More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3960 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  90.35 
 
 		 749 aa  701    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  90.54 
 
 		 737 aa  698    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  90.08 
 
 		 767 aa  701    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  90.54 
 
 		 707 aa  696    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  98.92 
 
 		 729 aa  749    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  100 
 
 		 741 aa  1499    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  70.44 
 
 		 677 aa  531  1e-149  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3676  TonB-dependent receptor, plug  64.2 
 
 		 735 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0094  TonB-dependent receptor  56.37 
 
 		 649 aa  426  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4088  TonB-dependent receptor  55.92 
 
 		 650 aa  424  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  58.09 
 
 		 695 aa  415  1e-114  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1541  TonB-dependent receptor  40.24 
 
 		 665 aa  231  5e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000885863  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2397  TonB-dependent receptor  36.8 
 
 		 651 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.84598e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1473  TonB-dependent receptor  30.29 
 
 		 669 aa  177  6e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220648 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3500  TonB-dependent receptor  33.44 
 
 		 699 aa  144  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3531  TonB-dependent receptor plug  30.91 
 
 		 678 aa  114  6e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0790413  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52120  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 668 aa  95.1  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.618776  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0195  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.13 
 
 		 653 aa  92.8  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  8.28696e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  32.51 
 
 		 659 aa  91.3  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1952  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 656 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.446334  normal  0.0364758 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2165  TonB-dependent vitamin B12 receptor  31.9 
 
 		 616 aa  89  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3220  TonB-dependent receptor  30.34 
 
 		 654 aa  88.6  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0252  TonB-dependent receptor  27.21 
 
 		 663 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.945527  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4645  TonB-dependent receptor  24.61 
 
 		 693 aa  87.4  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000318415 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1549  TonB-dependent receptor  26.55 
 
 		 656 aa  86.3  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.751142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0151  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  30.57 
 
 		 675 aa  85.5  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0609  TonB-dependent siderophore receptor  32.56 
 
 		 710 aa  84.7  0.000000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  34.93 
 
 		 631 aa  84.3  0.000000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1989  TonB-dependent receptor  29.24 
 
 		 675 aa  84  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000419445  normal  0.710455 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3699  TonB-dependent receptor  26.13 
 
 		 685 aa  83.6  0.00000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1271  TonB-dependent receptor plug  33.12 
 
 		 634 aa  83.2  0.00000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.732381  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5290  TonB-dependent receptor plug  33.52 
 
 		 673 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0444  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 667 aa  82.4  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4967  TonB-dependent receptor  39.22 
 
 		 698 aa  82  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0565  TonB-dependent receptor  29.45 
 
 		 613 aa  81.3  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.228454 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01534  ferrienterochelin/colicin outer membrane receptor  35.67 
 
 		 647 aa  81.3  0.00000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1524  TonB-dependent receptor plug  33 
 
 		 605 aa  81.3  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  31.91 
 
 		 646 aa  80.5  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  36.48 
 
 		 649 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1245  TonB-dependent receptor, plug  37.32 
 
 		 636 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0339996 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  26.93 
 
 		 640 aa  79.7  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2621  TonB-dependent receptor, plug  30.27 
 
 		 695 aa  79.3  0.0000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  32.47 
 
 		 682 aa  77.8  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3845  TonB-dependent receptor, plug  30.05 
 
 		 628 aa  77.8  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.529618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7217  TonB-dependent receptor  28.92 
 
 		 707 aa  77.8  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3206  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 		 617 aa  77.4  0.000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00965358  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0084  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 		 671 aa  77  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.380129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5341  TonB-dependent receptor  26.21 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0722  TonB-dependent siderophore receptor  30.3 
 
 		 675 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.534189 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1859  TonB-dependent receptor plug  28.94 
 
 		 686 aa  76.3  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000014407  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1171  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 697 aa  75.5  0.000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3735  TonB-dependent receptor plug  31.38 
 
 		 628 aa  75.9  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000331916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  32.67 
 
 		 614 aa  75.1  0.000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4787  TonB-dependent siderophore receptor  30.88 
 
 		 696 aa  75.1  0.000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3399  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 727 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.186836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  31.1 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.57 
 
 		 631 aa  73.9  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0630  TonB-dependent receptor  27.78 
 
 		 727 aa  73.9  0.000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0349605  normal  0.294722 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  25.85 
 
 		 618 aa  73.9  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1368  TonB-dependent receptor  31.14 
 
 		 627 aa  73.6  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.249969  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3559  TonB-dependent receptor  30.08 
 
 		 665 aa  73.6  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00145171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  21.52 
 
 		 613 aa  73.6  0.00000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  32.16 
 
 		 634 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  34.9 
 
 		 597 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0653  TonB-dependent receptor  32.77 
 
 		 675 aa  72.8  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.39 
 
 		 631 aa  72.8  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0049  TonB-dependent siderophore receptor  29.94 
 
 		 703 aa  72.8  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.627674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4681  TonB-dependent receptor  32.11 
 
 		 704 aa  72.8  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0656736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1004  TonB-dependent receptor  25.55 
 
 		 618 aa  72.8  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0684927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1559  TonB-dependent receptor plug  32.86 
 
 		 706 aa  72.8  0.00000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000264695  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  33.13 
 
 		 661 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2219  TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 692 aa  72  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0963  TonB-dependent receptor  28.9 
 
 		 614 aa  72  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  38.68 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  38.68 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  38.68 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  38.68 
 
 		 641 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  38.68 
 
 		 659 aa  71.6  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  38.68 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 		 710 aa  71.2  0.00000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  38.68 
 
 		 663 aa  71.6  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  38.68 
 
 		 663 aa  71.2  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5807  ferric citrate outer membrane transporter  32.78 
 
 		 717 aa  70.9  0.00000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0132  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.58 
 
 		 631 aa  70.9  0.00000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00107286  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  24.78 
 
 		 661 aa  70.9  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  37.74 
 
 		 650 aa  70.9  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  38.66 
 
 		 627 aa  70.5  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  29.01 
 
 		 739 aa  70.5  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 626 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  34 
 
 		 626 aa  70.5  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01932  TonB-dependent outer membrane Receptor  28.07 
 
 		 713 aa  70.5  0.0000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6723  TonB-dependent receptor  31.07 
 
 		 1128 aa  70.5  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  28.91 
 
 		 701 aa  70.1  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.42 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  26.42 
 
 		 630 aa  69.7  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1481  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 		 674 aa  69.7  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0173398  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>