84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00720 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00720  transcriptional regulator  100 
 
 		 153 aa  306  5.9999999999999995e-83  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.322851  normal  0.322899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4204  MarR family transcriptional regulator  50.99 
 
 		 158 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.880784 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0649  transcriptional regulator, MarR family  33.82 
 
 		 152 aa  71.2  0.000000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.827556  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6069  transcriptional regulator, MarR family  39.42 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.683287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 173 aa  69.7  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3635  MarR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 158 aa  68.2  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0286016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3828  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 643 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.395524  normal  0.17414 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3916  major facilitator superfamily transporter  30.57 
 
 		 643 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3842  major facilitator transporter  30.57 
 
 		 643 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.632161  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4803  transcriptional regulator, MarR family  36.69 
 
 		 154 aa  67  0.00000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.833375  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0305  transcriptional regulator, MarR family  35.78 
 
 		 172 aa  66.6  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1889  MarR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 192 aa  63.9  0.0000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.882763 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0886  transcriptional regulator, MarR family  30.14 
 
 		 142 aa  63.5  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.221298  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0762  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 178 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2790  MarR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 170 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0295  transcriptional regulator, MarR family  30.53 
 
 		 161 aa  61.6  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2935  transcriptional regulator, MarR family  34.74 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00693661  hitchhiker  0.00247077 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0435  MarR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4619  regulatory protein MarR  44.12 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.466071  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3512  transcriptional regulator, MarR family  34 
 
 		 188 aa  58.2  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2263  transcriptional regulator, MarR family  34.4 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000218689  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2171  regulatory protein, MarR  31.43 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4671  transcriptional regulator, MarR family  32.77 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.172842  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4277  transcriptional regulator, MarR family  37.39 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0245494  normal  0.333889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2524  transcriptional regulator, MarR family  35.11 
 
 		 161 aa  55.5  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9227  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.429964  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0465  transcriptional regulator, MarR family  32.69 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.203979  normal  0.101553 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0774  regulatory protein, MarR  25.89 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.957348  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4469  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3511  transcriptional regulator, MarR family  30.37 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0549  transcriptional regulator, MarR family  28.36 
 
 		 157 aa  51.6  0.000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3868  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.334531 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4328  MarR family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 143 aa  50.4  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1526  MarR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.97312  normal  0.171281 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5869  MarR family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.263359 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4436  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1659  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1718  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 162 aa  48.9  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1651  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1623  transcriptional regulator, MarR family  30.7 
 
 		 162 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.347087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1458  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 172 aa  48.9  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00644177  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3930  MarR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.627094  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0540  MarR family transcriptional regulator  31.45 
 
 		 171 aa  49.3  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1861  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 		 174 aa  48.1  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.172751  normal  0.486159 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2822  transcriptional regulator, MarR family  30.5 
 
 		 166 aa  47.4  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00330926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4025  regulatory protein MarR  34.94 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.895224  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0297  transcriptional regulator, MarR family  28.12 
 
 		 165 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03639  hypothetical protein  26 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4796  transcriptional regulator, MarR family  36.25 
 
 		 156 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.599931  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1639  transcriptional regulator, MarR family  25.23 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0075  transcriptional regulator, MarR family  31.4 
 
 		 175 aa  45.4  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3405  transcriptional regulator, MarR family  26.77 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.34693  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 150 aa  44.3  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0853  HxlR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.841358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9192  transcriptional regulator  25.19 
 
 		 165 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4177  regulatory protein MarR  30.48 
 
 		 159 aa  44.3  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4139  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 175 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.369146  normal  0.177054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1797  transcriptional regulator, MarR family  26.55 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.109893  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1657  transcriptional regulator, MarR family  29.63 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384015  normal  0.405999 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3512  MarR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.332426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1460  transcriptional regulator, MarR family  21.93 
 
 		 174 aa  43.1  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000303133 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 139 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3810  transcriptional regulator, MarR family  30.21 
 
 		 175 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2291  MarR family transcriptional regulator  31.37 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00374497  hitchhiker  0.00208025 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1757  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 150 aa  42.7  0.002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.888678  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4091  MarR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4610  transcriptional regulator, MarR family  34.15 
 
 		 148 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.4763  normal  0.155158 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 154 aa  42  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3047  MarR family transcriptional regulator  25.66 
 
 		 161 aa  41.6  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2003  MarR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 144 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1956  transcriptional regulator  31 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.720732 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0615  MarR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.973636  normal  0.938625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6744  transcriptional regulator, MarR family  28.26 
 
 		 166 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.711191  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0663  transcriptional regulator, MarR family  23.96 
 
 		 165 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0218  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 143 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0956  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 161 aa  40.8  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.251e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0220  MarR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3184  transcriptional regulator, MarR family  26.61 
 
 		 162 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.824605 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  31.78 
 
 		 150 aa  40.8  0.008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002424  transcriptional regulator MarR family/GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 		 301 aa  40  0.01  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7314  transcriptional regulator  30.53 
 
 		 173 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1952  transcriptional regulator, MarR family  26.97 
 
 		 162 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4395  MarR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3782  transcriptional regulator, MarR family  28.21 
 
 		 150 aa  40.4  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>