More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00200 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00200  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  100 
 
 		 489 aa  984    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.765368  normal  0.710729 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0172  Peptidoglycan glycosyltransferase  64.21 
 
 		 483 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.81873 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0028  Peptidoglycan glycosyltransferase  56.16 
 
 		 493 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.790877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0020  Peptidoglycan glycosyltransferase  55.76 
 
 		 489 aa  534  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0027  Peptidoglycan glycosyltransferase  57.79 
 
 		 483 aa  524  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0020  peptidoglycan glycosyltransferase  53.28 
 
 		 485 aa  488  1e-137  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26970  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  51.02 
 
 		 481 aa  481  1e-134  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0136  peptidoglycan glycosyltransferase  53.58 
 
 		 482 aa  477  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00209785 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0073  Peptidoglycan glycosyltransferase  51.53 
 
 		 485 aa  468  9.999999999999999e-131  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.133397  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4434  peptidoglycan glycosyltransferase  51.22 
 
 		 480 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.367833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  49.7 
 
 		 480 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00200  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  49.7 
 
 		 490 aa  427  1e-118  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0113  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.75 
 
 		 485 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0705115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  46.89 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.768484  normal  0.198111 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0053  peptidoglycan glycosyltransferase  48.28 
 
 		 485 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.00491745  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0017  peptidoglycan glycosyltransferase  46.89 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0025  peptidoglycan glycosyltransferase  46.89 
 
 		 491 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00487065 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0810  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.89 
 
 		 491 aa  402  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.647945 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0025  penicillin-binding protein, transpeptidase  46.29 
 
 		 491 aa  401  9.999999999999999e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874043 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  43.32 
 
 		 486 aa  386  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7946  Peptidoglycan glycosyltransferase  47.46 
 
 		 487 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10016  penicillin-binding protein pbpA  46.6 
 
 		 491 aa  384  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5248  Peptidoglycan glycosyltransferase  45.78 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.103074 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3064  peptidoglycan glycosyltransferase  47.38 
 
 		 482 aa  376  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.300447  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00380  cell elongation-specific peptidoglycan D,D-transpeptidase  44.58 
 
 		 489 aa  378  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.465269 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0079  Peptidoglycan glycosyltransferase  44.91 
 
 		 493 aa  373  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1381  cell division protein  43.8 
 
 		 488 aa  369  1e-101  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0029  penicillin-binding protein transpeptidase  44.01 
 
 		 504 aa  371  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.851817  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0022  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.14 
 
 		 486 aa  358  8e-98  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000781199 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0024  peptidoglycan glycosyltransferase  42.25 
 
 		 490 aa  358  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.805359  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0023  Peptidoglycan glycosyltransferase  42.8 
 
 		 488 aa  356  5e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0951925  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00770  cell division protein FtsI/penicillin-binding protein 2  42.77 
 
 		 481 aa  351  2e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0027  penicillin-binding protein transpeptidase  42.18 
 
 		 495 aa  345  8e-94  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.474914  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0046  peptidoglycan glycosyltransferase  41.4 
 
 		 501 aa  339  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.56645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0051  peptidoglycan glycosyltransferase  42.18 
 
 		 503 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.948858  normal  0.601931 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0032  penicillin-binding protein, transpeptidase domain protein  42 
 
 		 488 aa  329  5.0000000000000004e-89  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0022  peptidoglycan glycosyltransferase  40.64 
 
 		 504 aa  313  4.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6473  penicillin-binding protein transpeptidase  38.4 
 
 		 492 aa  295  1e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0122538 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0037  Peptidoglycan glycosyltransferase  40.2 
 
 		 490 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1056  peptidoglycan glycosyltransferase  38.49 
 
 		 473 aa  290  4e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000594466  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0089  penicillin-binding protein transpeptidase  41.19 
 
 		 493 aa  290  4e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2305  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.61 
 
 		 458 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.117419  hitchhiker  0.000826968 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0911  peptidoglycan glycosyltransferase  37.98 
 
 		 461 aa  271  2.9999999999999997e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.271036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0065  penicillin-binding protein transpeptidase  37.82 
 
 		 489 aa  268  2e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0016  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.47 
 
 		 478 aa  267  4e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27060  cell division membrane protein  38.33 
 
 		 933 aa  266  5e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.358527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3047  peptidoglycan glycosyltransferase  35.71 
 
 		 470 aa  260  4e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000101617  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3042  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.42 
 
 		 924 aa  259  6e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2616  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.14 
 
 		 573 aa  251  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1713  penicillin-binding protein, transpeptidase  34.41 
 
