128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3860 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  96.38 
 
 		 414 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  93.78 
 
 		 418 aa  786    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  79.62 
 
 		 417 aa  678    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  99.76 
 
 		 418 aa  832    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 418 aa  833    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  81.58 
 
 		 418 aa  681    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  99.28 
 
 		 418 aa  829    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  93.78 
 
 		 418 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  79.38 
 
 		 418 aa  655    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  90.43 
 
 		 418 aa  765    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  93.78 
 
 		 418 aa  786    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  79.38 
 
 		 418 aa  656    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  78.42 
 
 		 418 aa  647    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  94.02 
 
 		 418 aa  788    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  78.9 
 
 		 418 aa  673    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  77.27 
 
 		 418 aa  628  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  59.62 
 
 		 417 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  60.84 
 
 		 467 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  55.26 
 
 		 425 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  57.88 
 
 		 414 aa  441  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  57.62 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  58.14 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  54.7 
 
 		 414 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  52.88 
 
 		 414 aa  441  9.999999999999999e-123  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  57.62 
 
 		 414 aa  439  9.999999999999999e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  57.62 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  52.64 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  438  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  57.36 
 
 		 414 aa  436  1e-121  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  57.11 
 
 		 414 aa  433  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  52.64 
 
 		 412 aa  434  1e-120  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  53.72 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  53.41 
 
 		 424 aa  429  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  51.59 
 
 		 416 aa  408  1.0000000000000001e-112  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  50.73 
 
 		 419 aa  396  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  45.91 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  45.91 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  45.91 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  45.91 
 
 		 415 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  45.67 
 
 		 415 aa  365  1e-99  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  45.91 
 
 		 415 aa  364  1e-99  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  45.67 
 
 		 415 aa  364  2e-99  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  45.67 
 
 		 413 aa  358  8e-98  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  45.77 
 
 		 409 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  45.19 
 
 		 409 aa  316  4e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  45.19 
 
 		 411 aa  299  7e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  37 
 
 		 403 aa  246  4e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  37.81 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  34.14 
 
 		 400 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  37 
 
 		 403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  37 
 
 		 403 aa  243  3e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  36.99 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  36.73 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  36.48 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  36.73 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  36.73 
 
 		 422 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  37.31 
 
 		 402 aa  237  3e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  37.69 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  37.69 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  37.69 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  35.79 
 
 		 395 aa  229  6e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 		 395 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  34.59 
 
 		 395 aa  228  2e-58  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  36.04 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  35.28 
 
 		 395 aa  226  6e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  35.53 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  34.34 
 
 		 395 aa  226  7e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  35.84 
 
 		 400 aa  225  1e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  34.16 
 
 		 395 aa  224  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  37.75 
 
 		 402 aa  224  3e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  33.81 
 
 		 400 aa  223  6e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  35.16 
 
 		 400 aa  219  8.999999999999998e-56  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  35.82 
 
 		 425 aa  216  7e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  36.72 
 
 		 388 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  34.22 
 
 		 400 aa  208  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  32.83 
 
 		 395 aa  208  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  33.69 
 
 		 399 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  31.71 
 
 		 380 aa  199  7e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  31.81 
 
 		 391 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  34.16 
 
 		 403 aa  194  3e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  31.89 
 
 		 392 aa  193  5e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  33.33 
 
 		 361 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  31.04 
 
 		 390 aa  189  7e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  32.9 
 
 		 391 aa  189  9e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  32.64 
 
 		 391 aa  187  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  34.4 
 
 		 395 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>