22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3413 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0617  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000242002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3413  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000138823  normal  0.329766 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  241  3e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000414361  normal  0.303552 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0623  hypothetical protein  97.39 
 
 		 115 aa  233  6e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3874  hypothetical protein  91.3 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000309341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0577  hypothetical protein  91.3 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00197884  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3748  hypothetical protein  91.3 
 
 		 115 aa  222  1e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0891426  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3691  hypothetical protein  90.43 
 
 		 115 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0272245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0651  hypothetical protein  88.7 
 
 		 115 aa  214  2e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000188562  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3874  hypothetical protein  56.76 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000339506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3005  hypothetical protein  57.69 
 
 		 114 aa  128  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000355724  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0661  hypothetical protein  59.22 
 
 		 109 aa  123  9e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000789332  hitchhiker  0.000026352 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3293  hypothetical protein  47.41 
 
 		 116 aa  110  6e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0196419  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3510  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  102  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134478  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0584  hypothetical protein  50 
 
 		 112 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00300104  normal  0.454317 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  24.74 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0313  membrane protein  34.78 
 
 		 105 aa  44.3  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1912  Propeptide PepSY amd peptidase M4  32.81 
 
 		 106 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1884  peptidase  25 
 
 		 104 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0587  Propeptide PepSY amd peptidase M4  33.87 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5131  hypothetical protein  26.88 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4084  membrane protein  27.54 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.187965 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>