42.4  0.005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 255 aa  42  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4188  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 256 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 195 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  32.95 
 
 		 218 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 244 aa  41.2  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>