More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3664 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.15 
 
 
548 aa  746    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  65.63 
 
 
548 aa  745    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.45 
 
 
548 aa  744    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.45 
 
 
548 aa  744    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4843  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.81 
 
 
521 aa  670    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0345  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  81.92 
 
 
569 aa  943    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0918871  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4347  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  97.1 
 
 
552 aa  1074    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0482  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  66.3 
 
 
548 aa  717    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.267774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 
548 aa  749    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.45 
 
 
548 aa  746    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  744    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4128  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  95.28 
 
 
557 aa  1060    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.6 
 
 
548 aa  737    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  743    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4760  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  727    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4015  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.35 
 
 
548 aa  733    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00565502 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  65.63 
 
 
548 aa  745    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3934  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  95.28 
 
 
557 aa  1060    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  64.72 
 
 
548 aa  739    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.94 
 
 
557 aa  920    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0154  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  66.3 
 
 
548 aa  717    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3414  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  86.39 
 
 
557 aa  949    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0442  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  82.58 
 
 
562 aa  951    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.596547 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2488  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  62.71 
 
 
548 aa  696    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.818345  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4061  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  66.48 
 
 
548 aa  720    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.45 
 
 
548 aa  745    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00410  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  61.61 
 
 
548 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.32 
 
 
558 aa  638    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0362  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  98.73 
 
 
557 aa  1113    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3664  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  100 
 
 
551 aa  1132    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0422  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  84.5 
 
 
555 aa  951    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  742    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4165  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  83.48 
 
 
557 aa  959    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0356  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  99.09 
 
 
557 aa  1118    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.87 
 
 
548 aa  743    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  741    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3281  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  86.75 
 
 
556 aa  952    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0348  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  63.32 
 
 
548 aa  704    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.27 
 
 
548 aa  741    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4009  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  94.92 
 
 
557 aa  1058    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3614  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  94.56 
 
 
557 aa  1041    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  65.45 
 
 
548 aa  744    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4031  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  95.1 
 
 
557 aa  1058    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.4 
 
 
583 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1108  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  54.48 
 
 
583 aa  613  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02606  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  57.95 
 
 
573 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0289  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  55.27 
 
 
572 aa  609  1e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.403033  normal  0.363537 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  56.42 
 
 
578 aa  600  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2114  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  52.87 
 
 
565 aa  590  1e-167  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1714  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.2 
 
 
570 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1691  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.01 
 
 
570 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002041  acetolactate synthase large subunit  59.52 
 
 
421 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1707  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.28 
 
 
571 aa  518  1e-146  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1850  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.2 
 
 
570 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0722574  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1888  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.2 
 
 
570 aa  519  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1666  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.38 
 
 
570 aa  511  1e-144  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0284  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.73 
 
 
555 aa  512  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3491  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.57 
 
 
571 aa  512  1e-144  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1495  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.17 
 
 
566 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.433241 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0898  acetolactate synthase, large subunit  46.25 
 
 
564 aa  513  1e-144  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1851  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.57 
 
 
573 aa  512  1e-144  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.842705  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1934  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.21 
 
 
571 aa  511  1e-143  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46 
 
 
569 aa  509  1e-143  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.01 
 
 
556 aa  511  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.99 
 
 
566 aa  510  1e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1911  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.45 
 
 
566 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.500204  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4449  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.85 
 
 
570 aa  506  9.999999999999999e-143  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1966  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.97 
 
 
571 aa  507  9.999999999999999e-143  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.107455  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2258  acetolactate synthase, large subunit  46.92 
 
 
569 aa  506  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10830  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.74 
 
 
555 aa  507  9.999999999999999e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.07 
 
 
581 aa  505  9.999999999999999e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1260  acetolactate synthase, large subunit  45.28 
 
 
566 aa  504  1e-141  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00775476  hitchhiker  0.00000116322 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1141  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  45.65 
 
 
565 aa  503  1e-141  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.95 
 
 
554 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.74 
 
 
563 aa  505  1e-141  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2146  acetolactate synthase large subunit  44.52 
 
 
562 aa  503  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0019  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.9 
 
 
554 aa  502  1e-141  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.89 
 
 
581 aa  504  1e-141  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.75 
 
 
593 aa  502  1e-141  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2746  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.45 
 
 
566 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  47.06 
 
 
567 aa  505  1e-141  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1070  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.32 
 
 
558 aa  504  1e-141  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0531725  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.52 
 
 
565 aa  499  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1877  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  48.11 
 
 
636 aa  499  1e-140  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000157707 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.73 
 
 
612 aa  501  1e-140  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  47.42 
 
 
622 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1443  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  46.28 
 
 
559 aa  501  1e-140  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0306105  hitchhiker  0.00417959 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.6 
 
 
569 aa  496  1e-139  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  48.59 
 
 
574 aa  497  1e-139  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.86 
 
 
553 aa  496  1e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  46.04 
 
 
577 aa  497  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05291  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  47.61 
 
 
617 aa  496  1e-139  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1921  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.86 
 
 
576 aa  492  9.999999999999999e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.299558 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.81 
 
 
582 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  47.76 
 
 
558 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  46.18 
 
 
587 aa  492  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5448  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.2 
 
 
592 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.404549  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5323  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  43.95 
 
 
591 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.196754  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3617  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  45.8 
 
 
563 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000692831  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0581  acetolactate synthase catalytic subunit  46.53 
 
 
554 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>