More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00470 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001304  ANIA_10901  hypothetical glycine cleavage system P protein (Eurofung)  49.55 
 
 		 1058 aa  872    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0302112 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02735  glycine dehydrogenase  53.72 
 
 		 957 aa  966    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.168322  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0789  glycine dehydrogenase  53.72 
 
 		 957 aa  967    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3312  glycine dehydrogenase  57.64 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1094  glycine dehydrogenase  51.83 
 
 		 931 aa  928    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0703141  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0988  glycine dehydrogenase  56.18 
 
 		 951 aa  952    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5192  glycine dehydrogenase  54.03 
 
 		 957 aa  941    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1305  glycine dehydrogenase  48.56 
 
 		 955 aa  870    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2871  glycine dehydrogenase  61.09 
 
 		 948 aa  1087    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1431  glycine dehydrogenase  54.77 
 
 		 1003 aa  957    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.961766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26284  predicted protein  49.95 
 
 		 976 aa  930    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0122884  normal  0.247759 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3295  glycine dehydrogenase  56.53 
 
 		 982 aa  999    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_75631  Glycine cleavage system protein  48.43 
 
 		 1033 aa  896    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1276  glycine dehydrogenase  51.18 
 
 		 965 aa  953    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3846  glycine dehydrogenase  53.01 
 
 		 956 aa  1009    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0725  glycine dehydrogenase  54.95 
 
 		 932 aa  934    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0781  glycine dehydrogenase  50.82 
 
 		 962 aa  917    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1276  glycine dehydrogenase  56.58 
 
 		 954 aa  988    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.42567  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0870  glycine dehydrogenase  57.26 
 
 		 956 aa  987    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597554  normal  0.602316 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3929  glycine dehydrogenase  57.54 
 
 		 975 aa  1000    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0910742  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0619  glycine dehydrogenase  50.82 
 
 		 962 aa  908    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2993  glycine dehydrogenase  57.64 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0445  glycine dehydrogenase  49.59 
 
 		 949 aa  934    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1345  glycine dehydrogenase  56.96 
 
 		 950 aa  970    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01070  glycine dehydrogenase mitochondrial precursor, putative  45.85 
 
 		 1047 aa  844    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.540229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1096  glycine dehydrogenase  56.48 
 
 		 954 aa  984    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0796  glycine dehydrogenase  50.72 
 
 		 965 aa  926    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.477642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2465  glycine dehydrogenase  51.8 
 
 		 963 aa  951    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.421372  normal  0.628025 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1398  glycine dehydrogenase  63.86 
 
 		 957 aa  1130    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.67826  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1267  glycine dehydrogenase  49.95 
 
 		 968 aa  926    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.561773  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3331  glycine dehydrogenase  57.79 
 
 		 976 aa  1023    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2377  glycine dehydrogenase  64.34 
 
 		 938 aa  1110    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1284  glycine dehydrogenase  56.94 
 
 		 954 aa  1008    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.140607 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2762  glycine dehydrogenase  54.02 
 
 		 974 aa  996    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0129  glycine dehydrogenase  57.64 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3062  glycine dehydrogenase  49.69 
 
 		 962 aa  901    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4392  glycine dehydrogenase  56.12 
 
 		 950 aa  965    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142665 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5426  glycine dehydrogenase  53.29 
 
 		 957 aa  936    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447086  normal  0.0408977 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2195  glycine dehydrogenase  57.26 
 
 		 956 aa  987    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3323  glycine dehydrogenase  57.83 
 
 		 975 aa  1015    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2297  glycine dehydrogenase  57.28 
 
 		 956 aa  985    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.81309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2188  glycine dehydrogenase  54 
 
 		 958 aa  926    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3398  glycine dehydrogenase  61.59 
 
 		 952 aa  1104    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0619508  normal  0.284605 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2538  glycine dehydrogenase  54 
 
 		 960 aa  911    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4000  glycine dehydrogenase  57.13 
 
 		 970 aa  988    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1760  glycine dehydrogenase  44.75 
 
 		 969 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2047  glycine dehydrogenase  54.2 
 
 		 953 aa  937    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4865  glycine dehydrogenase  51.45 
 
 		 964 aa  968    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3209  glycine dehydrogenase  50.51 
 
 		 962 aa  912    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294821  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3253  glycine dehydrogenase  58.26 
 
 		 975 aa  1025    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21381  glycine dehydrogenase  49.85 
 
