28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_4002 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_4002  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  313  7e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.224302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3910  hypothetical protein  98.71 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.518185  normal  0.249624 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4115  hypothetical protein  98.71 
 
 		 155 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4729  hypothetical protein  90.97 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3912  hypothetical protein  89.03 
 
 		 155 aa  249  7e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4295  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.617343  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4492  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.158195 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4350  hypothetical protein  81.94 
 
 		 155 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.488502  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0048  hypothetical protein  81.29 
 
 		 155 aa  220  4.9999999999999996e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.125105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3948  hypothetical protein  56.77 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0088  hypothetical protein  60.65 
 
 		 155 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000738017  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0054  hypothetical protein  53.69 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.806166  normal  0.044221 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0097  hypothetical protein  50.32 
 
 		 155 aa  156  9e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3625  hypothetical protein  59.06 
 
 		 155 aa  154  5.0000000000000005e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.638211  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0091  hypothetical protein  54.36 
 
 		 159 aa  150  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.156914  hitchhiker  0.000348756 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3719  hypothetical protein  53.91 
 
 		 155 aa  117  6e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.144984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0232  hypothetical protein  35.14 
 
 		 163 aa  91.7  4e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.203963  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001912  hypothetical protein  32.89 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0471  hypothetical protein  37.88 
 
 		 147 aa  77.4  0.00000000000007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.503615  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00011  hypothetical protein  34.93 
 
 		 155 aa  75.9  0.0000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2403  hypothetical protein  31.91 
 
 		 163 aa  74.7  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4824  hypothetical protein  32.64 
 
 		 162 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00580  hypothetical protein  32.09 
 
 		 162 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0208  hypothetical protein  30.97 
 
 		 159 aa  67.8  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.294068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0011  hypothetical protein  29.73 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1796  hypothetical protein  32.3 
 
 		 153 aa  54.3  0.0000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44789  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19350  hypothetical protein  30.09 
 
 		 151 aa  47  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.545788  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1615  hypothetical protein  30.5 
 
 		 157 aa  45.8  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.132758  normal  0.639267 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>