 		 476 aa  250  3e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03310  cell division membrane protein  35.43 
 
 		 921 aa  250  4e-65  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2476  penicillin-binding protein transpeptidase  33.81 
 
 		 471 aa  249  8e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1337  penicillin-binding protein transpeptidase  33.33 
 
 		 972 aa  248  2e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000416244  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3814  penicillin-binding protein transpeptidase  36.66 
 
 		 579 aa  244  1.9999999999999999e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0233122  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0876  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.61 
 
 		 503 aa  243  6e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0332  penicillin binding protein transpeptidase domain-containing protein  34.19 
 
 		 487 aa  239  8e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0340  putative penicillin-binding protein  34.19 
 
 		 487 aa  239  9e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3845  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.93 
 
 		 472 aa  233  5e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1376  Peptidoglycan glycosyltransferase  33.33 
 
 		 547 aa  232  9e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1344  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.03 
 
 		 954 aa  231  2e-59  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.0271008 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3956  peptidoglycan glycosyltransferase  35.33 
 
 		 570 aa  228  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.591181  normal  0.218815 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1118  peptidoglycan glycosyltransferase  34.5 
 
 		 584 aa  216  5e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1401  penicillin-binding protein 2  33.75 
 
 		 574 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00257822  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1805  penicillin-binding protein 2  34.22 
 
 		 610 aa  203  5e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3840  peptidoglycan glycosyltransferase  36.16 
 
 		 577 aa  200  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.527285  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0709  penicillin-binding protein 2  35.41 
 
 		 640 aa  196  6e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0579  peptidoglycan glycosyltransferase  35.65 
 
 		 578 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0103  penicillin-binding protein 2  36.46 
 
 		 611 aa  194  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2771  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.18 
 
 		 672 aa  194  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.47482  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0531  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 		 646 aa  193  5e-48  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0437698  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1304  penicillin-binding protein 2  31.79 
 
 		 701 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000662569  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2460  penicillin-binding protein 2  32.85 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1757  penicillin-binding protein 2  32.93 
 
 		 647 aa  186  7e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.777001 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0595  peptidoglycan glycosyltransferase  33.86 
 
 		 634 aa  183  6e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000785776  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1164  penicillin-binding protein 2  33.7 
 
 		 647 aa  182  1e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0800  peptidoglycan glycosyltransferase  35 
 
 		 678 aa  182  1e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0101369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2545  peptidoglycan glycosyltransferase  34.68 
 
 		 642 aa  182  1e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2079  penicillin-binding protein 2  33.33 
 
 		 639 aa  182  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0928  peptidoglycan glycosyltransferase  34.48 
 
 		 643 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0142765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0817  peptidoglycan glycosyltransferase  33.42 
 
 		 643 aa  179  1e-43  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.171924  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2565  penicillin-binding protein 2  35.25 
 
 		 602 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2195  penicillin-binding protein 2  35.25 
 
 		 602 aa  178  2e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139348 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3920  peptidoglycan glycosyltransferase  33.76 
 
 		 673 aa  177  3e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0864  penicillin-binding protein 2  33.58 
 
 		 641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3359  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 		 597 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.20797  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0630  penicillin-binding protein 2  34.78 
 
 		 615 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.629085  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1372  penicillin-binding protein 2  34.06 
 
 		 596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0979  peptidoglycan glycosyltransferase  30.7 
 
 		 723 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0514  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.66 
 
 		 822 aa  175  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2492  penicillin-binding protein 2  33.71 
 
 		 640 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.86643  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2589  peptidoglycan glycosyltransferase  33.85 
 
 		 646 aa  174  3.9999999999999995e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.916091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1415  peptidoglycan glycosyltransferase  31.37 
 
 		 609 aa  174  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.55122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09030  stage V sporulation protein D  29.84 
 
 		 695 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1207  penicillin-binding protein 2  33.06 
 
 		 586 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0378  penicillin-binding protein 2  30.39 
 
 		 586 aa  173  6.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2858  peptidoglycan glycosyltransferase  31.71 
 
 		 636 aa  173  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0571  peptidoglycan glycosyltransferase  33.7 
 
 		 634 aa  171  2e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.784328  normal  0.541139 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1745  peptidoglycan glycosyltransferase  34.21 
 
 		 662 aa  171  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.371842  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0614  penicillin-binding protein 2  33.77 
 
 		 629 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3341  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase / peptidoglycan glycosyltransferase  34.24 
 
 		 619 aa  171  3e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.198786  normal  0.0253146 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>