More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  100 
 
 		 517 aa  1013    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.545954  normal  0.347866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0173  cell cycle protein  56.57 
 
 		 563 aa  542  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.821251 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0028  cell cycle protein  56.07 
 
 		 533 aa  538  1e-151  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0021  cell cycle protein  56.24 
 
 		 496 aa  490  1e-137  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0029  cell cycle protein  62.15 
 
 		 494 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0025  cell cycle protein  52.53 
 
 		 468 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0023  cell cycle protein  52.56 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00210  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  55.29 
 
 		 463 aa  452  1.0000000000000001e-126  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0052  cell cycle protein  52.17 
 
 		 460 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  decreased coverage  0.00121731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0074  cell cycle protein  57.78 
 
 		 457 aa  451  1e-125  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.206263  normal  0.526199 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0023  cell cycle protein  54.65 
 
 		 462 aa  446  1.0000000000000001e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000166651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0114  cell division protein FtsW  50.75 
 
 		 459 aa  424  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.469585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4433  cell cycle protein  51.47 
 
 		 498 aa  421  1e-116  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26960  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  53.39 
 
 		 463 aa  413  1e-114  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.538184  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0137  cell cycle protein  51.46 
 
 		 493 aa  414  1e-114  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882839  decreased coverage  0.000566285 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5249  cell cycle protein  48.03 
 
 		 469 aa  409  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.168107 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00780  cell division protein RodA  55.41 
 
 		 474 aa  405  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0021  cell cycle protein  52.78 
 
 		 459 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0045  cell cycle protein  48.24 
 
 		 496 aa  390  1e-107  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0080  cell cycle protein  49.69 
 
 		 487 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0066  cell cycle protein  45.28 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0038  cell cycle protein  52.19 
 
 		 473 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0050  cell cycle protein  47.11 
 
 		 496 aa  384  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0028  cell cycle protein  47.7 
 
 		 476 aa  379  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1380  cell division membrane protein  43.54 
 
 		 519 aa  377  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0026  cell cycle protein  48.39 
 
 		 470 aa  377  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10017  cell division protein rodA  48.1 
 
 		 469 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.222067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00390  cell elongation-specific peptidoglycan biosynthesis regulator RodA  46.12 
 
 		 543 aa  371  1e-101  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.476273 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0018  cell cycle protein  49.76 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0036  cell cycle protein  41.52 
 
 		 659 aa  371  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0033  cell cycle protein, FtsW/RodA/SpoVE family  41.21 
 
 		 493 aa  369  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0026  cell cycle protein  49.76 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.462099  hitchhiker  0.00956397 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0018  cell cycle protein  49.76 
 
 		 470 aa  370  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0785065  normal  0.605241 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6474  cell cycle protein  44.02 
 
 		 529 aa  362  1e-98  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0132298 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0809  cell cycle protein  51.52 
 
 		 470 aa  356  3.9999999999999996e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0024  cell cycle protein  47.26 
 
 		 487 aa  340  2.9999999999999998e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0545169  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0030  cell cycle protein  45.91 
 
 		 475 aa  334  2e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.36129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3063  FtsW/RodA/SpoVE family cell cycle protein  44.81 
 
 		 480 aa  306  5.0000000000000004e-82  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.00913088  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0023  cell cycle protein  39.86 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0015  cell cycle protein  42.25 
 
 		 435 aa  286  5e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  41.58 
 
 		 924 aa  282  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0427  cell division membrane protein  38.38 
 
 		 481 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  41.22 
 
 		 933 aa  269  1e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2306  cell cycle protein  36.94 
 
 		 426 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.186468  hitchhiker  0.000727648 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  41.58 
 
 		 921 aa  267  2.9999999999999995e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.73 
 
 		 954 aa  260  3e-68  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1712  cell cycle protein  37.84 
 
 		 441 aa  251  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0044  cell cycle protein  35.71 
 
