49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3780 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3780  peptidase  100 
 
 
88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0241  peptidase  100 
 
 
88 aa  178  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000271334 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0242  peptidase  98.86 
 
 
88 aa  177  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000136946 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4486  hypothetical protein  96.59 
 
 
88 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0240  peptidase  95.45 
 
 
88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0243  peptidase  95.45 
 
 
88 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0246  Propeptide PepSY amd peptidase M4  94.32 
 
 
88 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000325989 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0240  peptidase  94.32 
 
 
88 aa  170  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0358  peptidase  89.77 
 
 
88 aa  159  1e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  35.63 
 
 
103 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  36.9 
 
 
105 aa  61.2  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1353  peptidase  36.59 
 
 
114 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.160523  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  38.16 
 
 
109 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.187965 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3773  peptidase  41.79 
 
 
103 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.568838  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.73 
 
 
105 aa  53.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  35.82 
 
 
101 aa  51.6  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  37.84 
 
 
104 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  33.85 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1946  peptidase  37.33 
 
 
104 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00953564 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  37.35 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3764  membrane protein  37.31 
 
 
96 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.915458  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  37.35 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3155  hypothetical protein  42.62 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0526297 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3510  hypothetical protein  42.62 
 
 
117 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.211688  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3061  peptidase  32.91 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4806  hypothetical protein  29.73 
 
 
201 aa  47.8  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.325935  normal  0.738091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3382  lipoprotein, putative  33.73 
 
 
101 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0486545  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5574  hypothetical protein  30.99 
 
 
101 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.185184  normal  0.0946557 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3213  peptidase  36.59 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.328849 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3186  hypothetical protein  28.36 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47230  hypothetical protein  26.67 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  29.11 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  33.33 
 
 
102 aa  45.4  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  30.3 
 
 
109 aa  44.7  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  24.69 
 
 
120 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  30.99 
 
 
112 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1994  peptidase  31.82 
 
 
104 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.914593  normal  0.197441 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4933  peptidase  30 
 
 
121 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.180431 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02657  hypothetical protein  35.06 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2542  hypothetical protein  35.23 
 
 
100 aa  42  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.173105  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.87 
 
 
106 aa  42  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0629  hypothetical protein  35 
 
 
113 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000224973  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6195  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.1 
 
 
103 aa  41.2  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0165  hypothetical protein  28.57 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29720  hypothetical protein  36.05 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  27.69 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4695  peptidase  26.15 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003783  membrane protein  34.21 
 
 
141 aa  40.8  0.007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000349662  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5305  Propeptide PepSY amd peptidase M4  29.23 
 
 
112 aa  40.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>