81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00630 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00630  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  100 
 
 		 251 aa  492  9.999999999999999e-139  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.110321 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4452  transcriptional regulator, LuxR family  32.43 
 
 		 385 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6227  transcriptional regulator, TrmB  34.7 
 
 		 335 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0764257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1382  LuxR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 323 aa  91.3  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.341345  normal  0.0711224 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1421  transcriptional regulator, LuxR family  36.69 
 
 		 365 aa  90.9  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.1221 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5045  transcriptional regulator, TrmB  32.57 
 
 		 340 aa  89.7  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7639  transcriptional regulator, LuxR family  34.16 
 
 		 314 aa  86.7  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0189  LuxR family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6990  transcriptional regulator, LuxR family  30.94 
 
 		 339 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.458104  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1738  response regulator receiver protein  35.93 
 
 		 251 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2593  LuxR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 328 aa  78.2  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.183797  normal  0.0575455 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3448  transcriptional regulator, LuxR family  38.52 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0548579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6940  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 328 aa  75.9  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.288002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5682  transcriptional regulator, LuxR family  39.86 
 
 		 341 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.362244  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0476  transcriptional regulator, LuxR family  31.53 
 
 		 323 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00422983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2438  regulatory protein, LuxR  32.51 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.230213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4346  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  37.4 
 
 		 330 aa  72.8  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0082  transcriptional regulator, TrmB  34.34 
 
 		 321 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0426  response regulator receiver protein  50 
 
 		 219 aa  65.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6752  response regulator receiver protein  32.75 
 
 		 211 aa  65.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.843865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4574  transcriptional regulator, TrmB  39.53 
 
 		 328 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.524309  normal  0.732921 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3593  transcriptional regulator, LuxR family  39.42 
 
 		 338 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2388  LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 332 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.978656  normal  0.976658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4211  response regulator receiver protein  40.22 
 
 		 260 aa  60.1  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.941878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5791  transcriptional regulator protein-like protein  54.55 
 
 		 333 aa  55.8  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0418126  normal  0.0683499 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2856  regulatory protein, LuxR  44.44 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1159  response regulator receiver protein  34.53 
 
 		 336 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5215  hypothetical protein  27.8 
 
 		 332 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.122381  normal  0.240976 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32970  predicted transcriptional regulator  36 
 
 		 321 aa  53.1  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0475  transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 123 aa  52.8  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.282737  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0388  LuxR family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 477 aa  52.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.423385  normal  0.332303 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1716  LuxR family transcriptional regulator  50 
 
 		 118 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.18507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3765  LuxR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 140 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.825501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2446  transcriptional regulator, LuxR family  44.78 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0188  regulatory protein, LuxR  40 
 
 		 255 aa  50.4  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2873  two component LuxR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 216 aa  49.7  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0915  two component LuxR family transcriptional regulator  41.98 
 
 		 202 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000299753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1032  LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1464  transcriptional regulator TrmB  35.51 
 
 		 326 aa  47.4  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.862849  normal  0.230975 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  40.98 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.03 
 
 		 227 aa  46.2  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0902  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 208 aa  45.8  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.154451  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0906  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 208 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000244022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0418  transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 112 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0763  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein protein  45.83 
 
 		 919 aa  45.4  0.0009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.422144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2943  two component LuxR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 215 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3503  transcriptional regulator, TrmB  31.01 
 
 		 324 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  hitchhiker  0.00285748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3760  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.358522  normal  0.345814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0315  transcriptional regulator, LuxR family  30.58 
 
 		 337 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33784 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1299  two component LuxR family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 273 aa  45.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0170327 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0857  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  hitchhiker  0.00237341  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3486  hypothetical protein  40.74 
 
 		 206 aa  44.7  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0164  response regulator receiver protein  40.74 
 
 		 128 aa  44.3  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  44.64 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1523  ATP-dependent transcriptional regulator, MalT- like, LuxR family  42.62 
 
 		 873 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0366  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.41 
 
 		 220 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0587069  normal  0.203995 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0351  LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.147651  normal  0.0771656 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0926  regulatory protein, LuxR  43.48 
 
 		 878 aa  43.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.289088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 215 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3886  transcriptional regulator, LuxR family  35.92 
 
 		 326 aa  43.1  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.356923 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 222 aa  42.7  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 244 aa  42.7  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 215 aa  42.7  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0530  transcriptional regulator, LuxR family  31.71 
 
 		 217 aa  42.7  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1881  LuxR family transcriptional regulator  47.62 
 
 		 199 aa  42.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 216 aa  42.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4091  LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 191 aa  42.7  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0720604  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4096  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.811447  normal  0.807841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3947  transcriptional regulator, LuxR family  40.32 
 
 		 250 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.657672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  34.12 
 
 		 215 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3477  ATP-dependent transcription regulator LuxR  44.44 
 
 		 877 aa  42.4  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 212 aa  42.4  0.007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2672  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.86 
 
 		 219 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.240505 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3628  two component LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 292 aa  42.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.350857 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1403  LuxR response regulator receiver  41.82 
 
 		 214 aa  42  0.009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.676683  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3421  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.22 
 
 		 204 aa  42  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2742  LuxR response regulator receiver  39.58 
 
 		 219 aa  42  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3900  transcriptional regulator, LuxR family  48.15 
 
 		 592 aa  42  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.573736  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6830  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 270 aa  42  0.01  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>