 		 472 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3844  cell cycle protein  37.69 
 
 		 443 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.090229  hitchhiker  0.000109873 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1003  cell cycle protein  42.48 
 
 		 444 aa  232  1e-59  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1306  cell cycle protein  36.29 
 
 		 472 aa  231  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0578  cell cycle protein  39.25 
 
 		 443 aa  229  1e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.212162 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3046  cell cycle protein  35.97 
 
 		 422 aa  228  3e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000270462  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1647  cell cycle protein  39.51 
 
 		 480 aa  226  7e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.393395  hitchhiker  0.00916142 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1377  cell cycle protein  38.24 
 
 		 439 aa  223  7e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0331  cell cycle protein FtsW  35.58 
 
 		 409 aa  219  1e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1449  cell cycle protein  36.43 
 
 		 463 aa  219  1e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.769758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0339  cell cycle protein FtsW  35.58 
 
 		 409 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1055  cell cycle protein  32.9 
 
 		 414 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000372052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0910  cell cycle protein  34.59 
 
 		 405 aa  211  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.32654  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2477  cell cycle protein  34.93 
 
 		 399 aa  199  7.999999999999999e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3846  cell cycle protein  32.55 
 
 		 428 aa  196  6e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.57616  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0875  cell cycle protein  31.35 
 
 		 422 aa  189  1e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1437  stage V sporulation protein E  31.66 
 
 		 367 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0507  cell division protein FtsW  29.92 
 
 		 368 aa  164  3e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0490  cell division protein FtsW  29.13 
 
 		 368 aa  160  4e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.846166  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09080  stage V sporulation protein E  29.44 
 
 		 365 aa  160  4e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.861786  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1020  stage V sporulation protein E  35.01 
 
 		 366 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3257  cell division protein FtsW  32.61 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.19497  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3319  cell division protein FtsW  32.61 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.40135  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3268  cell division protein FtsW  32.61 
 
 		 511 aa  157  3e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162204  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2538  cell division protein ftsW  32.76 
 
 		 391 aa  156  9e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3332  rod shape-determining protein RodA  30.06 
 
 		 380 aa  156  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00191901  normal  0.82399 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3785  cell division protein FtsW  32.88 
 
 		 423 aa  156  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1054  cell division protein FtsW  32.35 
 
 		 371 aa  156  1e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2668  cell division protein ftsW  32.35 
 
 		 391 aa  155  1e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  34.89 
 
 		 972 aa  155  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0674  stage V sporulation protein E  31.3 
 
 		 367 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3738  stage V sporulation protein E  33.33 
 
 		 363 aa  154  4e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.29605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1892  stage V sporulation protein E  35.28 
 
 		 366 aa  153  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0484  cell cycle protein  32.85 
 
 		 509 aa  152  1e-35  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3957  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.392233  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4012  stage V sporulation protein E  32.55 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000045407  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3964  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00261778  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3762  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3653  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3670  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4050  stage V sporulation protein E  32.81 
 
 		 363 aa  151  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2561  stage V sporulation protein E  34.57 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.119412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1229  stage V sporulation protein E  32.02 
 
 		 363 aa  150  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000285067  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3926  stage V sporulation protein E  32.55 
 
 		 363 aa  150  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000164467 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3290  cell division protein FtsW  30.03 
 
 		 374 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3771  cell division protein FtsW  27.49 
 
 		 432 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.351351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3925  cell division protein FtsW  30.77 
 
 		 543 aa  145  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0424202  normal  0.252874 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0411  cell cycle protein  29.53 
 
 		 375 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3524  cell division protein FtsW  31.31 
 
 		 501 aa  145  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.336809  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1096  cell division protein FtsW  32.17 
 
 		 420 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0842  cell cycle protein  33.42 
 
 		 364 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0703  cell cycle protein FtsW  28.64 
 
 		 407 aa  144  5e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03259  cell division protein FtsW  29.39 
 
 		 470 aa  144  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>