13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00320 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00320  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  295  2e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.520743 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2581  hypothetical protein  38.2 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.423852 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1672  hypothetical protein  34.57 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0086  putative permease  33.33 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.117541  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0660  putative permease  31.58 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2097  hypothetical protein  31.76 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3620  hypothetical protein  37.66 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0431  hypothetical protein  35.82 
 
 		 155 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.897698 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4213  hypothetical protein  39.06 
 
 		 85 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0109856 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0712  putative permease  35.38 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00251572  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0111  hypothetical protein  34.33 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1325  putative permease  33.75 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06300  hypothetical protein  29.41 
 
 		 89 aa  40.8  0.007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>