292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3177 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  88.74 
 
 		 510 aa  926    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  80.37 
 
 		 534 aa  875    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  64.19 
 
 		 534 aa  700    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  83.17 
 
 		 565 aa  872    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  82.94 
 
 		 556 aa  869    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3377  cobyric acid synthase  69.63 
 
 		 536 aa  742    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  83.14 
 
 		 560 aa  868    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3731  cobyric acid synthase  66.54 
 
 		 554 aa  704    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.699118  normal  0.182347 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  98.89 
 
 		 541 aa  1099    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  100 
 
 		 541 aa  1110    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0879  cobyric acid synthase  70.15 
 
 		 523 aa  742    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  82.78 
 
 		 526 aa  866    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  97.41 
 
 		 541 aa  1081    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  66.73 
 
 		 502 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4081  cobyric acid synthase  68.59 
 
 		 527 aa  725    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.495861 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  63.56 
 
 		 485 aa  628  1e-179  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  62.05 
 
 		 486 aa  610  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  62.17 
 
 		 486 aa  609  1e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  59.88 
 
 		 490 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  61.45 
 
 		 484 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  59.49 
 
 		 490 aa  601  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  59.88 
 
 		 487 aa  595  1e-169  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  60.36 
 
 		 485 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  60.36 
 
 		 484 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  59.76 
 
 		 495 aa  592  1e-168  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  58.85 
 
 		 484 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3492  cobyric acid synthase  61.57 
 
 		 504 aa  593  1e-168  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  59.96 
 
 		 484 aa  591  1e-167  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  59.56 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  61.68 
 
 		 483 aa  585  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  59.17 
 
 		 484 aa  585  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1005  cobyric acid synthase  60.9 
 
 		 486 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3655  cobyric acid synthase  56.62 
 
 		 536 aa  577  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.676969  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1646  cobyric acid synthase  60.97 
 
 		 488 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00574559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3678  cobyric acid synthase CobQ  56.15 
 
 		 500 aa  573  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0664782  normal  0.329019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5777  cobyric acid synthase  59.17 
 
 		 511 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.259752 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  59.68 
 
 		 501 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  60.24 
 
 		 488 aa  571  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2451  cobyric acid synthase  58.38 
 
 		 504 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0760496  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  59.92 
 
 		 505 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1835  cobyric acid synthase  59.6 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2494  cobyric acid synthase  59.09 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.123831  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2446  cobyric acid synthase  59.6 
 
 		 511 aa  571  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0899233  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2362  cobyric acid synthase  58.64 
 
 		 500 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  57.78 
 
 		 495 aa  570  1e-161  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  56.77 
 
 		 485 aa  566  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  56.89 
 
 		 475 aa  565  1e-160  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  57.73 
 
 		 483 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  58.97 
 
 		 545 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  58.78 
 
 		 535 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  58.58 
 
 		 512 aa  559  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  58.58 
 
 		 523 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  58.58 
 
 		 585 aa  559  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  59.01 
 
 		 520 aa  560  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  58.58 
 
 		 529 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  58.58 
 
 		 531 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  59.08 
 
 		 481 aa  556  1e-157  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1135  cobyric acid synthase CobQ  55.35 
 
 		 534 aa  556  1e-157  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  58.48 
 
 		 495 aa  547  1e-154  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2656  cobyric acid synthase  58.17 
 
 		 498 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.74347  normal  0.607627 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  56.08 
 
 		 485 aa  544  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3730  cobyric acid synthase  56.95 
 
 		 511 aa  538  9.999999999999999e-153  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2304  cobyric acid synthase  56.25 
 
 		 505 aa  537  1e-151  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  54.67 
 
 		 489 aa  535  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2714  cobyric acid synthase  57.53 
 
 		 500 aa  526  1e-148  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.199651  normal  0.573522 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  53.92 
 
 		 500 aa  523  1e-147  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2812  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  54.67 
 
 		 510 aa  518  1.0000000000000001e-145  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.632391  normal  0.768305 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1907  cobyric acid synthase CobQ  47.28 
 
 		 483 aa  409  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0796  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2453  cobyric acid synthase  46.37 
 
 		 481 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.094745 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  43.5 
 
 		 787 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2937  cobyric acid synthase  45.03 
 
 		 481 aa  402  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0505975  hitchhiker  0.00124265 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3381  cobyric acid synthase  44.96 
 
 		 496 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  42.88 
 
 		 777 aa  402  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2617  cobyric acid synthase  45.96 
 
 		 486 aa  397  1e-109  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3605  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 772 aa  398  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  42.68 
 
 		 776 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4734  cobyric acid synthase  43.61 
 
 		 485 aa  392  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0485  cobyric acid synthase CobQ:precorrin-3B C17-methyltransferase region  43.88 
 
 		 797 aa  392  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  45.9 
 
 		 494 aa  394  1e-108  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1269  cobyric acid synthase  41.17 
 
 		 493 aa  389  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  41.06 
 
 		 513 aa  390  1e-107  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1117  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 505 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 506 aa  385  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.36 
 
 		 503 aa  386  1e-106  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.8 
 
 		 506 aa  389  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3745  cobyric acid synthase  46.73 
 
 		 493 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0646477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.03 
 
 		 515 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 506 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  43.1 
 
 		 507 aa  384  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0384  cobyric acid synthase  46.06 
 
 		 481 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.541429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2381  cobyric acid synthase  41.97 
 
 		 488 aa  384  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.62958  decreased coverage  0.00269559 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  42.42 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1140  cobyric acid synthase  41.71 
 
 		 511 aa  384  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.13784 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  42.61 
 
 		 501 aa  385  1e-105  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 513 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  41.15 
 
 		 507 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1656  cobyric acid synthase CobQ  43.44 
 
 		 492 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.422917  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2137  cobyric acid synthase  42.75 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281937  normal  0.137961 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3713  cobyric acid synthase CobQ  46.95 
 
 		 477 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.202059 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>