101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3193 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1002  hypothetical protein  89.19 
 
 		 770 aa  1418    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0830  hypothetical protein  98.7 
 
 		 769 aa  1558    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.289866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3193  hypothetical protein  100 
 
 		 769 aa  1576    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3289  MORN repeat-containing protein  95.05 
 
 		 770 aa  1509    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.751185  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1061  hypothetical protein  45.03 
 
 		 768 aa  679    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.964132  normal  0.552883 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3383  MORN repeat-containing protein  79.82 
 
 		 770 aa  1301    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2461  MORN repeat-containing protein  54.89 
 
 		 772 aa  856    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000590481 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0960  MORN repeat-containing protein  80.08 
 
 		 770 aa  1300    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0995  MORN repeat-containing protein  79.69 
 
 		 770 aa  1297    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0117  MORN repeat-containing protein  57.69 
 
 		 769 aa  896    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0980  MORN variant repeat protein  79.82 
 
 		 770 aa  1301    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2455  glucosyltransferase-S  24.93 
 
 		 691 aa  179  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.210564 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1911  MORN repeat-containing protein  25.62 
 
 		 530 aa  128  5e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1410  hypothetical protein  28.79 
 
 		 621 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.707149  normal  0.148729 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4110  MORN variant repeat protein  24.64 
 
 		 519 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00525788  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0605  MORN repeat-containing protein  27.76 
 
 		 291 aa  108  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2678  MORN variant repeat protein  29.49 
 
 		 332 aa  102  4e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4808  hypothetical protein  29.22 
 
 		 449 aa  101  7e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0395  hypothetical protein  28.4 
 
 		 454 aa  97.4  9e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.634143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0454  MORN variant repeat protein  22.28 
 
 		 534 aa  89  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.616214  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0081  MORN repeat-containing protein  25.23 
 
 		 829 aa  87.8  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0420783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0077  MORN repeat-containing protein  25.39 
 
 		 829 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0076  hypothetical protein  24.88 
 
 		 828 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0079  MORN repeat-containing protein  25 
 
 		 829 aa  82.4  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2786  hypothetical protein  24.95 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.373413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2965  hypothetical protein  24.95 
 
 		 566 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2246  MORN variant repeat protein  24.49 
 
 		 361 aa  80.5  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000829115  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2869  hypothetical protein  25.05 
 
 		 566 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0062  MORN repeat-containing protein  24.84 
 
 		 818 aa  78.6  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0831  hypothetical protein  25.99 
 
 		 755 aa  78.2  0.0000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2494  hypothetical protein  23.71 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.165064  decreased coverage  0.00000124108 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0803  MORN repeat-containing protein  26.05 
 
 		 757 aa  77.4  0.0000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2013  MORN variant repeat protein  27.4 
 
 		 274 aa  76.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.474909  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3136  hypothetical protein  25.71 
 
 		 755 aa  75.5  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2175  tetratricopeptide repeat protein  28.08 
 
 		 722 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.765622  normal  0.35512 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2227  tetratricopeptide repeat protein  28.08 
 
 		 722 aa  75.1  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.319314  normal  0.381347 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2207  Sel1 domain-containing protein  25.08 
 
 		 720 aa  74.3  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2097  hypothetical protein  24.18 
 
 		 720 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2339  tetratricopeptide repeat protein  27.74 
 
 		 722 aa  73.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000544512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1425  hypothetical protein  24.3 
 
 		 580 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2567  MORN repeat-containing protein  24.47 
 
 		 327 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2399  hypothetical protein  24.64 
 
 		 566 aa  73.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000014686  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3794  hypothetical protein  21.8 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0836  hypothetical protein  24.89 
 
 		 746 aa  72.4  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2107  tetratricopeptide repeat protein  27.4 
 
 		 722 aa  72.4  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00125104  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2247  hypothetical protein  24.78 
 
 		 300 aa  71.6  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00000000530465  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4372  hypothetical protein  29.41 
 
 		 173 aa  71.2  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1949  hypothetical protein  24.2 
 
 		 566 aa  71.2  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0718106  normal  0.307663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2409  hypothetical protein  23.7 
 
