42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00770  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  100 
 
 		 707 aa  1451    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.233657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3768  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.9 
 
 		 285 aa  57  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0487365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3104  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.65 
 
 		 255 aa  56.2  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02734  glycerophosphodiester phosphodiesterase  30.18 
 
 		 304 aa  56.2  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3520  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.14 
 
 		 257 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03330  avirulence protein AvrBs2  29.85 
 
 		 660 aa  55.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0978  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.09 
 
 		 309 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515324  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0959  glycerophosphodiester phosphodiesterase  32.09 
 
 		 309 aa  53.1  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0955331  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3036  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.06 
 
 		 264 aa  52  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1047  hypothetical protein  29.85 
 
 		 282 aa  52  0.00004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.708325 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3733  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  30.71 
 
 		 281 aa  50.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000178181  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2735  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.79 
 
 		 251 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0547  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase GlpQ, putative  31.3 
 
 		 349 aa  50.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0237  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.43 
 
 		 331 aa  49.3  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2740  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.55 
 
 		 243 aa  48.1  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.932941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1886  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  31.13 
 
 		 235 aa  47.8  0.0006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.572243 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3080  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.69 
 
 		 250 aa  47  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.943179  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1217  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.49 
 
 		 296 aa  47.4  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  27.96 
 
 		 1712 aa  47  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0420  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25.69 
 
 		 247 aa  46.6  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0913  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.03 
 
 		 236 aa  47  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0799  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase, putative  25.42 
 
 		 259 aa  45.8  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3143  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.47 
 
 		 257 aa  45.8  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0910478 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10322  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase glpQ2  31.68 
 
 		 256 aa  46.2  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.994523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4126  glycerophosphodiester phosphodiesterase  34.43 
 
 		 238 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1405  glycerophosphodiester phosphodiesterase  27.14 
 
 		 243 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000995679  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0092  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.93 
 
 		 233 aa  45.4  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04050  conserved hypothetical protein  51.11 
 
 		 373 aa  45.4  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.991162  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0440  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  23.68 
 
 		 460 aa  45.8  0.003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0424  putative glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  25 
 
 		 245 aa  45.4  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4436  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.15 
 
 		 253 aa  45.4  0.004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0113118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1855  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.67 
 
 		 271 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000949147  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4069  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  34.15 
 
 		 253 aa  45.1  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.117594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0251  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  33.33 
 
 		 256 aa  45.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1393  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  23.36 
 
 		 242 aa  45.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2842  Glycerophosphodiester phosphodiesterase  25.12 
 
 		 416 aa  45.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0933431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5255  glycerophosphodiester phosphodiesterase  28.68 
 
 		 240 aa  44.7  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.457448  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2968  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.56 
 
 		 289 aa  44.3  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1122  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  28.57 
 
 		 241 aa  44.3  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1700  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  26.62 
 
 		 247 aa  44.3  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0978  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  27.91 
 
 		 259 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.337552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1768  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  29.13 
 
 		 596 aa  43.9  0.01  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000167505  hitchhiker  0.00433617 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>