More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3679 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  71.15 
 
 		 454 aa  684    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  96.92 
 
 		 454 aa  901    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  91.41 
 
 		 454 aa  857    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  91.41 
 
 		 454 aa  857    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  69.16 
 
 		 453 aa  648    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  92.51 
 
 		 454 aa  865    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  91.41 
 
 		 454 aa  858    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  91.41 
 
 		 454 aa  855    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  68.94 
 
 		 459 aa  655    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  927    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  100 
 
 		 454 aa  927    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  67.47 
 
 		 455 aa  646    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  99.34 
 
 		 454 aa  923    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  71.15 
 
 		 454 aa  685    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  68.57 
 
 		 459 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  38.63 
 
 		 466 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  39.81 
 
 		 557 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 557 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  38.32 
 
 		 557 aa  273  6e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  38.21 
 
 		 562 aa  271  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  39.28 
 
 		 568 aa  267  2e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  36.15 
 
 		 563 aa  263  6e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 559 aa  262  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  38.02 
 
 		 457 aa  261  2e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  40 
 
 		 551 aa  260  4e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  41.54 
 
 		 524 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  36.44 
 
 		 615 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  39.02 
 
 		 563 aa  251  2e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  38.92 
 
 		 563 aa  246  4e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  37.47 
 
 		 457 aa  246  4.9999999999999997e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  39.9 
 
 		 563 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  38.08 
 
 		 561 aa  229  7e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  33.48 
 
 		 451 aa  225  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  33.11 
 
 		 565 aa  213  5.999999999999999e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  34.06 
 
 		 453 aa  209  6e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  35.99 
 
 		 591 aa  199  9e-50  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  33.57 
 
 		 427 aa  169  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  29.35 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  29.23 
 
 		 518 aa  118  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  27.22 
 
 		 518 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  29.49 
 
 		 609 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  26.55 
 
 		 450 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  26.67 
 
 		 448 aa  100  5e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 570 aa  100  6e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  26.27 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  28.78 
 
 		 446 aa  99.8  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  28.07 
 
 		 590 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  28.07 
 
 		 590 aa  94.7  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  28.8 
 
 		 609 aa  94.4  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  30.1 
 
 		 466 aa  94  5e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.85 
 
 		 565 aa  94  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  28.3 
 
 		 584 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  29.5 
 
 		 443 aa  91.3  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.24 
 
 		 565 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  28.16 
 
 		 569 aa  89  2e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  30.51 
 
 		 580 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  30.74 
 
 		 393 aa  83.6  0.000000000000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  26.08 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  27.67 
 
 		 593 aa  81.6  0.00000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  26.86 
 
 		 453 aa  77.8  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4723  Acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.8 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  26.04 
 
 		 458 aa  72  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2704  AMP-dependent synthetase and ligase  24.52 
 
 		 466 aa  71.6  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.431608 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2687  putative long-chain-fatty-acid CoA ligase  23.61 
 
 		 503 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.714201 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2940  acyl-CoA synthetase  25.12 
 
 		 469 aa  68.2  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000118125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6754  AMP-dependent synthetase and ligase  23.53 
 
 		 517 aa  66.6  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4775  AMP-dependent synthetase and ligase  22.92 
 
 		 468 aa  66.2  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2789  AMP-dependent synthetase and ligase  27.78 
 
 		 384 aa  63.9  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4522  acyl-CoA synthetase  26.17 
 
 		 472 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.944611 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2003  acetate--CoA ligase  24.16 
 
 		 650 aa  62.4  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.807811  hitchhiker  0.00673553 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4402  coenzyme A ligase  26.74 
 
 		 517 aa  61.6  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4602  AMP-dependent synthetase and ligase  25.88 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.666881  normal  0.617182 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51430  coenzyme A ligase  25.46 
 
 		 517 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000261985 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3146  acyl-CoA synthetase  25.43 
 
 		 469 aa  60.1  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.22204  normal  0.0747213 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1847  amino acid adenylation  24.04 
 
 		 1070 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0718  cyclohexanecarboxylate-CoA ligase  23.18 
 
 		 547 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1273  AMP-dependent synthetase and ligase  22.45 
 
 		 472 aa  58.9  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2630  AMP-dependent synthetase and ligase  24.15 
 
 		 558 aa  58.9  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.589875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2175  acyl-CoA synthetase  24.04 
 
 		 472 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.114298  normal  0.0918111 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3671  4-coumarate--CoA ligase  23.05 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.180666  normal  0.0402717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21680  acyl-CoA synthetase  24.11 
 
 		 480 aa  58.2  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.656623 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1677  amino acid adenylation domain-containing protein  26.16 
 
 		 1058 aa  57.8  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4746  amino acid adenylation  23.83 
 
 		 983 aa  57.8  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3935  acetate--CoA ligase  23.89 
 
 		 650 aa  57.8  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.82655  normal  0.289959 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0103  4-coumarate--CoA ligase  28.19 
 
 		 367 aa  57.4  0.0000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3454  amino acid adenylation domain protein  24.59 
 
 		 1339 aa  57.4  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0624608  decreased coverage  0.0000000205264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  22.92 
 
 		 4332 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4204  AMP-dependent synthetase and ligase  24.31 
 
 		 541 aa  57.4  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1151  AMP-dependent synthetase and ligase  22.55 
 
 		 552 aa  57.4  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5196  acetyl-CoA synthetase  22.74 
 
 		 666 aa  57.4  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.988385  hitchhiker  0.000124684 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0951  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  24.24 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0932  D-alanine--poly(phosphoribitol) ligase subunit 1  24.24 
 
 		 485 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.210053  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5886  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 660 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2191  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 660 aa  57  0.0000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5151  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 664 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2216  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 660 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3351  AMP-dependent synthetase and ligase  24.87 
 
 		 472 aa  56.2  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.156488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3345  AMP-dependent synthetase and ligase  22.63 
 
 		 557 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5130  acetyl-CoA synthetase  21.82 
 
 		 664 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2364  AMP-dependent synthetase and ligase  24.92 
 
 		 497 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.472982  normal  0.0410842 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>