104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3310 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  84.54 
 
 
897 aa  1414    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  96.85 
 
 
889 aa  1631    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  100 
 
 
887 aa  1778    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  52.8 
 
 
865 aa  881    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  97.63 
 
 
887 aa  1679    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  74.49 
 
 
879 aa  1275    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  51.73 
 
 
850 aa  746    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  74.49 
 
 
878 aa  1234    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  75.03 
 
 
889 aa  1296    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3954  hypothetical protein  51.95 
 
 
849 aa  778    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0372326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  54.01 
 
 
845 aa  810    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  74.49 
 
 
889 aa  1279    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  51.55 
 
 
840 aa  794    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  74 
 
 
884 aa  1276    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  42.99 
 
 
836 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  43.32 
 
 
836 aa  619  1e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2956  putative ABC transport system permease protein  43.83 
 
 
872 aa  546  1e-154  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.410151 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  30.36 
 
 
817 aa  310  9e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  28.15 
 
 
817 aa  270  1e-70  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  28.86 
 
 
817 aa  263  8e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  28.8 
 
 
836 aa  260  9e-68  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  31.01 
 
 
825 aa  251  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  29.05 
 
 
820 aa  248  3e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  28.92 
 
 
819 aa  234  4.0000000000000004e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  30.49 
 
 
821 aa  234  6e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  30.77 
 
 
826 aa  225  3e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2172  hypothetical protein  32.3 
 
 
820 aa  223  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.78559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  29.34 
 
 
821 aa  219  1e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0685  hypothetical protein  29.99 
 
 
820 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  29.55 
 
 
821 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  30.37 
 
 
815 aa  208  4e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 
800 aa  208  4e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3734  hypothetical protein  31.39 
 
 
819 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.02 
 
 
850 aa  205  3e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  30.51 
 
 
819 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  28.99 
 
 
793 aa  203  9.999999999999999e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4687  hypothetical protein  30.2 
 
 
821 aa  199  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2641  putative ABC transporter, permease protein  26.77 
 
 
803 aa  193  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  26.49 
 
 
849 aa  193  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3353  predicted permease FtsX  29.13 
 
 
800 aa  191  8e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.381061 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  26.68 
 
 
847 aa  189  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  28.16 
 
 
804 aa  187  9e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6285  ABC transporter membrane spanning protein  29.55 
 
 
802 aa  180  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1579  ABC-type transporter protein  25.36 
 
 
813 aa  170  1e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.15291  normal  0.104036 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  24.01 
 
 
855 aa  169  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  27.15 
 
 
866 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.33 
 
 
870 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  28.35 
 
 
837 aa  146  1e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1541  ABC transporter inner membrane protein  28.79 
 
 
795 aa  141  4.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0192  hypothetical protein  28.64 
 
 
795 aa  139  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0431471  normal  0.319513 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2554  hypothetical protein  32.99 
 
 
819 aa  134  9e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.257329  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01331  hypothetical protein  25.99 
 
 
929 aa  127  7e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  27.91 
 
 
839 aa  124  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  23.77 
 
 
858 aa  122  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  25.43 
 
 
843 aa  118  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.76 
 
 
845 aa  114  9e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3021  hypothetical protein  29.05 
 
 
795 aa  110  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  hitchhiker  0.00599694  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  26.86 
 
 
846 aa  107  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  29.71 
 
 
847 aa  102  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  24.22 
 
 
858 aa  99.4  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  25.14 
 
 
843 aa  98.2  6e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  22.46 
 
 
857 aa  95.9  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  27.41 
 
 
842 aa  89  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  27.16 
 
 
842 aa  88.2  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0310  hypothetical protein  25.79 
 
 
753 aa  87.8  8e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  25.45 
 
 
842 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  26.11 
 
 
841 aa  83.2  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  21.57 
 
 
851 aa  77  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  23.41 
 
 
848 aa  75.5  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  21.57 
 
 
850 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  22.8 
 
 
867 aa  69.3  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  23.38 
 
 
855 aa  69.3  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  20.91 
 
 
855 aa  68.6  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  21.92 
 
 
884 aa  68.6  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  23.34 
 
 
846 aa  65.9  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  23.63 
 
 
844 aa  65.9  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  23.32 
 
 
855 aa  63.5  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 
857 aa  62  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  20.45 
 
 
408 aa  58.5  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  21.94 
 
 
843 aa  58.2  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 
852 aa  57  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  23.4 
 
 
868 aa  55.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1211  protein of unknown function DUF214  31.43 
 
 
787 aa  55.8  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.818892  normal  0.0118338 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  21.93 
 
 
853 aa  54.7  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
849 aa  52.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  26.96 
 
 
849 aa  51.2  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  23.76 
 
 
841 aa  50.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1362  hypothetical protein  21.17 
 
 
1090 aa  50.8  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  21.94 
 
 
877 aa  50.1  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0325  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 
790 aa  50.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98842 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  22.77 
 
 
835 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  22.77 
 
 
835 aa  48.9  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  24.02 
 
 
877 aa  48.9  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  21.11 
 
 
821 aa  48.1  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1478  protein of unknown function DUF214  31.58 
 
 
787 aa  47.8  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1420  protein of unknown function DUF214  27.69 
 
 
788 aa  47  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1997  protein of unknown function DUF214  26.67 
 
 
874 aa  47.8  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.593241 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1574  hypothetical protein  41.43 
 
 
789 aa  46.2  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1206  peptide ABC transporter permease  24.22 
 
 
868 aa  47  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1917  hypothetical protein  30.91 
 
 
787 aa  45.8  0.003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>