234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00820 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_00820  phosphate/sulfate permease  100 
 
 
323 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  decreased coverage  0.00395878  normal  0.1241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7343  putative low-affinity phosphate transporter  36.42 
 
 
312 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1534  phosphate transporter  39.35 
 
 
319 aa  129  6e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5567  Phosphate/sulphate permease-like protein  36.08 
 
 
326 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1188  phosphate transporter  31 
 
 
336 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.198901  normal  0.0620893 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1249  phosphate transporter  31 
 
 
336 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0366515  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1313  inorganic phosphate transporter  31 
 
 
336 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2000  phosphate transporter  31.35 
 
 
335 aa  100  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2217  phosphate transporter  32.21 
 
 
427 aa  92.4  1e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1973  phosphate transporter  30 
 
 
336 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.137015  normal  0.10663 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1123  phosphate transporter  28.04 
 
 
335 aa  87  4e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000161634  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0911  phosphate transporter  31.6 
 
 
378 aa  87  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5449  phosphate transporter  31.36 
 
 
386 aa  86.7  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0370554  normal  0.318098 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3761  putative low-affinity phosphate transport protein  28.21 
 
 
336 aa  86.3  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.253043  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5972  phosphate transporter  30.57 
 
 
334 aa  85.9  8e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.115846 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1687  phosphate transporter  30.49 
 
 
336 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1527  phosphate transporter  30.31 
 
 
411 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.0143461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5168  phosphate transporter  27.6 
 
 
336 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0592  phosphate transporter  27.6 
 
 
336 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6211  phosphate transporter  27.04 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.450178  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0043  phosphate transporter  26.41 
 
 
331 aa  85.1  0.000000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1868  phosphate transporter  27.04 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1891  phosphate transporter  27.04 
 
 
336 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00123921  hitchhiker  0.0000000789991 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3393  phosphate transporter  28.24 
 
 
334 aa  83.2  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0414241  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2887  phosphate transporter  29.15 
 
 
370 aa  83.2  0.000000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0587  phosphate transporter  26.07 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.527473  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10556  low affinity inorganic phosphate transporter integral membrane protein pitA  30.18 
 
 
417 aa  83.6  0.000000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0205313  normal  0.167951 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1404  phosphate transporter  26.6 
 
 
336 aa  83.2  0.000000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3781  phosphate transporter  26.58 
 
 
333 aa  82.8  0.000000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.843739  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1748  phosphate transporter  28 
 
 
332 aa  82.4  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0493657 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0027  hypothetical protein  27.09 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0028  hypothetical protein  27.09 
 
 
331 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0559  phosphate transporter  24.84 
 
 
313 aa  82.4  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4378  phosphate transporter  28.51 
 
 
353 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0749407 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3015  putative low-affinity phosphate transporter lipoprotein transmembrane  28.48 
 
 
336 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.360288  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1777  phosphate transporter  25.16 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1646  phosphate transporter  25 
 
 
329 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1805  phosphate transporter  25.16 
 
 
336 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.3367  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5202  phosphate transporter  28.57 
 
 
334 aa  80.9  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.204566 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5472  phosphate transporter  28.33 
 
 
333 aa  80.5  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.57273 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0129  phosphate transporter  26.4 
 
 
338 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0190  phosphate transporter  26.25 
 
 
336 aa  80.5  0.00000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.177955 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0450  phosphate transporter  27.95 
 
 
333 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.275833  normal  0.360764 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2499  phosphate transporter  29.48 
 
 
346 aa  80.1  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.617445  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1398  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.476301  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4384  phosphate transporter  27.9 
 
 
352 aa  79.7  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.622735  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0043  phosphate transporter  26.96 
 
 
331 aa  79.7  0.00000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1888  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.527303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0008  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0756499  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2245  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.513907  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2284  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1161  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0952  phosphate transporter  26.79 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.775195  normal  0.447908 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3185  phosphate transporter  27.76 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.987096 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1406  phosphate transporter  25.47 
 
 
336 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.596183  normal  0.662482 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2410  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
354 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.201685  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0563  phosphate transporter family protein  26.79 
 
 
332 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0917  phosphate transporter  28.67 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.171817  normal  0.295731 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4361  phosphate transporter  28.25 
 
 
352 aa  79  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2185  phosphate transporter family protein  25.81 
 
 
354 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.552455  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3865  phosphate transporter  27.17 
 
 
333 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0549  phosphate permease  26.79 
 
 
332 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1152  phosphate transporter  28.19 
 
 
336 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0053  phosphate transporter  32.26 
 
 
327 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4228  phosphate transporter  27.59 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1083  phosphate transporter  26.8 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1399  phosphate transporter  27.96 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0717  phosphate transporter  28.24 
 
 
337 aa  78.2  0.0000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0762  phosphate transporter  27.07 
 
 
343 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.217274  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1881  phosphate transporter  27.78 
 
 
336 aa  78.2  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0389  phosphate transporter, putative  25.89 
 
 
333 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.214855  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2523  phosphate transporter  28.21 
 
 
338 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0983692  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2706  phosphate transporter  26.5 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.906266  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3358  phosphate transporter  26.5 
 
 
336 aa  77.4  0.0000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.450825 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2031  phosphate transporter  28.44 
 
 
334 aa  77  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.357489  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2335  phosphate transporter  29.69 
 
 
336 aa  77  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.90978  normal  0.624995 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0188  phosphate transporter  32.43 
 
 
405 aa  77  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0449142  normal  0.16413 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1470  phosphate transporter  28.8 
 
 
336 aa  76.6  0.0000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5348  phosphate transporter  28.79 
 
 
336 aa  76.3  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1678  phosphate transporter  29.5 
 
 
334 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.397083  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1237  phosphate transporter  26.52 
 
 
326 aa  76.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0843  phosphate transporter  25.56 
 
 
332 aa  76.3  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.240506  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1443  phosphate transporter  26.48 
 
 
373 aa  76.3  0.0000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.315159  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4135  phosphate transporter  25.56 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161666  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0034  phosphate transporter  27.63 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.81002  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3161  phosphate transporter  28.53 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2395  phosphate transporter  26.58 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.38618  normal  0.093565 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0031  phosphate transporter  27.18 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.952576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_32  phosphate/sulfate transporter, PiT family  27.96 
 
 
333 aa  75.1  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1485  phosphate transporter  24.76 
 
 
332 aa  75.1  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000164623  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1798  phosphate transporter  29.36 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000136654 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2946  phosphate transporter  28.66 
 
 
334 aa  73.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.747547  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2275  phosphate transporter  26.2 
 
 
337 aa  73.9  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265898  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1792  phosphate transporter  26.67 
 
 
336 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.60749  normal  0.0142834 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0180  phosphate transporter  29.47 
 
 
334 aa  73.6  0.000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0300  phosphate transporter  29.77 
 
 
332 aa  73.6  0.000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.942291  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8018  phosphate transporter  28.43 
 
 
335 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.325586  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0589  phosphate transporter  26.06 
 
 
385 aa  73.6  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3131  phosphate transporter  24.28 
 
 
333 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00242659  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2117  phosphate transporter  22.12 
 
 
332 aa  72  0.00000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0147275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>