 		 968 aa  921    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.102572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4065  glycine dehydrogenase  60.2 
 
 		 1072 aa  1108    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3740  glycine dehydrogenase  56.54 
 
 		 964 aa  1012    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.872567 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3622  glycine dehydrogenase  58.52 
 
 		 943 aa  1041    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.290063  normal  0.0837915 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3021  glycine dehydrogenase  54.7 
 
 		 967 aa  960    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2476  glycine dehydrogenase  50.72 
 
 		 964 aa  938    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1568  glycine dehydrogenase  56.07 
 
 		 957 aa  1003    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.34808  decreased coverage  0.000847802 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1866  glycine dehydrogenase  52.01 
 
 		 1014 aa  925    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.276293  normal  0.279729 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0054  glycine dehydrogenase  57.24 
 
 		 978 aa  1004    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0835  glycine dehydrogenase  51.49 
 
 		 984 aa  929    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1731  glycine dehydrogenase  56.86 
 
 		 964 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0573168  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1811  glycine dehydrogenase  54.21 
 
 		 966 aa  986    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1618  glycine dehydrogenase  57.05 
 
 		 958 aa  1014    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89287  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0803  glycine dehydrogenase  50.72 
 
 		 965 aa  926    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.231271  normal  0.787561 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3482  glycine dehydrogenase  57.35 
 
 		 974 aa  1025    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18581  glycine dehydrogenase  45.01 
 
 		 969 aa  841    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1907  glycine dehydrogenase  55.89 
 
 		 954 aa  985    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0543112  normal  0.0739676 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2391  glycine dehydrogenase  56.13 
 
 		 949 aa  1019    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.572716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2911  glycine dehydrogenase  57.83 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2840  glycine dehydrogenase  61.09 
 
 		 948 aa  1085    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.228182  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18771  glycine dehydrogenase  45.12 
 
 		 969 aa  846    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3590  glycine dehydrogenase  50.67 
 
 		 969 aa  937    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.194839  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4266  glycine dehydrogenase  56.3 
 
 		 948 aa  977    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1016  glycine dehydrogenase  55.85 
 
 		 931 aa  955    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.539907  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1021  glycine dehydrogenase  52.31 
 
 		 966 aa  979    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5031  glycine dehydrogenase  51.96 
 
 		 974 aa  968    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3329  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 962 aa  907    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0624  glycine dehydrogenase  50.1 
 
 		 962 aa  904    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.893513  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3058  glycine dehydrogenase  57.64 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.451786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3149  glycine dehydrogenase  49.19 
 
 		 962 aa  886    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.333278  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28901  glycine dehydrogenase  53.21 
 
 		 982 aa  934    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.624172 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3322  glycine dehydrogenase  53.2 
 
 		 957 aa  957    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0131  glycine dehydrogenase  57.74 
 
 		 975 aa  998    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33000  glycine dehydrogenase  57.25 
 
 		 959 aa  978    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00002452 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68850  glycine dehydrogenase  55.02 
 
 		 958 aa  954    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0764  glycine dehydrogenase  65.57 
 
 		 950 aa  1203    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0144  glycine dehydrogenase  57.83 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1544  glycine dehydrogenase  57.64 
 
 		 975 aa  1001    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3499  glycine dehydrogenase  50.31 
 
 		 962 aa  907    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1222  glycine dehydrogenase  61.3 
 
 		 964 aa  1075    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.117905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3959  glycine dehydrogenase  55.68 
 
 		 970 aa  962    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0444417 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18581  glycine dehydrogenase  45.03 
 
 		 969 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2346  glycine dehydrogenase  56.58 
 
 		 942 aa  981    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2709  glycine dehydrogenase  61.51 
 
 		 971 aa  1059    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.142199  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2719  glycine dehydrogenase  51.9 
 
 		 962 aa  920    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.740696  normal  0.477847 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2884  glycine dehydrogenase  61.09 
 
 		 948 aa  1085    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.198061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2729  glycine dehydrogenase  51.33 
 
 		 966 aa  982    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0797455 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3131  glycine dehydrogenase  60.85 
 
 		 950 aa  1108    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0707314  normal  0.211977 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3147  glycine dehydrogenase  55.15 
 
 		 988 aa  969    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.661802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2685  glycine dehydrogenase  55.34 
 
 		 964 aa  968    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.941593 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>