 		 566 aa  70.9  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0700458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1725  hypothetical protein  27.78 
 
 		 238 aa  70.9  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2454  hypothetical protein  24.32 
 
 		 197 aa  70.5  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.298933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2161  hypothetical protein  24.46 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3512  hypothetical protein  24.58 
 
 		 838 aa  69.3  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.31816 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4395  hypothetical protein  29.46 
 
 		 175 aa  69.3  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3580  hypothetical protein  24.58 
 
 		 838 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3703  hypothetical protein  24.58 
 
 		 838 aa  68.6  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1068  hypothetical protein  31.65 
 
 		 203 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0500  hypothetical protein  23.25 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.00000000137929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0737  hypothetical protein  24.66 
 
 		 836 aa  67  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4273  MORN repeat-containing protein  23.71 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0076  MORN repeat-containing protein  23.71 
 
 		 816 aa  67.4  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3661  hypothetical protein  31.37 
 
 		 440 aa  67  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0492  MORN repeat-containing protein  25 
 
 		 226 aa  66.6  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.792962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4239  hypothetical protein  25.81 
 
 		 175 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0081  MORN repeat-containing protein  23.66 
 
 		 816 aa  65.1  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2462  MORN repeat-containing protein  22.18 
 
 		 602 aa  64.7  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000572585 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2514  hypothetical protein  23.7 
 
 		 566 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.077322  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0017  hypothetical protein  21.22 
 
 		 424 aa  62.8  0.00000003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33940  hypothetical protein  30.07 
 
 		 178 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000881244  normal  0.151647 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2887  hypothetical protein  31.43 
 
 		 178 aa  62  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0868227  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3416  hypothetical protein  30.41 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.437478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2385  hypothetical protein  26.46 
 
 		 239 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.553353  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5986  hypothetical protein  25.11 
 
 		 240 aa  60.1  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0996  MORN repeat-containing protein  23.34 
 
 		 571 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0141  hypothetical protein  23.93 
 
 		 576 aa  57.4  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0912  hypothetical protein  25.69 
 
 		 580 aa  57.4  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1774  hypothetical protein  29.1 
 
 		 171 aa  56.2  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3192  MORN repeat-containing protein  23.77 
 
 		 577 aa  55.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0981  MORN variant repeat protein  30.86 
 
 		 576 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3382  MORN repeat-containing protein  29.71 
 
 		 576 aa  54.3  0.000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0961  MORN repeat-containing protein  30.86 
 
 		 576 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00975  hypothetical protein  23.11 
 
 		 230 aa  53.9  0.00001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.189504  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0831  MORN repeat-containing protein  23.53 
 
 		 577 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.49093 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3288  MORN repeat-containing protein  24.02 
 
 		 577 aa  53.5  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0732  MORN variant repeat protein  28.26 
 
 		 188 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.011183  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2335  hypothetical protein  31.13 
 
 		 203 aa  52  0.00004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00149774  normal  0.962161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4388  hypothetical protein  28.57 
 
 		 108 aa  51.6  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.748198  normal  0.178906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2020  hypothetical protein  24.39 
 
 		 134 aa  51.2  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0134736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1003  hypothetical protein  24.01 
 
 		 577 aa  51.2  0.00007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1603  PDZ/DHR/GLGF domain protein  23.62 
 
 		 590 aa  50.4  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.150565  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50880  hypothetical protein  31.58 
 
 		 181 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.663848  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0942  hypothetical protein  31.36 
 
 		 351 aa  48.5  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.770907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3410  hypothetical protein  25.15 
 
 		 614 aa  48.5  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5689  hypothetical protein  29.77 
 
 		 357 aa  48.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0343  hypothetical protein  26.27 
 
 		 429 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1600  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 351 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5435  MORN repeat-containing protein  28.4 
 
 		 116 aa  44.7  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.416219  normal  0.0770205 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6134  hypothetical protein  29.59 
 
 		 187 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0281  hypothetical protein  30.21 
 
 		 179 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000641005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0819  MORN repeat-containing protein  30.77 
 
 		 159 aa  44.3  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>