125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3819 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3819  methyltransferase type 11  100 
 
 
212 aa  444  1e-124  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3746  methyltransferase type 12  97.64 
 
 
212 aa  417  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3944  methyltransferase type 11  94.34 
 
 
212 aa  407  1e-113  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4550  methyltransferase domain-containing protein  90.09 
 
 
212 aa  406  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0201  Methyltransferase type 11  76.67 
 
 
216 aa  349  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.63845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4134  methyltransferase type 12  75 
 
 
213 aa  347  6e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4267  methyltransferase type 11  76.19 
 
 
223 aa  347  8e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.14672 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0329  methyltransferase type 11  74.76 
 
 
212 aa  342  3e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0201  methyltransferase type 11  74.29 
 
 
217 aa  339  2e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3951  methyltransferase type 11  55.92 
 
 
211 aa  262  3e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0259  methyltransferase type 12  57.14 
 
 
211 aa  261  4e-69  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.562572 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0301  methyltransferase type 11  60.19 
 
 
214 aa  259  3e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3583  methyltransferase type 12  55.45 
 
 
211 aa  256  2e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0258  methyltransferase type 12  50.48 
 
 
211 aa  232  2e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0504926 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3445  methyltransferase domain-containing protein  57.14 
 
 
213 aa  231  5e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2134  methyltransferase type 11  49.05 
 
 
212 aa  209  4e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.453927 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2405  methyltransferase-related protein  49.06 
 
 
222 aa  206  1e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1601  thymidylate kinase  47.87 
 
 
215 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0530437  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001914  putative methyltransferase associated with DUF414  47.62 
 
 
212 aa  202  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00577  hypothetical protein  46.92 
 
 
212 aa  202  3e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0514  methyltransferase domain-containing protein  46.38 
 
 
225 aa  195  5e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0230  hypothetical protein  45.07 
 
 
214 aa  192  4e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.818653  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00013  methyltransferase-related protein  46.7 
 
 
233 aa  190  1e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1082  methyltransferase type 12  46.19 
 
 
215 aa  186  2e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.578159  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2158  methyltransferase type 12  41.83 
 
 
223 aa  182  2e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1150  methyltransferase type 12  42.51 
 
 
222 aa  182  3e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2554  methyltransferase type 12  44.71 
 
 
215 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.239321  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0643  methyltransferase type 12  40.19 
 
 
257 aa  172  3e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0899  Methyltransferase type 11  38.21 
 
 
217 aa  166  3e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0420  methyltransferase type 12  37.56 
 
 
230 aa  161  7e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.662097  hitchhiker  0.00821739 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0965  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
217 aa  161  7e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00498957  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06720  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  36.41 
 
 
214 aa  143  2e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3908  hypothetical protein  33.02 
 
 
212 aa  130  1e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00391987  normal  0.262705 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4000  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  129  4e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4293  hypothetical protein  33.33 
 
 
212 aa  127  8e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00170008  unclonable  4.96851e-12 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4727  hypothetical protein  33.02 
 
 
212 aa  125  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3717  hypothetical protein  32.86 
 
 
222 aa  125  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00803491  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4113  hypothetical protein  32.08 
 
 
212 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.752026 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0090  hypothetical protein  30.66 
 
 
226 aa  125  6e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  8.69669e-05  normal  0.185327 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0093  hypothetical protein  33.33 
 
 
232 aa  123  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0397586  decreased coverage  8.60939e-06 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4348  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  2.31362e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3946  hypothetical protein  33.79 
 
 
220 aa  122  3e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4490  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  122  3e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393698 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0050  hypothetical protein  32.55 
 
 
212 aa  122  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00137393  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0056  hypothetical protein  32.7 
 
 
220 aa  121  6e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.425414  normal  0.0220256 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0109  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1,4- ben zoquinolmethylase  36.79 
 
 
214 aa  118  6e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3910  hypothetical protein  32.86 
 
 
212 aa  116  2e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0099  hypothetical protein  33.18 
 
 
222 aa  116  2e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3623  hypothetical protein  32.09 
 
 
223 aa  102  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0347369  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0892  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  29.76 
 
 
214 aa  101  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1348  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
286 aa  59.7  3e-08  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.71095  hitchhiker  0.00964289 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3803  Methyltransferase type 12  22.78 
 
 
300 aa  58.5  8e-08  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.157905  normal  0.599602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0456  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  22.62 
 
 
672 aa  55.5  5e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  24.42 
 
 
1177 aa  53.9  2e-06  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.97 
 
 
345 aa  53.1  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2682  Methyltransferase type 12  31.3 
 
 
358 aa  50.8  1e-05  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.454648  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  23.96 
 
 
1177 aa  51.6  1e-05  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4274  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
222 aa  51.2  1e-05  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.254306  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 
310 aa  48.1  8e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  30.95 
 
 
240 aa  48.1  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  8.58625e-10 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4080  methyltransferase type 12  21.43 
 
 
274 aa  47.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  25 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3351  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
324 aa  47  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  24.11 
 
 
306 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 
240 aa  46.2  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  28.95 
 
 
249 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0632  glycosyl transferase family protein  26.74 
 
 
1312 aa  45.4  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  27.33 
 
 
440 aa  45.4  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3550  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.5 
 
 
248 aa  45.4  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1803  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0795517  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1872  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.67 
 
 
248 aa  45.1  0.0008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.466783  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0420  Methyltransferase type 11  28.67 
 
 
335 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0734  hypothetical protein  28.06 
 
 
330 aa  44.3  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.69115  normal  0.886501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2164  methyltransferase type 11  25.67 
 
 
346 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3503  SAM-dependent methyltransferase  23.21 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0311533  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  22.36 
 
 
303 aa  44.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0237  Methyltransferase type 11  30.69 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2154  methyltransferase type 11  20.72 
 
 
291 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1306  hypothetical protein  26.67 
 
 
297 aa  44.7  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.782095 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1111  Methyltransferase type 12  26.98 
 
 
310 aa  44.3  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.100428  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0398  histidine triad (HIT) protein  29.59 
 
 
284 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.315945 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.33 
 
 
242 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4934  Methyltransferase type 11  22.92 
 
 
332 aa  43.9  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.310878 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2841  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3232  hypothetical protein  34.51 
 
 
323 aa  43.5  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.470904  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0252  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase-like  27.41 
 
 
273 aa  43.9  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.859955  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7539  hypothetical protein  25.41 
 
 
258 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2892  hypothetical protein  27.19 
 
 
621 aa  43.1  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6261  Methyltransferase type 12  27.14 
 
 
298 aa  43.1  0.003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.265147 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4502  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.09 
 
 
244 aa  42.7  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.166087 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.14 
 
 
242 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1298  Methyltransferase type 11  30.34 
 
 
210 aa  42.7  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.356445  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  26.81 
 
 
194 aa  42.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3735  Methyltransferase type 12  22.27 
 
 
334 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0126  Methyltransferase type 12  24.5 
 
 
415 aa  42.4  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  22.73 
 
 
305 aa  42.4  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>