More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00900 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  100 
 
 		 412 aa  817    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0225  amidohydrolase  70.1 
 
 		 403 aa  582  1.0000000000000001e-165  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.235888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0114  amidohydrolase  72.82 
 
 		 407 aa  550  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3129  amidohydrolase  67.66 
 
 		 424 aa  533  1e-150  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0569709  decreased coverage  0.0000154843 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  63.09 
 
 		 403 aa  499  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0524  amidohydrolase  63.57 
 
 		 397 aa  498  1e-140  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3778  amidohydrolase  63.28 
 
 		 402 aa  494  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.509306 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  58.03 
 
 		 402 aa  439  9.999999999999999e-123  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3072  amidohydrolase  54.97 
 
 		 388 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0120887  normal  0.513246 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3656  amidohydrolase  54.79 
 
 		 420 aa  391  1e-107  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  48.56 
 
 		 385 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  52.84 
 
 		 390 aa  370  1e-101  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  47.76 
 
 		 384 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  47.76 
 
 		 386 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2020  amidohydrolase  48.06 
 
 		 387 aa  345  1e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  47.41 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0442  amidohydrolase  47 
 
 		 384 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000563176  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2749  amidohydrolase  46.23 
 
 		 384 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  46.34 
 
 		 383 aa  338  7e-92  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2892  amidohydrolase  45.05 
 
 		 385 aa  337  1.9999999999999998e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0670666  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  45.26 
 
 		 388 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1389  amidohydrolase  47.66 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0452707  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3741  amidohydrolase  45.55 
 
 		 386 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00788915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1547  amidohydrolase  43.57 
 
 		 385 aa  323  5e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.459283  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  44.71 
 
 		 386 aa  320  1.9999999999999998e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1777  amidohydrolase  45.01 
 
 		 400 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000349054  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0500  amidohydrolase  43.23 
 
 		 379 aa  316  5e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0798  amidohydrolase  41.43 
 
 		 396 aa  315  8e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.286142  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  45.5 
 
 		 386 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0188  amidohydrolase  40.84 
 
 		 392 aa  300  2e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1872  hypothetical protein  41.51 
 
 		 381 aa  298  9e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.267326  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3366  amidohydrolase  44.96 
 
 		 382 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00113589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  41.05 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  40.79 
 
 		 385 aa  289  6e-77  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0436  amidohydrolase  42.32 
 
 		 376 aa  283  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4806  chlorohydrolase family protein  40.69 
 
 		 376 aa  278  1e-73  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0569  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 373 aa  276  3e-73  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0424  imidazolonepropionase  40.43 
 
 		 376 aa  276  5e-73  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.224274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0570  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 376 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0517  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 376 aa  275  7e-73  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0428  imidazolonepropionase  40.43 
 
 		 376 aa  275  8e-73  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  41.01 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0485  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0495  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0514  chlorohydrolase family protein  40.43 
 
 		 376 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0431  amidohydrolase  39.89 
 
 		 376 aa  273  4.0000000000000004e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  38.08 
 
 		 429 aa  233  7.000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4501  amidohydrolase  36.88 
 
 		 441 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.787584 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0079  amidohydrolase  37.66 
 
 		 471 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.23873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0955  amidohydrolase  37.43 
 
 		 470 aa  208  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.247316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1326  amidohydrolase  35.41 
 
 		 475 aa  204  2e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.551422 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  34.34 
 
 		 525 aa  203  4e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  33.25 
 
 		 460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  34.67 
 
 		 461 aa  199  5e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  34.91 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510677 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0904  amidohydrolase  33.69 
 
 		 378 aa  192  1e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0032  amidohydrolase  31.39 
 
 		 464 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000361378  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2039  amidohydrolase  35.54 
 
 		 1498 aa  179  5.999999999999999e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12678  Secreted enzyme  30.49 
 
 		 988 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1420  amidohydrolase  32.63 
 
 		 401 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  32.53 
 
 		 1005 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  32.4 
 
 		 429 aa  171  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  31.3 
 
 		 908 aa  168  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5127  amidohydrolase  30.95 
 
 		 1010 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.326983 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  30.95 
 
 		 1020 aa  161  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2106  amidohydrolase  33.84 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0604299  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2586  amidohydrolase  29.05 
 
 		 1046 aa  154  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0150896  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3238  amidohydrolase  30.13 
 
 		 1021 aa  153  5e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2857  amidohydrolase  28.78 
 
 		 1010 aa  152  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  29.9 
 
 		 1029 aa  151  2e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  29.92 
 
 		 1024 aa  151  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  29.9 
 
 		 763 aa  151  3e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  29.9 
 
 		 1029 aa  149  8e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1443  amidohydrolase  29.27 
 
 		 1024 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  29.67 
 
 		 1024 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  29.41 
 
 		 839 aa  148  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1167  amidohydrolase-like domain-containing protein  30.07 
 
 		 1018 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  29.67 
 
 		 1024 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6761  amidohydrolase  34.02 
 
 		 444 aa  147  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3148  hypothetical protein  30.08 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  29.65 
 
 		 1029 aa  144  4e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1325  amidohydrolase  31.33 
 
 		 424 aa  122  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.339534 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6762  amidohydrolase  42.08 
 
 		 560 aa  116  6e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3239  hypothetical protein  27.6 
 
 		 435 aa  109  8.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.534438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0080  amidohydrolase 3  32.9 
 
 		 428 aa  107  4e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.600035  normal  0.524396 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1505  amidohydrolase  28.27 
 
 		 430 aa  107  4e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000371638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  28.69 
 
 		 430 aa  102  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2858  hypothetical protein  25.85 
 
 		 467 aa  99.4  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1442  hypothetical protein  27.42 
 
 		 439 aa  99.4  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4175  amidohydrolase  27.75 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.000266471  hitchhiker  0.0000965062 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3629  amidohydrolase family protein  29.43 
 
 		 430 aa  97.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.358835  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2587  hypothetical protein  29.33 
 
 		 422 aa  94  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.518725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0033  amidohydrolase  28.92 
 
 		 418 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000676749  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0956  hypothetical protein  29.47 
 
 		 421 aa  89.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1772  amidohydrolase  28.4 
 
 		 433 aa  86.7  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.132205  normal  0.601217 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1166  hypothetical protein  27.65 
 
 		 419 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1414  hypothetical protein  26.57 
 
 		 429 aa  84  0.000000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.861913  normal  0.154927 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5128  metal-dependent hydrolase superfamily protein  28.17 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.485359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2998  hypothetical protein  25.92 
 
 		 448 aa  83.2  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3149  hypothetical protein  27.01 
 
 		 428 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>